운동선수의 EBC에서의 소형 RNA 프로파일링 (AirBiopsy)
최대 운동에 의한 호기 중 콘덴세이트에서의 차세대 염기서열 분석을 통한 소형 RNA 프로파일링의 가능성 및 변형: 파일럿 연구
배경: 호기 가스 응축물(EBC)은 휘발성 및 비휘발성 화합물, 소형 RNA를 포함하는 비침습적으로 수집된 생체액입니다. EBC의 소형 RNA 프로파일링은 폐 질환에 대한 최소 침습적 바이오마커를 식별하고 개발하기 위한 유망한 접근법으로 보이지만, 방법론적 증거는 여전히 제한적이고 이질적입니다.
목적: EBC로부터 소형 RNA 추출 및 차세대 염기서열 분석(NGS)의 기술적 실현 가능성을 평가하고, 동적 생리학적 변화를 위한 모델 매트릭스로 EBC를 사용하여 휴식 시 및 최대 운동 후 소형 RNA 프로파일을 특성화합니다.
방법: 비아위스토크 의과대학(B.SUB.25.512 및 B.SUB.25.529)의 법정 연구의 일부로 수행된 파일럿 연구에서, 우리는 RTube 장치로 수집된 22개의 EBC 샘플을 분석했습니다. 이 샘플은 11명의 건강한 지원자와 3명의 폐암 및 동반된 COPD(GOLD 3-4) 환자로부터 휴식 시 및 심폐 운동 검사(CPET)로 확인된 표준화된 최대 운동 후에 수집되었습니다. 총 RNA는 상업용 고처리량 RNA 분리 키트, miRNeasy Serum/Plasma Advanced Kit(Qiagen)를 사용하여 추출되었으며, 이 키트는 낮은 핵산 함량을 가진 생물학적 샘플을 위해 설계되었고 제조사의 프로토콜에 수정을 가하여 사용되었습니다. 소형 RNA 라이브러리는 고감도, 낮은 입력의 TrueQuant Small RNA-Seq Library Preparation Kit(GenXPro GmbH)를 사용하여 고유 분자 식별자(UMI)와 함께 생성되었으며 Illumina 플랫폼에서 염기서열 분석되었습니다. 리드는 Cutadapt와 FastQC로 처리되었으며, Bowtie2를 사용하여 hg38(Homo sapiens) 참조 유전체에 반복적으로 매핑되었고, miRNA(miRBase), tRNA(GtRNAdb), piRNA(piRNAdb), ncRNA(ENSEMBL), cDNA(ENSEMBL)를 포함한 RNA 데이터베이스 배열에 정렬되었으며 HTSeq로 정량화되었습니다. 차등 발현 분석(DEA) 및 주성분 분석(PCA)은 DESeq2로 수행되었습니다.
연구 개요
상태
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Podlaskie Voivodeship
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Bialystok, Podlaskie Voivodeship, 폴란드, 15-540
- Department of Respiratory Physiopathology, Medical University of Bialystok
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- CPET 수행 능력
- 폐활량 측정 수행 능력
제외 기준:
- 정보에 입각한 동의서 부재
- CPET 또는 폐활량 측정에 대한 절대적 금기 사항
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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호기 응축물 기증자
EBC 기증자 중 운동선수 (22명) 및 폐암 환자 (3명)
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
기간 |
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smallRNA 프로파일
기간: 2025년 8월부터 2025년 12월까지
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2025년 8월부터 2025년 12월까지
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EBC 수집
기간: 2025년 1월부터 2025년 8월까지
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2025년 1월부터 2025년 8월까지
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공동 작업자 및 조사자
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
기타 연구 ID 번호
- APK.002.584.2024
- B.SUB.25.512 (기타 식별자: Medical University of Bialystok)
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
IPD 계획 설명
IPD 공유 기간
IPD 공유 액세스 기준
IPD 공유 지원 정보 유형
- 연구_프로토콜
- 수액
- ICF
- CSR
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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