The Breast Duct: Pilotstudie av genomisk sekvensering av eksfolierede duktale celler oppnådd gjennom endoskopi og lavage

Til tross for mangelen på anatomisk klarhet i litteraturen, har Tibor Tot postulert at brystkreft og DCIS er en lobar sykdom ettersom de samtidig eller asynkront opptredende, ofte flere in situ tumorfoci er lokalisert innenfor en enkelt "syk" lapp. Denne teorien har en viss resonans i de molekylære studiene som er gjort i brystet som viser at det er store "flekker" av klonalitet selv i normalt brystvev. Mesteparten av dette arbeidet var imidlertid basert på mikrodisseksjon, og antar at tilstøtende kanalprofiler tilhører samme lapp. Faktisk har både Cooper og Going vist sammenveving av arboriseringskanaler fra forskjellige uavhengige lober. Dette legger grunnlaget for tolkningsfeil i mikrodissekert vev.

Duktal lavage tillater kanylering og skylling av individuelle kanaler og samling av 1000 - over 10 000 eksfolierede celler som kan studeres for molekylære og genetiske endringer. Duktoskopi legger til muligheten til å bekrefte at kanalen ikke har blitt perforert og å børste slimhinnen i kanalen for å øke celleutbyttet. Sanntidsultralyd kan brukes til å bekrefte den duktale anatomien. Med kombinasjonen av disse minimalt invasive teknikkene er det nå mulig å samle cellene som trengs for å anvende nye genetiske teknikker og undersøke genomet til den ductale epitelcellen.

Mens metodene for å oppnå de duktale epitelcellene har blitt utviklet, har lignende fremskritt blitt gjort innen helgenomsekvenseringsteknologi. Knome®, et profittselskap, er nå i stand til å analysere ductale celler mot blod for å identifisere varianter, inkludert enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP), korte og lange innsettinger og slettinger (indeler), inversjoner, translokasjoner, fusjonsgener og kopiantallvariasjoner (CNV). Oppfinnsomhet Pathway Analysis kan identifisere mRNA-nettverk som kan drive pre-kreft hyperplasi. Covance Genomics Laboratory (CAL) vil utføre DNA- og RNA-ekstraksjon, DNA QC og Next-Generation Sequencing på Illumina-plattformen.

Med kombinasjonen av disse minimalt invasive teknikkene og neste generasjons sekvensering vil vi være i stand til å teste hypotesen vår om at det nå er mulig å undersøke den genetiske sekvensen til en enkelt normal kanal og sammenligne den med sekvensen i blodet for å identifisere tidlig epitel. mutasjoner. I tillegg ved å sammenligne sekvensen av to kanaler i ett bryst kan vi få innsikt i om hver kanal er klonal eller om hele brystet deler det samme genetiske mønsteret. Og til slutt, forståelse av banene som aktiveres i pre-cancerøse kanallesjoner kan gi mål for intraduktale behandlingsprogrammer.