Prebiootit tulehduksen vähentämisessä ja kliiniset päätepisteet haavaisessa paksusuolentulehduksessa (PRInCE-UC) (PRInCE-UC)

Tämä ruokavaliointerventiotutkimus suoritetaan kaksoissokkoutetulla, risteävällä tavalla, jossa 44 osallistujaa, joilla on lievä tai kohtalaisen aktiivinen UC, pyydetään nauttimaan sopiva annos ehdokasprebioottia (2'-fukosyllaktoosi, äidinmaidon oligosakkaridi). ) 28 päivän ajan, jota seuraa 28 päivän ruokintajakso vastaavalla lumelääkkeellä (maltodekstriini) tai päinvastoin. Prebiootteja on yleensä saatavilla pussimuodossa, ja osallistujille opastetaan kuinka ne otetaan päivittäin.

Vapaaehtoiset suolistotottumukset, oireiden pisteytykset ja mielialapäiväkirjat: Lisäravinteiden ja huuhtoutumisjaksojen aikana vapaaehtoisille annetaan päivittäinen päiväkirja, johon kirjataan heidän suolistotottumukset ja mieliala, lääkkeiden käyttö ja haittatapahtumat. Vapaaehtoiset tallentavat suolen liikkeiden määrän päivässä, Bristolin ulosteen asteikon pisteet ja kaikki turvotuksen tai vatsakivun oireet (luokituksena ei yhtään, lievä, kohtalainen tai vaikea). Vapaaehtoisia pyydetään arvioimaan ilmavaivat viiden pisteen asteikolla (pistemäärä 0 tarkoittaa "normaalia", +1 tai +2 tavallista enemmän ja -1 tai -2 tavallista vähemmän). Omaa mielialaa arvioidaan viiden pisteen asteikolla, jossa kirjataan elinvoimaisuus, stressi, onnellisuus ja vireys. Teemme myös kyselyitä yleisestä hyvinvoinnista ja unesta. Validoitu sairauskohtainen aktiivisuus kirjataan käyttämällä Simple Clinical Colitis Activity Index -indeksiä.

Selektiivisyysindeksi: Prebioottisen ruokinnan vaikutus mahdollisesti terveyttä edistävien Bifidobacterium-, Roseburia-, Faecalibacteria- ja Lactobacilli-määriin (hyödyllinen), Eubacterium spp., Atopobium spp. ja suoliston mikroflooran mahdollisesti haitallisten jäsenten, nimittäin Escherichia colin, proteolyyttisten Bacteroides spp. ja Clostridium perfringens/histolyticum -ryhmä määritetään ulosteen mikrofloorassa. Lisäksi mikrobiomin toimintakyky ja vaikutus isännän metaboliseen fenotyyppiin määritetään 1H-NMR-spektroskopiaan perustuvalla metabonomiialla. Nämä globaalit profiilit sisältävät tietoa, joka liittyy suoraan mikrobien aineenvaihduntaprosesseihin, transgenomissiin vuorovaikutuksiin sekä isännän endogeeniseen aineenvaihduntaan. Tätä ylhäältä alaspäin suuntautuvaa järjestelmäbiologian lähestymistapaa soveltamalla voidaan karakterisoida isännän ja mikrobiotan biokemialliset vasteet prebioottiselle altistukselle.

Suoliston mikrobiotan koostumustutkimukset: Fluoresoivaa in situ -hybridisaatiota (FISH) käytetään tärkeimpien anaerobisten bakteerien tunnistamiseen ja luetteloimiseen ihmistutkimuksissa, ja virtaussytometria mahdollistaa korkean suorituskyvyn ja herkkyyden. Lisäksi sovelletaan täydellistä laadullista yhteisön rakenteen arviointia metagenomisen lähestymistavan avulla käyttämällä korkean kapasiteetin sekvensointia (454-pyrosekvensointi tai vastaava).

1H-NMR-spektroskopiaan perustuvat aineenvaihduntaprofilointitutkimukset: Tässä ehdotuksessa 1H-NMR-spektroskopiaa käytetään ihmiskokeiden aikana kerättyjen biologisten näytteiden globaalien metabolisten allekirjoitusten karakterisoimiseen käyttämällä tavanomaisia ​​yksiulotteisia NMR-kokeita. Suoliston mikrobiologia ja metabonominen tiedot integroidaan käyttämällä datafuusiotekniikoita (esimerkiksi kaksisuuntaista osittaista pienimmän neliösumman monilohkotietoanalyysiä), jotta saadaan aikaan mekaaninen ymmärrys järjestelmätason muutoksista ja optimoidaan kliinisesti merkityksellisen molekyylitiedon erottaminen. Tämän analyysin odotetaan antavan mittarin siitä, kuinka prebioottinen interventio kliinisen tutkimuksen aikana on vaikuttanut ihmisen metabonomiin tavalla, joka on lähempänä "terveyttä".

Immunologiset arvioinnit: Veri- ja ulostenäytteitä käytetään immuunisolumäärän ja -fenotyyppien määrittämiseen. Nämä tiedot osoittavat potilaiden immunologisen tilan milloin tahansa tutkimuksen aikana - mukaan lukien tulehdusongelmat.

Immuunisolualajoukot, jotka ovat vuorovaikutuksessa antigeenin esittelysolupopulaatioiden kanssa: Vertailemme erilaistettujen solutyyppien (ammattimaiset ja stromaaliset) antigeenien esittelyä ja sitä, missä määrin ne ovat vuorovaikutuksessa efektori-T-solualaryhmien kanssa. On todennäköistä, että antigeenin alkuperäinen esittely immuunijärjestelmälle vaihtelee näiden ryhmien välillä, ja näiden vuorovaikutusten kvantifiointi 4-värisen fluoresenssi-immunohistologian avulla antaa mekaanista tietoa näistä prosesseista ja UC-taudin tilan etenemisestä.

Kerättävää dataa ovat bakteeriyhteisöprofiilit, immunologiset markkerit, veri-/seerumimittaukset, vapaaehtoiskyselyt, NMR-pohjaiset metabonomitiedot, mikrobien lopputuotteet ja potilaan oireet. Nämä tiedot ovat enimmäkseen numeerisia ja Excel-laskentataulukoiden muodossa, mutta sisältävät myös spektritietotiedostoja, raakasekvenssitiedostoja ja ruokapäiväkirjatietueita (MS word/REDCap). Tietojen analysointiohjelmisto on SAS (Statistical Analysis Software). Vain metabonominen NMR-spektroskopia ja mikrobien sekvensointidatatiedostot tuottavat kohtalaisen suuria tietomääriä. Tunnistamme yhteisön standardit tietojen muotoilulle mahdollisia talletuksia varten tietovarastoihin.