乳管: 内視鏡検査と洗浄によって得られた剥離した乳管細胞のゲノム配列決定に関するパイロット研究
この研究の目的は、全ゲノム配列決定のために剥離した管上皮細胞にアクセスするために低侵襲技術を使用できるかどうかを判断することです。
- 乳頭吸引、乳管鏡検査、乳管洗浄を行って女性を検査し、女性 1 人あたり 2 本の乳管から剥離した細胞を収集します。
- 女性のベースラインゲノム配列を取得するために、検査時に血液サンプルを収集します。
- その後、匿名化されたサンプルから DNA と RNA が抽出され、コーヴァンスとイルミナによって全ゲノム配列決定とトランスクリプトーム分析が行われます。
- 比較は、乳房 (2 つの乳管) 内、乳管と血液の間、および女性間で行われます。
調査の概要
詳細な説明
文献における解剖学的明確さの欠如にもかかわらず、Tibor Tot は、乳がんと DCIS は同時または非同期的に出現する、多くの場合、複数の in situ 腫瘍病巣が単一の「病気の」葉内に局在するため、大脳葉疾患であると仮定しています。 この理論は、正常な乳房組織にもクローン性の大きな「斑点」が存在することを実証する乳房で行われた分子研究とある程度共鳴します。 ただし、この研究のほとんどは顕微解剖に基づいており、隣接する管のプロファイルが同じ葉に属していると仮定しています。 実際、クーパーとゴーイングの両方が、異なる独立した葉からの樹枝状管の絡み合いを示しました。 これは、顕微解剖された組織における解釈の誤りの準備となります。
管洗浄では、個々の管にカニューレを挿入して洗浄し、1,000 ~ 10,000 個を超える剥離細胞を収集して、分子的および遺伝的変化を研究することができます。 乳管鏡検査では、乳管に穴があいていないことを確認し、乳管の内層をブラッシングして細胞収量を増加させる機能が追加されます。 リアルタイム超音波を使用して、管の解剖学的構造を確認できます。 これらの低侵襲技術を組み合わせることで、新しい遺伝子技術を適用し、管上皮細胞のゲノムを調査するために必要な細胞を収集することが可能になりました。
管上皮細胞を取得する方法が開発されている一方で、全ゲノム配列決定技術でも同様の進歩が見られます。 営利企業である Knome® は、血液に対する管細胞を分析して、一塩基多型 (SNP)、短鎖および長鎖の挿入および欠失 (インデル)、逆位、転座、融合遺伝子、コピー数の変異などの変異を特定できるようになりました。 (CNV)。 Ingenuity Pathway Analysis により、前がん性過形成を引き起こしている可能性のある mRNA ネットワークを特定できます。 コーヴァンス ゲノミクス ラボラトリー (CAL) は、イルミナ プラットフォーム上で DNA および RNA 抽出、DNA QC、次世代シーケンシングを実行します。
これらの低侵襲技術と次世代シーケンシングを組み合わせることで、単一の正常な管の遺伝子配列を調査し、それを血液中の配列と比較して初期上皮を特定することが可能になったという仮説を検証できるようになります。突然変異。 さらに、1 つの乳房にある 2 つの乳管の配列を比較することで、各乳管がクローン性であるか、乳房全体が同じ遺伝パターンを共有しているかについての洞察を得ることができます。 そして最後に、前がん性管病変で活性化される経路を理解することで、管内治療プログラムのターゲットを提供できるようになります。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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California
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Santa Monica、California、アメリカ、90403
- Dr. Susan Love Research Foundation
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-
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 女性であること
- 少なくとも 1 つの無傷の乳首がある
- 50歳以上の場合、登録日から12か月以内に通常のマンモグラフィーを受けていること
- 登録日の12か月前までに、研究対象となる乳房の通常の身体検査を受けていること。
- 18歳以上であること
- インフォームドコンセントフォームに署名する
除外基準:
- 現在妊娠中、または過去12か月以内に妊娠している
- 現在授乳中、または過去12か月以内に授乳中である
- 過去12か月以内に化学療法を受けている
- 過去1年以内にマンモグラフィー検査で異常があったことがある
- 乳頭から2センチメートル以内で乳輪下手術またはその他の手術(乳頭腫切除、生検または細針吸引)を受けたことがある(乳頭から2センチメートルを超える生検および細針吸引は許容されます)
- 研究対象となる乳房に活動性の感染症または炎症がある
- リドカインに対する既知のアレルギーがある
- インフォームドコンセントに署名したくない
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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乳がんのある女性とない女性
乳頭吸引器、乳管洗浄用マイクロカテーテル、採血
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被験者は、乳首から液体を引き出すように設計された吸引装置を使用して乳頭吸引を受けます。
他の名前:
乳頭吸引手順が完了すると、被験者は局所麻酔で乳頭ブロックを受けます。
管は管洗浄マイクロカテーテルで洗浄されます。
サンプルは WGS のためにコーヴァンスに発送するために直ちに処理されます。
研究参加による悪影響を収集するために、被験者には処置の24時間後と2週間後に再度連絡が行われます。
他の名前:
血液は採取され、WGS のためにコーヴァンスに発送するためにすぐに処理されます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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静脈血および乳管洗浄から得られた細胞の遺伝子 DNA 配列を比較することにより、前がん性乳管における初期の上皮体細胞変異/インデルを特定します。
時間枠:6か月の時点で
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ヒトの全血および管洗浄 (DL) サンプルから高品質の DNA と RNA を抽出します。
抽出された RNA および DNA サンプルの QC と定量を評価します。
全ゲノム DNA シーケンスおよび RNA シーケンス アッセイ用に CGL によって生成されたライブラリの QC と定量を評価します。
Illumina Next Generation Sequencing プラットフォームを使用して、準備されたライブラリーを配列します。
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6か月の時点で
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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MRNA過形成または前がんドライバー経路を特定するためのイルミナ次世代シーケンシングプラットフォームでのRNAシーケンシング
時間枠:6か月の時点で
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ヒトの全血および管洗浄 (DL) サンプルから高品質の DNA と RNA を抽出します。
抽出された RNA および DNA サンプルの QC と定量を評価します。
全ゲノム DNA シーケンスおよび RNA シーケンス アッセイ用に CGL によって生成されたライブラリの QC と定量を評価します。
Illumina Next Generation Sequencing プラットフォームを使用して、準備されたライブラリーを配列します。
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6か月の時点で
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Dr. Susan Love, MD、The Dr. Susan Love Research Foundation
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Mahoney ME, Gordon EJ, Rao JY, Jin Y, Hylton N, Love SM. Intraductal therapy of ductal carcinoma in situ: a presurgery study. Clin Breast Cancer. 2013 Aug;13(4):280-6. doi: 10.1016/j.clbc.2013.02.002. Epub 2013 May 9.
- Love SM, Zhang W, Gordon EJ, Rao J, Yang H, Li J, Zhang B, Wang X, Chen G, Zhang B. A feasibility study of the intraductal administration of chemotherapy. Cancer Prev Res (Phila). 2013 Jan;6(1):51-8. doi: 10.1158/1940-6207.CAPR-12-0228. Epub 2012 Nov 20. Erratum In: Cancer Prev Res (Phila). 2013 May;6(5):506.
- Mannello F, Ligi D. Resolving breast cancer heterogeneity by searching reliable protein cancer biomarkers in the breast fluid secretome. BMC Cancer. 2013 Jul 12;13:344. doi: 10.1186/1471-2407-13-344.
- Ma CX, Ellis MJ. The Cancer Genome Atlas: clinical applications for breast cancer. Oncology (Williston Park). 2013 Dec;27(12):1263-9, 1274-9.
- Kaur H, Mao S, Shah S, Gorski DH, Krawetz SA, Sloane BF, Mattingly RR. Next-generation sequencing: a powerful tool for the discovery of molecular markers in breast ductal carcinoma in situ. Expert Rev Mol Diagn. 2013 Mar;13(2):151-65. doi: 10.1586/erm.13.4.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- L-503
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