Breast Duct: Pilotní studie genomového sekvenování exfoliovaných duktálních buněk získaných endoskopií a výplachem

Přes nedostatek anatomické jasnosti v literatuře Tibor Tot předpokládal, že karcinom prsu a DCIS jsou lobární onemocnění, protože současně nebo asynchronně se objevující, často mnohočetná in situ nádorová ložiska jsou lokalizována v jediném „nemocném“ laloku. Tato teorie má určitou rezonanci v molekulárních studiích, které byly provedeny v prsu, což ukazuje, že existují velké "záplaty" klonality dokonce i v normální prsní tkáni. Většina této práce však byla založena na mikrodisekci a předpokládá, že sousední profily kanálků patří do stejného laloku. Ve skutečnosti jak Cooper, tak Going ukázaly propletení arborizačních kanálů z různých nezávislých laloků. To připravuje půdu pro chyby v interpretaci v mikro-preparované tkáni.

Duktální laváž umožňuje kanylaci a laváž jednotlivých duktů a odběr 1 000 až 10 000 exfoliovaných buněk, které lze studovat na molekulární a genetické změny. Duktoskopie přidává možnost potvrdit, že kanálek ​​nebyl perforován, a kartáčovat výstelku potrubí, aby se zvýšil výtěžek buněk. K potvrzení duktální anatomie lze použít ultrazvuk v reálném čase. Díky kombinaci těchto minimálně invazivních technik je nyní možné shromáždit buňky potřebné k aplikaci nových genetických technik a prozkoumat genom duktální epiteliální buňky.

Zatímco metody pro získání duktálních epiteliálních buněk byly vyvíjeny, podobný pokrok byl učiněn v technologii sekvenování celého genomu. Knome®, zisková společnost, je nyní schopna analyzovat duktální buňky proti krvi k identifikaci variant, včetně jednonukleotidových polymorfismů (SNP), krátkých a dlouhých inzercí a delecí (indely), inverzí, translokací, fúzních genů a variací počtu kopií. (CNV). Analýza cesty vynalézavosti může identifikovat sítě mRNA, které mohou řídit předrakovinnou hyperplazii. Covance Genomics Laboratory (CAL) bude provádět extrakci DNA a RNA, QC DNA a sekvenování nové generace na platformě Illumina.

Kombinací těchto minimálně invazivních technik a sekvenování nové generace budeme schopni otestovat naši hypotézu, že je nyní možné zkoumat genetickou sekvenci jednoho normálního vývodu a porovnat ji se sekvencí v krvi, abychom identifikovali časné epiteliální mutace. Navíc porovnáním sekvence dvou vývodů v jednom prsu můžeme získat náhled na to, zda je každý vývod klonální nebo zda celý prs sdílí stejný genetický vzorec. A konečně pochopení cest, které jsou aktivovány v prekancerózních lézích kanálků, může poskytnout cíle pro programy intraduktální léčby.