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Characterization of Enterococci

5. April 2021 aktualisiert von: Ekram Abd El Rahman Mahmoud, Sohag University

Characterization of Enterococci; Distribution of Virulence Markers, Virulence Genes and Antibiotic Resistance Pattern of the Isolated Species

Study on Characterization of Enterococci because nowadays it become an important cause of nosocomial infections .detection of the most common two species of Enterococci and most common virulence factors & its genes with determination of antibiotics sensitivity test for the isolated strains

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

52

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

      • Sohag, Ägypten
        • Sohag faculty of medicine

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

2 Monate bis 90 Jahre (Kind, Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

N/A

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Wahrscheinlichkeitsstichprobe

Studienpopulation

patients in ICU in Sohag University Hospital

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  • any patients in ICU has manifestations of urinary tract infections, surgical wound infections, intra-abdominal infections, intrapelvic infections, bacteraemia and infective endocarditis

Exclusion Criteria:

  • patients receiving antibiotics in previous 48 hours

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
I) Sample collection
Zeitfenster: 2 months
Samples are collected from intensive care unit (ICU) including urine, pus swabs, sputum, blood, tracheal aspirates and pharyngeal swabs
2 months
II) Identification of Enterococci:
Zeitfenster: 2 month

by inoculation on Bile esculin azide & growing colonies further identified by :

  1. microscopically after staining by gram stain
  2. catalase test
  3. grow on high concentration of NaCl (6.5%)
2 month
III) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Gelatinase activity)
Zeitfenster: 2 weeks
by culture on nutrient agar containing gelatin.Positive results appeared as liquefaction of gelatin
2 weeks
IV)Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci (hemolytic activity)
Zeitfenster: 1 week
by Detection of hemolytic activity on the blood agar
1 week
V) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Caseinase production)
Zeitfenster: 2 weeks
by Detection of Caseinase production on Muller hinton agar containing skimmed milk 3%.
2 weeks
VI) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Formation of Slime layer)
Zeitfenster: 1 week
Formation of Slime layer by culture on Brain heart infusion agar containing 5% sucrose, plates are incubated for 24 hrs at 37oC. Positive strains gave mucoid and slimy colonies.
1 week
VII) Phenotypic detection of virulence marker of EnterococcI (Biofilm formation)
Zeitfenster: 2 weeks
using microtiter plate reader. Biofilm formation is scored as nonbiofilm forming (-), weak - (+), moderate - (++), and strong - (+++) corresponding to the A630 values ≤1, 1-≤2, 2-≤3, and>3, respectively
2 weeks
VIII) Antibiotic sensitivity test:
Zeitfenster: 3 monthe
  1. by 1- disc diffusion test using Vancomycin 30 μg, Teichoplanin 30 μg, Tetracycline 30 μg, Ampicillin 10 μg and Erythromycin 15 μg. Results ,Results are interpreted according to CLSI 2018.
  2. E-test:

MICs (minimal inhibitory concentrations) of Vancomycin are measured by E-test for confirmation of vancomycin resistance among the isolated Enterococci. Results are interpreted according to CLSI guidelines.

3 monthe
IX) Molecular Identification of commonest Enterococcus species
Zeitfenster: 1 month
by conventional gene specific uniplex PCR for E. faecalis and E. Faecium
1 month
X) Molecular detection of virulence genes
Zeitfenster: 2 months
Identification of virulence genes; gel E (gene for gelatinase), asa1 (gene for aggregation substance), cylA (gene for cytolysin activator), esp (gene for Enterococcal surface protein) Hyl (gene for Hyaluronidase) of E. faecalis and E. faecium was performed by uniplex PCR.The amplified products are visualized on 2% agarose gel stained with ethidium bromide. The stained gels are visualized and documented with a gel documentation system and analyzed visually to determine the size of PCR amplicons of the target genes directly by comparison with 100 bp DNA ladder marker.
2 months

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Ermittler

  • Hauptermittler: Ekram Ab Rahmand Mahmoud, lecturer, Sohag faculty of medicine

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

1. Februar 2020

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

28. Februar 2021

Studienabschluss (Tatsächlich)

10. März 2021

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

20. Februar 2021

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

25. Februar 2021

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

2. März 2021

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

6. April 2021

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

5. April 2021

Zuletzt verifiziert

1. Februar 2021

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Andere Studien-ID-Nummern

  • Soh-Med-21-02-19

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

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