Characterization of Enterococci
5. april 2021 opdateret af: Ekram Abd El Rahman Mahmoud, Sohag University
Characterization of Enterococci; Distribution of Virulence Markers, Virulence Genes and Antibiotic Resistance Pattern of the Isolated Species
Study on Characterization of Enterococci because nowadays it become an important cause of nosocomial infections .detection of the most common two species of Enterococci and most common virulence factors & its genes with determination of antibiotics sensitivity test for the isolated strains
Studieoversigt
Status
Afsluttet
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Faktiske)
52
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
-
Sohag, Egypten
- Sohag faculty of medicine
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
2 måneder til 90 år (Barn, Voksen, Ældre voksen)
Tager imod sunde frivillige
N/A
Køn, der er berettiget til at studere
Alle
Prøveudtagningsmetode
Sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
patients in ICU in Sohag University Hospital
Beskrivelse
Inclusion Criteria:
- any patients in ICU has manifestations of urinary tract infections, surgical wound infections, intra-abdominal infections, intrapelvic infections, bacteraemia and infective endocarditis
Exclusion Criteria:
- patients receiving antibiotics in previous 48 hours
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
I) Sample collection
Tidsramme: 2 months
|
Samples are collected from intensive care unit (ICU) including urine, pus swabs, sputum, blood, tracheal aspirates and pharyngeal swabs
|
2 months
|
|
II) Identification of Enterococci:
Tidsramme: 2 month
|
by inoculation on Bile esculin azide & growing colonies further identified by :
|
2 month
|
|
III) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Gelatinase activity)
Tidsramme: 2 weeks
|
by culture on nutrient agar containing gelatin.Positive results appeared as liquefaction of gelatin
|
2 weeks
|
|
IV)Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci (hemolytic activity)
Tidsramme: 1 week
|
by Detection of hemolytic activity on the blood agar
|
1 week
|
|
V) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Caseinase production)
Tidsramme: 2 weeks
|
by Detection of Caseinase production on Muller hinton agar containing skimmed milk 3%.
|
2 weeks
|
|
VI) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Formation of Slime layer)
Tidsramme: 1 week
|
Formation of Slime layer by culture on Brain heart infusion agar containing 5% sucrose, plates are incubated for 24 hrs at 37oC.
Positive strains gave mucoid and slimy colonies.
|
1 week
|
|
VII) Phenotypic detection of virulence marker of EnterococcI (Biofilm formation)
Tidsramme: 2 weeks
|
using microtiter plate reader.
Biofilm formation is scored as nonbiofilm forming (-), weak - (+), moderate - (++), and strong - (+++) corresponding to the A630 values ≤1, 1-≤2, 2-≤3, and>3, respectively
|
2 weeks
|
|
VIII) Antibiotic sensitivity test:
Tidsramme: 3 monthe
|
MICs (minimal inhibitory concentrations) of Vancomycin are measured by E-test for confirmation of vancomycin resistance among the isolated Enterococci. Results are interpreted according to CLSI guidelines. |
3 monthe
|
|
IX) Molecular Identification of commonest Enterococcus species
Tidsramme: 1 month
|
by conventional gene specific uniplex PCR for E. faecalis and E. Faecium
|
1 month
|
|
X) Molecular detection of virulence genes
Tidsramme: 2 months
|
Identification of virulence genes; gel E (gene for gelatinase), asa1 (gene for aggregation substance), cylA (gene for cytolysin activator), esp (gene for Enterococcal surface protein) Hyl (gene for Hyaluronidase) of E. faecalis and E. faecium was performed by uniplex PCR.The amplified products are visualized on 2% agarose gel stained with ethidium bromide.
The stained gels are visualized and documented with a gel documentation system and analyzed visually to determine the size of PCR amplicons of the target genes directly by comparison with 100 bp DNA ladder marker.
|
2 months
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Ekram Ab Rahmand Mahmoud, lecturer, Sohag faculty of medicine
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
1. februar 2020
Primær færdiggørelse (Faktiske)
28. februar 2021
Studieafslutning (Faktiske)
10. marts 2021
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
20. februar 2021
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
25. februar 2021
Først opslået (Faktiske)
2. marts 2021
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
6. april 2021
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
5. april 2021
Sidst verificeret
1. februar 2021
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Andre undersøgelses-id-numre
- Soh-Med-21-02-19
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .