Brystkanalen: Pilotundersøgelse af genomisk sekvensering af eksfolierede duktale celler opnået gennem endoskopi og lavage

På trods af manglen på anatomisk klarhed i litteraturen har Tibor Tot postuleret, at brystkræft og DCIS er en lobar sygdom, da de samtidigt eller asynkront optrædende, ofte multiple in situ tumorfoci er lokaliseret inden for en enkelt "syg" lap. Denne teori har en vis resonans i de molekylære undersøgelser, der er blevet udført i brystet, som viser, at der er store "pletter" af klonalitet selv i normalt brystvæv. Det meste af dette arbejde var dog baseret på mikrodissektion og antager, at tilstødende kanalprofiler tilhører den samme lap. Faktisk har både Cooper og Going vist sammenfletning af arboriseringskanaler fra forskellige uafhængige lapper. Dette sætter scenen for fortolkningsfejl i mikrodissekeret væv.

Duktal lavage tillader kanylering og skylning af individuelle kanaler og indsamling af 1.000- over 10.000 eksfolierede celler, der kan undersøges for molekylære og genetiske ændringer. Duktoskopi tilføjer muligheden for at bekræfte, at kanalen ikke er blevet perforeret, og til at børste foringen af ​​kanalen for at øge celleudbyttet. Real-time ultralyd kan bruges til at bekræfte den duktale anatomi. Med kombinationen af ​​disse minimalt invasive teknikker er det nu muligt at indsamle de celler, der er nødvendige for at anvende nye genetiske teknikker og undersøge genomet af den ductale epitelcelle.

Mens metoderne til opnåelse af de duktale epitelceller er blevet udviklet, er der gjort lignende fremskridt inden for helgenomsekventeringsteknologi. Knome®, en for-profit virksomhed, er nu i stand til at analysere duktale celler mod blod for at identificere varianter, herunder enkeltnukleotidpolymorfier (SNP'er), korte og lange insertioner og deletioner (indels), inversioner, translokationer, fusionsgener og kopiantal variationer (CNV'er). Opfindsomhed Pathway Analysis kan identificere mRNA-netværk, der kan være årsag til præ-cancerøs hyperplasi. Covance Genomics Laboratory (CAL) vil udføre DNA- og RNA-ekstraktion, DNA QC og Next-Generation Sequencing på Illumina-platformen.

Med kombinationen af ​​disse minimalt invasive teknikker og Next-Generation Sequencing vil vi være i stand til at teste vores hypotese om, at det nu er muligt at undersøge den genetiske sekvens af en enkelt normal kanal og sammenligne den med sekvensen i blodet for at identificere tidligt epitel. mutationer. Ved at sammenligne rækkefølgen af ​​to kanaler i et bryst kan vi desuden få indsigt i, om hver kanal er klonal, eller om hele brystet deler det samme genetiske mønster. Og endelig kan forståelsen af ​​de veje, der aktiveres i præ-cancerøse kanallæsioner, give mål for intraduktale behandlingsprogrammer.