Characterization of Enterococci
5 april 2021 uppdaterad av: Ekram Abd El Rahman Mahmoud, Sohag University
Characterization of Enterococci; Distribution of Virulence Markers, Virulence Genes and Antibiotic Resistance Pattern of the Isolated Species
Study on Characterization of Enterococci because nowadays it become an important cause of nosocomial infections .detection of the most common two species of Enterococci and most common virulence factors & its genes with determination of antibiotics sensitivity test for the isolated strains
Studieöversikt
Status
Avslutad
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Faktisk)
52
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studieorter
-
-
-
Sohag, Egypten
- Sohag faculty of medicine
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
2 månader till 90 år (Barn, Vuxen, Äldre vuxen)
Tar emot friska volontärer
N/A
Kön som är behöriga för studier
Allt
Testmetod
Sannolikhetsprov
Studera befolkning
patients in ICU in Sohag University Hospital
Beskrivning
Inclusion Criteria:
- any patients in ICU has manifestations of urinary tract infections, surgical wound infections, intra-abdominal infections, intrapelvic infections, bacteraemia and infective endocarditis
Exclusion Criteria:
- patients receiving antibiotics in previous 48 hours
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
I) Sample collection
Tidsram: 2 months
|
Samples are collected from intensive care unit (ICU) including urine, pus swabs, sputum, blood, tracheal aspirates and pharyngeal swabs
|
2 months
|
|
II) Identification of Enterococci:
Tidsram: 2 month
|
by inoculation on Bile esculin azide & growing colonies further identified by :
|
2 month
|
|
III) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Gelatinase activity)
Tidsram: 2 weeks
|
by culture on nutrient agar containing gelatin.Positive results appeared as liquefaction of gelatin
|
2 weeks
|
|
IV)Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci (hemolytic activity)
Tidsram: 1 week
|
by Detection of hemolytic activity on the blood agar
|
1 week
|
|
V) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Caseinase production)
Tidsram: 2 weeks
|
by Detection of Caseinase production on Muller hinton agar containing skimmed milk 3%.
|
2 weeks
|
|
VI) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Formation of Slime layer)
Tidsram: 1 week
|
Formation of Slime layer by culture on Brain heart infusion agar containing 5% sucrose, plates are incubated for 24 hrs at 37oC.
Positive strains gave mucoid and slimy colonies.
|
1 week
|
|
VII) Phenotypic detection of virulence marker of EnterococcI (Biofilm formation)
Tidsram: 2 weeks
|
using microtiter plate reader.
Biofilm formation is scored as nonbiofilm forming (-), weak - (+), moderate - (++), and strong - (+++) corresponding to the A630 values ≤1, 1-≤2, 2-≤3, and>3, respectively
|
2 weeks
|
|
VIII) Antibiotic sensitivity test:
Tidsram: 3 monthe
|
MICs (minimal inhibitory concentrations) of Vancomycin are measured by E-test for confirmation of vancomycin resistance among the isolated Enterococci. Results are interpreted according to CLSI guidelines. |
3 monthe
|
|
IX) Molecular Identification of commonest Enterococcus species
Tidsram: 1 month
|
by conventional gene specific uniplex PCR for E. faecalis and E. Faecium
|
1 month
|
|
X) Molecular detection of virulence genes
Tidsram: 2 months
|
Identification of virulence genes; gel E (gene for gelatinase), asa1 (gene for aggregation substance), cylA (gene for cytolysin activator), esp (gene for Enterococcal surface protein) Hyl (gene for Hyaluronidase) of E. faecalis and E. faecium was performed by uniplex PCR.The amplified products are visualized on 2% agarose gel stained with ethidium bromide.
The stained gels are visualized and documented with a gel documentation system and analyzed visually to determine the size of PCR amplicons of the target genes directly by comparison with 100 bp DNA ladder marker.
|
2 months
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Ekram Ab Rahmand Mahmoud, lecturer, Sohag faculty of medicine
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
1 februari 2020
Primärt slutförande (Faktisk)
28 februari 2021
Avslutad studie (Faktisk)
10 mars 2021
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
20 februari 2021
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
25 februari 2021
Första postat (Faktisk)
2 mars 2021
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
6 april 2021
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
5 april 2021
Senast verifierad
1 februari 2021
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Andra studie-ID-nummer
- Soh-Med-21-02-19
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
NEJ
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .