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Analysis of Prognostic and Predictive Genomic Signatures Using Archival Paraffin-embedded Breast Tumor - a Pilot Study

21. Januar 2014 aktualisiert von: National University Hospital, Singapore
A number of prognostic and/or predictive genomic signatures for breast cancer have been developed by Genome Institute of Singapore (GIS). In the past 1 year, GIS has developed protocols and methods to conduct expression assays from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumor specimens. A study on 800 tumor samples is planned to analyze these gene signatures and compare them with conventional clinical prognosticators and predictors. As the investigators plan to use archival tumor samples that dates back to the 1990s, the aim of this pilot study is to first analyze 10 anonymized samples to determine the feasibility of running these assays on old archival blocks. The information generated will help us determine whether very old samples (diagnosed before 2000) may be selected for the actual study.

Studienübersicht

Status

Unbekannt

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Up to 10 archival breast tumor blocks will be obtained from the Department of Pathology, NUH - half of these blocks will be from patients who were diagnosed before year 2000, and the other half of the blocks will be from patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens). Basic tumor and patient information will be collected without patient identifiers - grade, stage, ER/PR/HER2 status, treatment received, outcome data. 8-10 ten-micron sections will be cut from each tumor block. RNA will be extracted from the tumor sections using the Roche High Pure FFPE RNA Micro Kit. RNA will be profiled using the Illumina Veracode assay and the Affymetrix Quantigene assay. RNA extraction and gene expression profiling will be performed by collabroators at the Genome Institute of Singapore.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Voraussichtlich)

10

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Singapur
      • Singapore, Singapur
        • National University Hospital

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Weiblich

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Archival tumor samples that dates back to the 1990s

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  • Half of these blocks will be from breast cancer patients who were diagnosed before year 2000.
  • Half of the blocks will be from breast cancer patients diagnosed between year 2000-2005 (control specimens).

Exclusion Criteria:

  • Breast cancer patients diagnosed after year 2005.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Brusttumor
Brusttumorblockaden
Sonstiges: Brusttumorblockaden

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

National University Hospital, Singapore

Ermittler

  • Hauptermittler: Soo Chin Lee, MBBS, MRCP, National University Hospital, Singapore

Publikationen und hilfreiche Links

Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.

Allgemeine Veröffentlichungen

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn

1. August 2010

Primärer Abschluss (Voraussichtlich)

1. Dezember 2014

Studienabschluss (Voraussichtlich)

1. Dezember 2014

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

26. August 2010

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

23. November 2010

Zuerst gepostet (Schätzen)

24. November 2010

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Schätzen)

22. Januar 2014

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

21. Januar 2014

Zuletzt verifiziert

1. Januar 2014

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • BR04/21/10

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