Prebiotika při snižování zánětu a klinické koncové body u ulcerózní kolitidy (PRInCE-UC) (PRInCE-UC)

Tato dietní intervenční studie bude provedena dvojitě zaslepeným, zkříženým způsobem, přičemž 44 účastníků s mírnou až středně aktivní UC bude požádáno, aby konzumovali vhodnou dávku kandidátního prebiotika (2'-fukosyllaktóza, oligosacharid z lidského mléka). ) po dobu 28 dnů, po kterých následuje 28denní období krmení ekvivalentním placebem (maltodextrin), nebo naopak. Prebiotika jsou obecně dostupná ve formě sáčků a účastníci budou každý den instruováni, jak je užívat.

Stravovací návyky, skóre příznaků a náladové deníky dobrovolníků: Během období suplementace a vymývacího období dostanou dobrovolníci denní deník, do kterého budou zaznamenávány jejich střevní návyky a nálada, užívání léků a nežádoucí účinky. Dobrovolníci budou zaznamenávat počet stolic za den, skóre Bristolské stolice a jakékoli příznaky nadýmání nebo břišního nepohodlí (hodnocené jako žádné, mírné, střední nebo závažné). Dobrovolníci budou požádáni, aby ohodnotili svou plynatost na pětibodové stupnici (se skóre 0 pro „normální“, +1 nebo +2 pro více než obvykle a - 1 nebo - 2 pro méně než obvykle). Vlastní nálada bude hodnocena pomocí pětibodové škály, přičemž se zaznamenává vitalita, stres, štěstí a bdělost. Zahrneme také dotazníky o obecné pohodě a spánku. Validovaná aktivita specifická pro onemocnění bude zaznamenána pomocí jednoduchého indexu aktivity klinické kolitidy.

Index selektivity: Vliv prebiotického krmení na relativní počty potenciálně zdraví podporujících Bifidobacterium, Roseburia, Faecalibacteria a Lactobacilli (prospěšné), na počty komenzálních Eubacterium spp., Atopobium spp. a na počtu potenciálně škodlivých členů střevní mikroflóry, jmenovitě Escherichia coli, proteolytických Bacteroides spp. a skupina Clostridium perfringens/histolyticum bude stanovena v rámci fekální mikroflóry. Kromě toho bude funkční kapacita mikrobiomu a dopad na metabolický fenotyp hostitele stanoveny pomocí metabonomiky založené na 1H-nukleární magnetické rezonanci (NMR). Tyto globální profily obsahují informace týkající se přímo mikrobiálních metabolických procesů, transgenomických interakcí a také endogenního metabolismu hostitele. Prostřednictvím aplikace tohoto přístupu k biologii systémů shora dolů lze charakterizovat biochemické reakce hostitele a mikroflóry na prebiotickou expozici.

Studie složení střevní mikroflóry: Fluorescenční hybridizace in situ (FISH) bude použita k identifikaci a počítání hlavních anaerobních bakterií ve studiích na lidech a průtoková cytometrie umožní vysokou propustnost a citlivost. Kromě toho bude použito úplné kvalitativní posouzení struktury komunity prostřednictvím metagenomického přístupu využívajícího vysokokapacitní sekvenování (454 pyrosekvenování nebo podobně).

Studie metabolického profilování založené na 1H-NMR spektroskopii: V tomto návrhu bude 1H-NMR spektroskopie aplikována k charakterizaci globálních metabolických signatur z biologických vzorků odebraných v průběhu lidských studií s použitím standardních jednorozměrných NMR experimentů. Střevní mikrobiologie a metabonomická data budou integrována pomocí technik fúze dat (například obousměrná částečná analýza dat metodou nejmenších čtverců s více bloky), aby se dosáhlo mechanického pochopení změn na úrovni systému a optimalizovala se extrakce klinicky relevantních molekulárních informací. Očekává se, že tato analýza poskytne měřítko toho, jak zásah na bázi prebiotik během klinické studie ovlivnil lidský metabonom způsobem blíže „zdraví“.

Imunologická hodnocení: Ke stanovení počtu imunitních buněk a fenotypů budou použity vzorky krve a stolice. Tato data ukáží imunologický stav pacientů v jakékoli konkrétní době studie – včetně zánětlivých problémů.

Podskupiny imunitních buněk interagující s buněčnými populacemi prezentujícími antigen: Porovnáme prezentaci antigenu u diferencovaných typů buněk (profesionální a stromální) a míru, do jaké interagují s podskupinami efektorových T-buněk. Je pravděpodobné, že počáteční prezentace antigenu imunitnímu systému se bude u těchto skupin lišit a kvantifikace těchto interakcí pomocí 4barevné fluorescenční imunohistologie poskytne mechanické informace o těchto procesech a progresi chorobného stavu UC.

Shromážděná data budou profily bakteriální komunity, imunologické markery, měření krve/séra, dobrovolnické dotazníky, metabonomická data založená na NMR, mikrobiální konečné produkty a symptomy pacientů. Tato data budou většinou numerická a ve formě tabulek Excel, ale budou zahrnovat i soubory spektrálních dat, soubory surových sekvencí a záznamy deníku potravin (MS word/REDCap). Software pro analýzu dat bude SAS (Software pro statistickou analýzu). Pouze metabonomická NMR spektroskopie a datové soubory mikrobiálního sekvenování budou generovat středně velké objemy dat. Identifikujeme komunitní standardy pro formátování dat pro případné uložení do datových úložišť.