Analysis of Prognostic and Predictive Genomic Signatures Using Archival Paraffin-embedded Breast Tumor - a Pilot Study
21. januar 2014 oppdatert av: National University Hospital, Singapore
A number of prognostic and/or predictive genomic signatures for breast cancer have been developed by Genome Institute of Singapore (GIS).
In the past 1 year, GIS has developed protocols and methods to conduct expression assays from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumor specimens.
A study on 800 tumor samples is planned to analyze these gene signatures and compare them with conventional clinical prognosticators and predictors.
As the investigators plan to use archival tumor samples that dates back to the 1990s, the aim of this pilot study is to first analyze 10 anonymized samples to determine the feasibility of running these assays on old archival blocks.
The information generated will help us determine whether very old samples (diagnosed before 2000) may be selected for the actual study.
Studieoversikt
Detaljert beskrivelse
Up to 10 archival breast tumor blocks will be obtained from the Department of Pathology, NUH - half of these blocks will be from patients who were diagnosed before year 2000, and the other half of the blocks will be from patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens).
Basic tumor and patient information will be collected without patient identifiers - grade, stage, ER/PR/HER2 status, treatment received, outcome data.
8-10 ten-micron sections will be cut from each tumor block.
RNA will be extracted from the tumor sections using the Roche High Pure FFPE RNA Micro Kit.
RNA will be profiled using the Illumina Veracode assay and the Affymetrix Quantigene assay.
RNA extraction and gene expression profiling will be performed by collabroators at the Genome Institute of Singapore.
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Forventet)
10
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiesteder
-
-
-
Singapore, Singapore
- National University Hospital
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Nei
Kjønn som er kvalifisert for studier
Hunn
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Archival tumor samples that dates back to the 1990s
Beskrivelse
Inclusion Criteria:
- Half of these blocks will be from breast cancer patients who were diagnosed before year 2000.
- Half of the blocks will be from breast cancer patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens).
Exclusion Criteria:
- Breast cancer patients diagnosed after year 2005.
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Brystsvulst
Brystsvulstblokker
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Soo Chin Lee, MBBS, MRCP, National University Hospital, Singapore
Publikasjoner og nyttige lenker
Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.
Generelle publikasjoner
- Barrios CH, Liu MC, Lee SC, Vanlemmens L, Ferrero JM, Tabei T, Pivot X, Iwata H, Aogi K, Lugo-Quintana R, Harbeck N, Brickman MJ, Zhang K, Kern KA, Martin M. Phase III randomized trial of sunitinib versus capecitabine in patients with previously treated HER2-negative advanced breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2010 May;121(1):121-31. doi: 10.1007/s10549-010-0788-0. Epub 2010 Mar 26.
- Lim YW, Goh BC, Wang LZ, Tan SH, Chuah BYS, Lim SE, Iau P, Buhari SA, Chan CW, Sukri NB, Cordero MT, Soo R, Lee SC. Pharmacokinetics and pharmacodynamics of docetaxel with or without ketoconazole modulation in chemonaive breast cancer patients. Ann Oncol. 2010 Nov;21(11):2175-2182. doi: 10.1093/annonc/mdq230. Epub 2010 Apr 29.
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart
1. august 2010
Primær fullføring (Forventet)
1. desember 2014
Studiet fullført (Forventet)
1. desember 2014
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
26. august 2010
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
23. november 2010
Først lagt ut (Anslag)
24. november 2010
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Anslag)
22. januar 2014
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
21. januar 2014
Sist bekreftet
1. januar 2014
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- BR04/21/10
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .