Zastosowanie sekwencjonowania adaptacyjnego nanoporów
6 sierpnia 2024 zaktualizowane przez: Shenzhen Third People's Hospital
Zastosowanie metody sekwencjonowania adaptacyjnego Oxford Nanopore w infekcji po przeszczepieniu wątroby
Zakażenie po przeszczepieniu wątroby jest ważnym czynnikiem powodującym śmierć pacjentów.
Tradycyjną metodą diagnozowania infekcji po przeszczepieniu wątroby są badania laboratoryjne.
Jednak czułość i swoistość badań krwi jest niska.
Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) charakteryzuje się większą wykrywalnością prątków gruźlicy, bakterii beztlenowych i grzybów oraz większą czułością w porównaniu z badaniami krwi.
Jednak użycie NGS jest ograniczone ze względu na krótki czas odczytu.
Metoda oksfordzkiego sekwencjonowania adaptacyjnego nanoporów (NAS) to trzecia rewolucja w technologii sekwencjonowania.
Na każdy 1 Gbp danych sekwencjonowanie NAS wykryło 45 razy więcej sekwencji mikrobiomów niż standardowe sekwencjonowanie Nanopore i 2,5 razy więcej niż sekwencjonowanie Illumina.
Celem tego badania jest porównanie NAS z NGS i badań laboratoryjnych pod kątem diagnostycznego wskaźnika infekcji po przeszczepieniu wątroby.
Przegląd badań
Status
Jeszcze nie rekrutacja
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Na podstawie wcześniejszych prac badacze odkryli, że: 1. NAS charakteryzuje się wyższą wydajnością wzbogacania mikrobiologicznego i może szybciej wykrywać informacje o patogenach w porównaniu z normalnym sekwencjonowaniem nanoporów (NNS); 2. NAS może wykryć bardziej specyficzne fragmenty patogenu w krótkim czasie sekwencjonowania; 3. NAS może w krótkim czasie objąć większą liczbę patogennych genomów niż NNS; 4. NAS może wykryć informacje o oporności na antybiotyki bakterii chorobotwórczych w próbkach klinicznych.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Szacowany)
100
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: pusen Wang, Dr
- Numer telefonu: 18621006138
- E-mail: pusenwang@sjtu.edu.cn
Lokalizacje studiów
-
-
Guangdong
-
Shenzhen, Guangdong, Chiny
- Shenzhen Third People's Hospital
-
Kontakt:
- Lin Zhong, Dr
- Numer telefonu: 13917603139
- E-mail: zhonglin1@medmail.com.cn
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Metoda próbkowania
Próbka prawdopodobieństwa
Badana populacja
Uczestnicy będą rekrutowani losowo i jeśli naruszą protokół lub wystąpią kliniczne zdarzenia niepożądane, badacze poproszą ich o wycofanie się z badania.
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Zaakceptuj przeszczep wątroby
- Podpisanie świadomej zgody dobrowolnie
- Posiadanie umiejętności rozumienia informacji materialnych
- Udział w tym badaniu jest dobrowolny
Kryteria wyłączenia:
- Wziął udział w innym badaniu
- Utrata przeszczepu
- Przeszedłeś przeszczep wielonarządowy lub miałeś już przeszczepiony narząd
- Pacjent zmarł
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Grupa NAS
W tej grupie badacze za pomocą NAS będą wykrywać liczbę patogenów w płynie z popłuczyn pęcherzykowych, krwi i drenażu otrzewnej.
|
Zastosowanie trzech różnych metod detekcji i porównanie ich skuteczności
|
|
Grupa NGS
W tej grupie badacze za pomocą NGS będą wykrywać liczbę patogenów w płynie z popłuczyn pęcherzykowych, krwi i drenażu otrzewnej.
|
Zastosowanie trzech różnych metod detekcji i porównanie ich skuteczności
|
|
Grupa Testów Laboratoryjnych
W tej grupie badacze za pomocą badań laboratoryjnych będą wykrywać liczbę patogenów w płynie z popłuczyn pęcherzykowych, krwi i drenażu otrzewnej.
|
Zastosowanie trzech różnych metod detekcji i porównanie ich skuteczności
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Zdiagnozowana infekcja po przeszczepieniu wątroby
Ramy czasowe: Po przeszczepieniu wątroby przed wypisem pacjentów ze szpitala, średnio 1 miesiąc.
|
Wszelkie patogeny są wykrywane w płynie z płukania pęcherzyków płucnych, drenażu otrzewnej lub krwi przed wypisem pacjenta ze szpitala, średnio po 1 miesiącu
|
Po przeszczepieniu wątroby przed wypisem pacjentów ze szpitala, średnio 1 miesiąc.
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Lin Zhong, Dr, Shenzhen Third People's Hospital
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Szacowany)
1 października 2024
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
1 sierpnia 2026
Ukończenie studiów (Szacowany)
30 października 2026
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
27 czerwca 2024
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
6 sierpnia 2024
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
7 sierpnia 2024
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
7 sierpnia 2024
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
6 sierpnia 2024
Ostatnia weryfikacja
1 czerwca 2024
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- SZSY001
- 2022YFC2304700 (Inny numer grantu/finansowania: Ministry of Science and Technology)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIE
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .