Identification of Protein Markers of Epidemiological and Clinical Interest by MALDI-TOF (SPECTRASURV)
Not all infectious agents have the same epidemic potential, and this can vary widely within the same species. Rapid determination of this potential is essential to optimize control of infectious diseases. It is now accepted that identification with the species is clearly insufficient to identify an epidemic and to carry out epidemiological analyzes. Indeed, if the same bacterial species can present a great diversity of strains, it is organized in clonal complexes having strong variations of clinical and epidemiological expression.
More specifically, on a bio-epidemiological level, the clonal identification of the bacterial agent is a real asset because it can make it possible to identify the highly virulent strains or known to be resistant, the clones associated with nosocomial infections, the source of the infection. an epidemic and to follow its spatio-temporal extension, to know the epidemiological antiquity of the clone, to follow or rebuild a chain of transmission, to discover epidemic clusters.
There are rapid identification techniques, for example by polymerase chain reaction (PCR), but which are targeted at particular genomic compositions previously identified.
Routine bacterial identification now rests on the determination of the protein composition by mass spectrometry (MALDI-TOF). The bacterial spectrum is compared to a reference library of protein composition, thus obtaining an identification equivalent to that based on the 16s RNA (ribonucleic acid 16s) and can descend to an infra-species level.
The aim of this work is to use the proteome part of the MALDI-TOF spectrum to identify peaks that signal clonality and to determine proteomic fingerprintings that can be used for epidemiological and clinical purposes.
Instead of relying on expensive genomic methods, the identification of the clonal characteristics of the strains will rely on the bacterial proteome present on the MALDI-TOF spectrum that is produced during the routine identification of the bacterium.
The results are intended to feed a complementary knowledge base
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Zapisy (Oczekiwany)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Marseille, Francja, 13354
- Rekrutacyjny
- Assistance Publique Hopitaux de Marseille
-
Kontakt:
- Hervé CHAUDET, PH
- Numer telefonu: +33 413732001
- E-mail: herve.chaudet@gmail.com
-
Główny śledczy:
- Hervé CHAUDET, PH
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Inclusion Criteria:
- bacterial identification by Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time of Flight (MALDI-TOF)
Exclusion Criteria:
- Unidentified strain or noisy spectrum
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Bacterial identification
Describe the MALDI-TOF spectrum to identify peaks that may be associated with epidemiological and clinical characteristics of bacterial strains
|
The determination of the protein composition of the bacterial spectrum
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Ability to find protein peaks that mark epidemic clones
Ramy czasowe: 36 months
|
Ability to find protein peaks that mark epidemic clones Association of these clones with epidemic characteristics (age, antibacterial resistance, virulence)
|
36 months
|
Współpracownicy i badacze
Publikacje i pomocne linki
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2017-16
- TPS 15219ter (Identyfikator rejestru: INDS number)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na mass spectrometry (MALDI-TOF)
-
Vanderbilt-Ingram Cancer CenterNational Cancer Institute (NCI)Zakończony
-
Fudan UniversityZakończonyNowotwory jelita grubegoChiny
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterNYU Langone Health; National Institutes of Health (NIH); Weill Medical College... i inni współpracownicyZakończonyRak prostaty | Podwyższony antygen specyficzny dla prostaty (PSA)Stany Zjednoczone
-
Shenzhen Second People's HospitalJeszcze nie rekrutacjaBezpłodność, kobieta
-
University Hospital, Basel, SwitzerlandZakończony
-
Hospital Universitario Dr. Jose E. GonzalezRekrutacyjny
-
National Cancer Institute (NCI)ZakończonyOstra białaczka szpikowa u dorosłych z nieprawidłowościami 11q23 (MLL). | Ostra białaczka szpikowa u dorosłych z Del(5q) | Ostra białaczka szpikowa u dorosłych z Inv(16)(p13;q22) | Ostra białaczka szpikowa u dorosłych z t(16;16)(p13;q22) | Ostra białaczka szpikowa u dorosłych z t(8;21)(q22;q22) | Wtórna ostra białaczka szpikowa i inne warunkiStany Zjednoczone
-
City of Hope Medical CenterZakończonyPrzerzuty do wątroby | Rak okrężnicy w stadium IV | Rak odbytnicy IV stopnia | Nawracający rak jelita grubego | Nawracający rak odbytnicyStany Zjednoczone