Analysis of Prognostic and Predictive Genomic Signatures Using Archival Paraffin-embedded Breast Tumor - a Pilot Study
tiistai 21. tammikuuta 2014 päivittänyt: National University Hospital, Singapore
A number of prognostic and/or predictive genomic signatures for breast cancer have been developed by Genome Institute of Singapore (GIS).
In the past 1 year, GIS has developed protocols and methods to conduct expression assays from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumor specimens.
A study on 800 tumor samples is planned to analyze these gene signatures and compare them with conventional clinical prognosticators and predictors.
As the investigators plan to use archival tumor samples that dates back to the 1990s, the aim of this pilot study is to first analyze 10 anonymized samples to determine the feasibility of running these assays on old archival blocks.
The information generated will help us determine whether very old samples (diagnosed before 2000) may be selected for the actual study.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Yksityiskohtainen kuvaus
Up to 10 archival breast tumor blocks will be obtained from the Department of Pathology, NUH - half of these blocks will be from patients who were diagnosed before year 2000, and the other half of the blocks will be from patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens).
Basic tumor and patient information will be collected without patient identifiers - grade, stage, ER/PR/HER2 status, treatment received, outcome data.
8-10 ten-micron sections will be cut from each tumor block.
RNA will be extracted from the tumor sections using the Roche High Pure FFPE RNA Micro Kit.
RNA will be profiled using the Illumina Veracode assay and the Affymetrix Quantigene assay.
RNA extraction and gene expression profiling will be performed by collabroators at the Genome Institute of Singapore.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Odotettu)
10
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Singapore, Singapore
- National University Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Nainen
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Archival tumor samples that dates back to the 1990s
Kuvaus
Inclusion Criteria:
- Half of these blocks will be from breast cancer patients who were diagnosed before year 2000.
- Half of the blocks will be from breast cancer patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens).
Exclusion Criteria:
- Breast cancer patients diagnosed after year 2005.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Rintakasvain
Rintojen tuumorilohkot
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Tutkijat
- Päätutkija: Soo Chin Lee, MBBS, MRCP, National University Hospital, Singapore
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Barrios CH, Liu MC, Lee SC, Vanlemmens L, Ferrero JM, Tabei T, Pivot X, Iwata H, Aogi K, Lugo-Quintana R, Harbeck N, Brickman MJ, Zhang K, Kern KA, Martin M. Phase III randomized trial of sunitinib versus capecitabine in patients with previously treated HER2-negative advanced breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2010 May;121(1):121-31. doi: 10.1007/s10549-010-0788-0. Epub 2010 Mar 26.
- Lim YW, Goh BC, Wang LZ, Tan SH, Chuah BYS, Lim SE, Iau P, Buhari SA, Chan CW, Sukri NB, Cordero MT, Soo R, Lee SC. Pharmacokinetics and pharmacodynamics of docetaxel with or without ketoconazole modulation in chemonaive breast cancer patients. Ann Oncol. 2010 Nov;21(11):2175-2182. doi: 10.1093/annonc/mdq230. Epub 2010 Apr 29.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Sunnuntai 1. elokuuta 2010
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Maanantai 1. joulukuuta 2014
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Maanantai 1. joulukuuta 2014
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Torstai 26. elokuuta 2010
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 23. marraskuuta 2010
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Keskiviikko 24. marraskuuta 2010
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)
Keskiviikko 22. tammikuuta 2014
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 21. tammikuuta 2014
Viimeksi vahvistettu
Keskiviikko 1. tammikuuta 2014
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- BR04/21/10
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .