Applicazione del sequenziamento adattivo dei nanopori
6 agosto 2024 aggiornato da: Shenzhen Third People's Hospital
Applicazione del metodo di sequenziamento adattivo dei nanopori di Oxford nell'infezione post trapianto di fegato
L’infezione post-trapianto di fegato è un fattore importante nella morte dei pazienti.
Il metodo tradizionale per diagnosticare l’infezione post trapianto di fegato sono gli esami di laboratorio.
Ma la sensibilità e la specificità degli esami del sangue sono scarse.
Il sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha un tasso di rilevamento maggiore per il micobatterio tubercolare, gli anaerobi e i funghi e una maggiore sensibilità rispetto agli esami del sangue.
Tuttavia l'uso di NGS è limitato a causa della breve lunghezza di lettura.
Il metodo di sequenziamento adattivo dei nanopori (NAS) di Oxford rappresenta la terza rivoluzione nella tecnologia di sequenziamento.
Per ogni 1 Gbp di dati, il sequenziamento NAS ha rilevato 45 volte più sequenze di microbioma rispetto al sequenziamento standard Nanopore e 2,5 volte più del sequenziamento Illumina.
Lo scopo di questo studio è confrontare il NAS con l'NGS e i test di laboratorio per il tasso diagnostico dell'infezione post trapianto di fegato.
Panoramica dello studio
Stato
Non ancora reclutamento
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Sulla base del lavoro precedente, i ricercatori hanno scoperto che: 1. Il NAS ha una maggiore efficienza di arricchimento microbico e può rilevare informazioni patogene più rapidamente rispetto al sequenziamento normale dei nanopori (NNS); 2. Il NAS può rilevare frammenti di agenti patogeni più specifici con sequenziamento a breve termine; 3. I NAS possono coprire più genomi patogeni rispetto agli NNS in breve tempo; 4. Il NAS è in grado di rilevare informazioni sulla resistenza agli antibiotici di batteri patogeni nei campioni clinici.
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Stimato)
100
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Contatto studio
- Nome: pusen Wang, Dr
- Numero di telefono: 18621006138
- Email: pusenwang@sjtu.edu.cn
Luoghi di studio
-
-
Guangdong
-
Shenzhen, Guangdong, Cina
- Shenzhen Third People's Hospital
-
Contatto:
- Lin Zhong, Dr
- Numero di telefono: 13917603139
- Email: zhonglin1@medmail.com.cn
-
-
Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
No
Metodo di campionamento
Campione di probabilità
Popolazione di studio
I partecipanti verranno reclutati in modo casuale e se violano il protocollo o si verificano eventi avversi clinici, gli investigatori chiederanno loro di ritirarsi da questo studio.
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Accetta il trapianto di fegato
- Firma volontaria del consenso informato
- Possedere la capacità di comprendere informazioni materiali
- Partecipare a questo studio volontariamente
Criteri di esclusione:
- Partecipato ad un altro studio
- Perdita dell'innesto
- Hanno subito un trapianto multiorgano o hanno avuto un precedente trapianto di organi
- Il paziente è morto
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
|
Gruppo NAS
In questo gruppo, i ricercatori rileveranno il numero di agenti patogeni nel liquido di lavaggio alveolare, nel sangue e nel drenaggio peritoneale utilizzando il NAS.
|
Utilizzo di tre diversi metodi di rilevamento e confronto della loro efficienza
|
|
Gruppo NGS
In questo gruppo, i ricercatori rileveranno il numero di agenti patogeni nel liquido di lavaggio alveolare, nel sangue e nel drenaggio peritoneale utilizzando NGS.
|
Utilizzo di tre diversi metodi di rilevamento e confronto della loro efficienza
|
|
Gruppo Prove di Laboratorio
In questo gruppo, i ricercatori rileveranno il numero di agenti patogeni nel liquido di lavaggio alveolare, nel sangue e nel drenaggio peritoneale utilizzando test di laboratorio.
|
Utilizzo di tre diversi metodi di rilevamento e confronto della loro efficienza
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Infezione diagnosticata dopo il trapianto di fegato
Lasso di tempo: Post trapianto di fegato prima della dimissione del paziente dall'ospedale, in media 1 mese.
|
Eventuali agenti patogeni vengono rilevati nel liquido di lavaggio alveolare, nel drenaggio peritoneale o nel sangue prima della dimissione del paziente dall'ospedale, in media 1 mese
|
Post trapianto di fegato prima della dimissione del paziente dall'ospedale, in media 1 mese.
|
Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Sponsor
Investigatori
- Investigatore principale: Lin Zhong, Dr, Shenzhen Third People's Hospital
Pubblicazioni e link utili
La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.
Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio (Stimato)
1 ottobre 2024
Completamento primario (Stimato)
1 agosto 2026
Completamento dello studio (Stimato)
30 ottobre 2026
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
27 giugno 2024
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
6 agosto 2024
Primo Inserito (Effettivo)
7 agosto 2024
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
7 agosto 2024
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
6 agosto 2024
Ultimo verificato
1 giugno 2024
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- SZSY001
- 2022YFC2304700 (Altro numero di sovvenzione/finanziamento: Ministry of Science and Technology)
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
NO
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .