潰瘍性大腸炎の炎症軽減におけるプレバイオティクスと臨床エンドポイント (PRInCE-UC) (PRInCE-UC)

この食事介入研究は二重盲検クロスオーバー方式で実施され、軽度から中等度の活動性UCを患う44人の参加者に、候補プレバイオティクス（2'-フコシルラクトース、母乳オリゴ糖）の適切な用量を摂取してもらいます。 ) 28 日間、その後同等のプラセボ (マルトデキストリン) を 28 日間給餌する、またはその逆。 プレバイオティクスは通常、小袋の形で入手でき、参加者には毎日の摂取方法が説明されます。

ボランティアの排便習慣、症状のスコアリングおよび気分日記: 補給期間および休薬期間中、ボランティアには排便習慣と気分、薬の使用および有害事象を記録するための毎日の日記が与えられます。 ボランティアは、1 日あたりの排便回数、ブリストル便スケール スコア、膨満感や腹部不快感の症状 (なし、軽度、中等度、または重度に評価) を記録します。 ボランティアは、自分の鼓腸を 5 段階のスケールで評価するよう求められます (スコアは「正常」を 0、通常より多い場合は +1 または +2、通常より少ない場合は -1 または -2)。 自己申告による気分は、活力、ストレス、幸福感、注意力を記録した 5 段階評価で評価されます。 一般的な健康状態や睡眠に関するアンケートも含まれます。 検証された疾患固有の活動は、Simple Clinical Colitis Activity Index を使用して記録されます。

選択性指数: 潜在的に健康を促進するビフィズス菌、ローズブリア属、フェカリバクテリウム属および乳酸菌（有益）の相対数、共生細菌ユーバクテリウム属、アトポビウム属の数に対するプレバイオティクス摂取の影響。 そして、腸内細菌叢の潜在的に有害なメンバーの数、すなわち大腸菌、タンパク質分解性バクテロイデス属の菌数についても調べました。 そして、Clostridium perfringens/histolyticum グループは糞便微生物叢内で決定されます。 さらに、マイクロバイオームの機能的能力と宿主の代謝表現型への影響は、1H-核磁気共鳴（NMR）分光法に基づくメタボノミクスによって決定されます。 これらの全体的なプロファイルには、微生物の代謝プロセス、ゲノム間相互作用、および宿主の内因性代謝に直接関連する情報が含まれています。 このトップダウンのシステム生物学的アプローチを適用することにより、プレバイオティクスへの曝露に対する宿主および微生物叢の生化学的反応を特徴付けることができます。

腸内細菌叢の組成研究: 蛍光 in situ ハイブリダイゼーション (FISH) は、ヒト研究における主要な嫌気性細菌の同定と数え上げに使用され、フローサイトメトリーにより高いスループットと感度が可能になります。 さらに、高容量シーケンシング (454 パイロシークエンシングなど) を使用したメタゲノム アプローチによる群集構造の完全な定性評価が適用されます。

1 H-NMR 分光法に基づく代謝プロファイリング研究: この提案では、標準的な 1 次元 NMR 実験を使用して、ヒト臨床試験全体で収集された生体サンプルからの全体的な代謝シグネチャを特徴付けるために 1 H-NMR 分光法が適用されます。 腸内微生物学とメタボノミクスデータは、データ融合技術（たとえば、双方向部分最小二乗法マルチブロックデータ解析）を使用して統合され、システムレベルの変化のメカニズムの理解を生み出し、臨床的に関連する分子情報の抽出を最適化します。 この分析により、臨床試験中のプレバイオティクスに基づく介入が「健康」に近い形でヒトのメタボノームにどのような影響を与えたかの尺度が提供されることが期待されます。

免疫学的評価: 血液および糞便の検体は、免疫細胞の数と表現型を決定するために使用されます。 これらのデータは、炎症の問題を含む、試験の特定の時点での患者の免疫学的状態を示します。

抗原提示細胞集団と相互作用する免疫細胞サブセット: 分化した細胞タイプ (プロフェッショナルおよび間質) による抗原提示と、それらがエフェクター T 細胞サブセットと相互作用する程度を比較します。 免疫系への抗原の最初の提示はこれらのグループ間で異なる可能性が高く、4 色蛍光免疫組織学を使用してこれらの相互作用を定量化することで、これらのプロセスと UC 病状の進行のメカニズムに関する情報が得られます。

収集されるデータは、細菌群集プロファイル、免疫学的マーカー、血液/血清測定値、ボランティアアンケート、NMR ベースのメタボノミクスデータ、微生物最終生成物および患者の症状です。 これらのデータは主に数値であり、Excel スプレッドシートの形式ですが、スペクトル データ ファイル、生のシーケンス ファイル、食事日記の記録 (MS word/REDCap) も含まれます。 データ分析用のソフトウェアはSAS（Statistical Analysis Software）となります。 メタボノミック NMR 分光法と微生物配列データ ファイルのみが、適度に大きなデータ量を生成します。 私たちは、最終的にデータ リポジトリに保存するためのデータ形式に関するコミュニティ標準を特定します。