- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT03626987
Identification of Protein Markers of Epidemiological and Clinical Interest by MALDI-TOF (SPECTRASURV)
Not all infectious agents have the same epidemic potential, and this can vary widely within the same species. Rapid determination of this potential is essential to optimize control of infectious diseases. It is now accepted that identification with the species is clearly insufficient to identify an epidemic and to carry out epidemiological analyzes. Indeed, if the same bacterial species can present a great diversity of strains, it is organized in clonal complexes having strong variations of clinical and epidemiological expression.
More specifically, on a bio-epidemiological level, the clonal identification of the bacterial agent is a real asset because it can make it possible to identify the highly virulent strains or known to be resistant, the clones associated with nosocomial infections, the source of the infection. an epidemic and to follow its spatio-temporal extension, to know the epidemiological antiquity of the clone, to follow or rebuild a chain of transmission, to discover epidemic clusters.
There are rapid identification techniques, for example by polymerase chain reaction (PCR), but which are targeted at particular genomic compositions previously identified.
Routine bacterial identification now rests on the determination of the protein composition by mass spectrometry (MALDI-TOF). The bacterial spectrum is compared to a reference library of protein composition, thus obtaining an identification equivalent to that based on the 16s RNA (ribonucleic acid 16s) and can descend to an infra-species level.
The aim of this work is to use the proteome part of the MALDI-TOF spectrum to identify peaks that signal clonality and to determine proteomic fingerprintings that can be used for epidemiological and clinical purposes.
Instead of relying on expensive genomic methods, the identification of the clonal characteristics of the strains will rely on the bacterial proteome present on the MALDI-TOF spectrum that is produced during the routine identification of the bacterium.
The results are intended to feed a complementary knowledge base
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
-
Marseille, Francia, 13354
- Reclutamento
- Assistance Publique Hopitaux de Marseille
-
Contatto:
- Hervé CHAUDET, PH
- Numero di telefono: +33 413732001
- Email: herve.chaudet@gmail.com
-
Investigatore principale:
- Hervé CHAUDET, PH
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Inclusion Criteria:
- bacterial identification by Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time of Flight (MALDI-TOF)
Exclusion Criteria:
- Unidentified strain or noisy spectrum
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
---|---|
Bacterial identification
Describe the MALDI-TOF spectrum to identify peaks that may be associated with epidemiological and clinical characteristics of bacterial strains
|
The determination of the protein composition of the bacterial spectrum
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
---|---|---|
Ability to find protein peaks that mark epidemic clones
Lasso di tempo: 36 months
|
Ability to find protein peaks that mark epidemic clones Association of these clones with epidemic characteristics (age, antibacterial resistance, virulence)
|
36 months
|
Collaboratori e investigatori
Pubblicazioni e link utili
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Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Anticipato)
Completamento dello studio (Anticipato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 2017-16
- TPS 15219ter (Identificatore di registro: INDS number)
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
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Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
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