Analysis of Prognostic and Predictive Genomic Signatures Using Archival Paraffin-embedded Breast Tumor - a Pilot Study
21 de enero de 2014 actualizado por: National University Hospital, Singapore
A number of prognostic and/or predictive genomic signatures for breast cancer have been developed by Genome Institute of Singapore (GIS).
In the past 1 year, GIS has developed protocols and methods to conduct expression assays from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumor specimens.
A study on 800 tumor samples is planned to analyze these gene signatures and compare them with conventional clinical prognosticators and predictors.
As the investigators plan to use archival tumor samples that dates back to the 1990s, the aim of this pilot study is to first analyze 10 anonymized samples to determine the feasibility of running these assays on old archival blocks.
The information generated will help us determine whether very old samples (diagnosed before 2000) may be selected for the actual study.
Descripción general del estudio
Estado
Desconocido
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
Up to 10 archival breast tumor blocks will be obtained from the Department of Pathology, NUH - half of these blocks will be from patients who were diagnosed before year 2000, and the other half of the blocks will be from patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens).
Basic tumor and patient information will be collected without patient identifiers - grade, stage, ER/PR/HER2 status, treatment received, outcome data.
8-10 ten-micron sections will be cut from each tumor block.
RNA will be extracted from the tumor sections using the Roche High Pure FFPE RNA Micro Kit.
RNA will be profiled using the Illumina Veracode assay and the Affymetrix Quantigene assay.
RNA extraction and gene expression profiling will be performed by collabroators at the Genome Institute of Singapore.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Anticipado)
10
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Ubicaciones de estudio
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Singapore, Singapur
- National University Hospital
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Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
No
Géneros elegibles para el estudio
Femenino
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Archival tumor samples that dates back to the 1990s
Descripción
Inclusion Criteria:
- Half of these blocks will be from breast cancer patients who were diagnosed before year 2000.
- Half of the blocks will be from breast cancer patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens).
Exclusion Criteria:
- Breast cancer patients diagnosed after year 2005.
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
|---|---|
|
Tumor de mama
Bloques de tumores de mama
|
Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Soo Chin Lee, MBBS, MRCP, National University Hospital, Singapore
Publicaciones y enlaces útiles
La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.
Publicaciones Generales
- Barrios CH, Liu MC, Lee SC, Vanlemmens L, Ferrero JM, Tabei T, Pivot X, Iwata H, Aogi K, Lugo-Quintana R, Harbeck N, Brickman MJ, Zhang K, Kern KA, Martin M. Phase III randomized trial of sunitinib versus capecitabine in patients with previously treated HER2-negative advanced breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2010 May;121(1):121-31. doi: 10.1007/s10549-010-0788-0. Epub 2010 Mar 26.
- Lim YW, Goh BC, Wang LZ, Tan SH, Chuah BYS, Lim SE, Iau P, Buhari SA, Chan CW, Sukri NB, Cordero MT, Soo R, Lee SC. Pharmacokinetics and pharmacodynamics of docetaxel with or without ketoconazole modulation in chemonaive breast cancer patients. Ann Oncol. 2010 Nov;21(11):2175-2182. doi: 10.1093/annonc/mdq230. Epub 2010 Apr 29.
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio
1 de agosto de 2010
Finalización primaria (Anticipado)
1 de diciembre de 2014
Finalización del estudio (Anticipado)
1 de diciembre de 2014
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
26 de agosto de 2010
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
23 de noviembre de 2010
Publicado por primera vez (Estimar)
24 de noviembre de 2010
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Estimar)
22 de enero de 2014
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
21 de enero de 2014
Última verificación
1 de enero de 2014
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- BR04/21/10
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