Morbidita a mortalita infekcí virem hepatitidy E v Belgii

1. Cíle studia

   1.1. Primární cíle:

   Zkoumat virové faktory, jako je gt, podtyp a virová zátěž, spojené s morbiditou a mortalitou infekcí HEV v Belgii.

   1.2. Sekundární cíle:

   • Popsat hostitelské faktory spojené s morbiditou a mortalitou infekcí HEV v Belgii.
   • Najít nezávislého hostitele a/nebo virové faktory, které jsou spojeny s morbiditou a mortalitou infekcí HEV v Belgii.

2. Vyšetřovací plán

   2.1. Obecný design studie

   Retrospektivní kohortová studie.

   2.2. Délka studia, zápis a počet míst

   Subjekty, u kterých je vzorek séra odeslán do belgického národního referenčního centra pro virovou hepatitidu sciensano k diagnostice infekce HEV mezi lednem 2010 a červnem 2018.

   2.3. Studijní populace

   Všichni pacienti s potvrzenou nebo možnou infekcí HEV ve Sciensano od ledna 2010 do června 2018 včetně.

   2.3.1. Kritéria pro zařazení:

   • HEV RNA pozitivní A/NEBO HEV imunoglobulin (Ig)M pozitivní
   • Laboratorní potvrzení infekce HEV provedené ve Sciensano
   • Budou zahrnuty všechny věkové kategorie
   • Doporučující nemocnice v Belgii

   2.3.2. Kritéria vyloučení:

   • Žádné potvrzení sérologie HEV A/NEBO polymerázové řetězové reakce (PCR) provedené ve společnosti Sciensano
   • Případy nebyly diagnostikovány v Belgii
   • Případy bez údajů o klinických výsledcích

3. Studijní postupy

   Revize záznamů. Přehodnocení dostupných jaterních biopsií odborným jaterním patologem (Prof. Tania Roskams, UZ Leuven).

   3.1. Zdroje dat

   V Belgii působí Sciensano jako Národní referenční centrum (NRC) pro virovou hepatitidu. Většina zdokumentovaných infekcí HEV v Belgii je potvrzena v Sciensano a vzorky, na kterých byla provedena sérologie HEV (IgM a IgG), PCR a genotypizace, jsou uloženy do biobanky.

   3.2. Sběr dat

   Všem ošetřujícím lékařům pacientů s infekcí HEV v Belgii bude zaslán dotazník. Pokud nepřijde žádná odpověď, bude zaslána upomínka klasickou poštou a později e-mailem. Ošetřujícím lékařům budou nabídnuty různé možnosti: vyplnit dotazník, vyplnit dotazník telefonicky s výzkumným pracovníkem ze Sciensano, nechat data shromáždit na místě centra výzkumným pracovníkem ze Sciensana. Dostupné jaterní biopsie z potvrzených případů HEV budou získány z patologického oddělení každého centra a přehodnoceny odborným jaterním patologem.

   3.3. Shromážděné proměnné

   Demografická data:

   Stáří a zeměpisný původ. Datum nástupu příznaků, datum diagnózy, datum ztráty při sledování / úmrtí. Těhotenství v době diagnózy. Diabetes mellitus v době diagnózy. Imunokompromitovaný stav v době diagnózy. Známá cirhóza (fibroscan / biopsie / …), hematologické nebo onkologické onemocnění. Další komorbidity. Historie krevní transfuze. Transplantace pevného orgánu nebo kmenových buněk předcházející infekci HEV, typ orgánu a datum. Renální funkce nebo renální substituční terapie. Infekce u ostatních členů rodiny. Použití alkoholu a počet jednotek za týden. Užívání nelegálních drog. Cestování do zahraničí před infekcí HEV a název navštívené země. Konzumace vepřového masa.

   Údaje o léčbě:

   Léčba ribavirinem. Léčba jinou známou/předpokládanou antivirovou terapií. Snížení imunosupresivní medikace kvůli infekci HEV. Ukončení imunosupresivní léčby kvůli infekci HEV.

   Údaje o průběhu a výsledcích onemocnění:

   Akutní hepatitida s úplným uzdravením. Selhání jater. Hospitalizace. Délka hospitalizace ve dnech. Vstup na jednotku intenzivní péče. Délka hospitalizace na jednotce intenzivní péče ve dnech. Varixové krvácení. Bakteriální zánět pobřišnice. Jaterní encefalopatie. Extrahepatální projevy a typ. Neurologické onemocnění a typ. Chronická infekce HEV (definovaná jako HEV RNA pozitivní po dobu 3 měsíců nebo déle). Progrese k cirhóze v důsledku infekce HEV. Transplantace jater jako důsledek infekce HEV a datum transplantace. Smrt a datum úmrtí. Smrt v důsledku infekce HEV. Celkové trvání příznaků v týdnech.

   Biochemické údaje:

   HEV IgM, HEV IgG, HEV (kvantitativní) PCR, HEV genotyp a subtyp. Genotypizace HEV byla provedena Sangerovým sekvenováním oblasti 348 párů bází (v letech 2010 až 2016) nebo 493 párů bází (od roku 2017) oblasti ORF2. Získané sekvence byly porovnány s referenčními genomy HEV a předloženy HEVnet pro přiřazení genotypu (13). Prezentace ALT, vrchol ALT, AP, vrchol AP, bilirubin, vrchol bilirubinu, prezentující INR, vrchol INR, prezentující albumin, nejnižší albumin, prezentující eGFR (CKD-EPI), nejnižší eGFR (CKD-EPI).

   Hodnocení jaterní biopsie:

   Histologický grading a staging na H&E barvených sklíčkách jaterní biopsie bude aplikován zaslepeným způsobem. Jeden odborný jaterní patolog, který si není vědom stavu infekce pacienta, vyhodnotí jaterní biopsie. Následující parametry budou hodnoceny od 0 do 4 semikvantitativním způsobem: obecná architektura, lobulární a portální zánět, přítomnost imunitních buněk a nekrotických buněk, přítomnost rozhraní. Každému pacientovi bude přiděleno celkové skóre, které vezme v úvahu šíření, průměr a režim různých skórovaných parametrů.

4. Plán statistické analýzy

Charakteristiky pacientů budou analyzovány pomocí chí-kvadrát testu pro kategorické proměnné a Studentovým t-testem (Welchův test při nestejných rozptylech nebo Wilcoxonův Rank sum test při nesplnění normality) pro spojité proměnné. Číselné údaje jsou uvedeny jako průměr a standardní odchylka nebo 95% interval spolehlivosti, zatímco kategorické údaje jsou vyjádřeny jako počty a procenta.

Jsou definovány následující nezávislé virové proměnné: typ kladu HEV gt 3 (abchijklm, efg a ra), virová zátěž.

Následující nezávislé proměnné hostitele jsou definovány vzhledem k jejich známé souvislosti s výsledkem nebo závažností onemocnění: konzumace alkoholu, diabetes, pohlaví, věk, cirhóza a imunosuprese.

Rozdíly mezi demografickými faktory, závažností onemocnění (vyjádřenou laboratorními údaji a histologií) a výsledky onemocnění (definované stavem a délkou hospitalizace, pobytem na JIP, chronickou infekcí, extrahepatálními projevy a úmrtím) budou analyzovány pro nezávislé virové proměnné pomocí jednorozměrné analýzy. . Vícerozměrná lineární nebo logistická regresní analýza bude provedena se závislými proměnnými, u kterých bylo zjištěno, že jsou významně spojeny s nezávislými proměnnými v jednorozměrné analýze. Vzhledem k retrospektivní povaze analýzy není možné předem vypočítat sílu pro počet zahrnutých pacientů pro zkoumaný výsledek. Statistické analýzy se provádějí na hladině významnosti 5 % pomocí statistického softwaru R nebo SAS.