Aplikace adaptivního sekvenování Nanopore
6. srpna 2024 aktualizováno: Shenzhen Third People's Hospital
Aplikace metody Oxford Nanopore Adaptive Sequencing Method při infekci po transplantaci jater
Infekce po transplantaci jater je důležitým faktorem úmrtí pacientů.
Tradiční metodou diagnostiky infekce po transplantaci jater jsou laboratorní testy.
Ale citlivost a specificita krevních testů je špatná.
Sekvenování nové generace (NGS) má vyšší míru detekce pro mycobacterium tuberculosis, anaeroby a houby a vyšší citlivost ve srovnání s krevními testy.
Použití NGS je však omezené kvůli krátké délce čtení.
Oxfordská metoda adaptivního sekvenování nanoporů (NAS) je třetí revolucí v technologii sekvenování.
Na každý 1 Gbp dat sekvenování NAS detekovalo 45krát více sekvencí mikrobiomu než standardní sekvenování Nanopore a 2,5krát více než sekvenování Illumina.
Účelem této studie je porovnat NAS s NGS a laboratorními testy na diagnostickou míru infekce po transplantaci jater.
Přehled studie
Postavení
Zatím nenabíráme
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Na základě předchozí práce výzkumníci zjistili, že: 1. NAS má vyšší účinnost mikrobiálního obohacení a dokáže detekovat patogenní informace rychleji ve srovnání s normálním sekvenováním nanopórů (NNS); 2. NAS dokáže detekovat specifičtější fragmenty patogenu pomocí krátkodobého sekvenování; 3. NAS může v krátké době pokrýt více patogenních genomů než NNS; 4. NAS dokáže detekovat informace o antibiotické rezistenci patogenních bakterií v klinických vzorcích.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Odhadovaný)
100
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní kontakt
- Jméno: pusen Wang, Dr
- Telefonní číslo: 18621006138
- E-mail: pusenwang@sjtu.edu.cn
Studijní místa
-
-
Guangdong
-
Shenzhen, Guangdong, Čína
- Shenzhen Third People's Hospital
-
Kontakt:
- Lin Zhong, Dr
- Telefonní číslo: 13917603139
- E-mail: zhonglin1@medmail.com.cn
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Metoda odběru vzorků
Ukázka pravděpodobnosti
Studijní populace
Účastníci budou vybráni náhodně a pokud poruší protokol nebo dojde ke klinickým nežádoucím příhodám, výzkumníci je požádají, aby z této studie odstoupili.
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Přijměte transplantaci jater
- Dobrovolné podepsání informovaného souhlasu
- Mít schopnost porozumět materiálním informacím
- Účast na této studii dobrovolně
Kritéria vyloučení:
- Účastnil se další studie
- Ztráta štěpu
- Podstoupili transplantaci více orgánů nebo jste podstoupili předchozí transplantaci orgánů
- Pacient zemřel
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Skupina NAS
V této skupině budou vyšetřovatelé detekovat počet patogenů v alveolární lavážní tekutině, krvi a peritoneální drenáži pomocí NAS.
|
Použití tří různých metod detekce a porovnání jejich účinnosti
|
|
Skupina NGS
V této skupině budou vyšetřovatelé detekovat počet patogenů v alveolární lavážní tekutině, krvi a peritoneální drenáži pomocí NGS.
|
Použití tří různých metod detekce a porovnání jejich účinnosti
|
|
Skupina laboratorních testů
V této skupině budou vyšetřovatelé pomocí laboratorních testů detekovat počet patogenů v alveolární lavážní tekutině, krvi a peritoneální drenáži.
|
Použití tří různých metod detekce a porovnání jejich účinnosti
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Diagnostikovaná infekce po transplantaci jater
Časové okno: Po transplantaci jater před propuštěním pacientů z nemocnice, v průměru 1 měsíc.
|
Jakékoli patogeny jsou detekovány v alveolární lavážní tekutině, peritoneální drenáži nebo krvi před propuštěním pacienta z nemocnice, v průměru 1 měsíc
|
Po transplantaci jater před propuštěním pacientů z nemocnice, v průměru 1 měsíc.
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Lin Zhong, Dr, Shenzhen Third People's Hospital
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Odhadovaný)
1. října 2024
Primární dokončení (Odhadovaný)
1. srpna 2026
Dokončení studie (Odhadovaný)
30. října 2026
Termíny zápisu do studia
První předloženo
27. června 2024
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
6. srpna 2024
První zveřejněno (Aktuální)
7. srpna 2024
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
7. srpna 2024
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
6. srpna 2024
Naposledy ověřeno
1. června 2024
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- SZSY001
- 2022YFC2304700 (Jiné číslo grantu/financování: Ministry of Science and Technology)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NE
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .