낭포성 섬유증 환자에서 항생제 치료에 따른 임상경과 및 호흡기 미생물총의 변화

기관지폐 감염은 낭포성 섬유증(CF)의 진화 과정에서 가장 흔하고 심각한 합병증입니다. 병원균 감염에 적합한 항생제의 투여는 관리의 핵심 문제 중 하나입니다. 그러나 CF 환자의 절반 이상이 감염원이 알려지지 않은 만성 호흡기 감염을 가지고 있어 원인 물질에 적응하지 못하는 경험적 항생제 치료가 필요합니다. 최근에 CF 환자의 미생물 작용제의 설명 및 특성화를 위해 새로운 기술 및/또는 새로운 병원체를 감지하고 식별할 수 있는 분자 생물학 기술을 포함한 새로운 기술이 적용되었습니다. 또한 파이로시퀀싱, PCR 증폭 및 복제와 같은 보다 정교한 분자 기술을 통해 이 집단의 만성 기관지폐 감염과 관련된 엄청난 미생물 다양성을 입증할 수 있습니다. 그렇지 않으면, metagenomic 접근법은 이 환자들에서 호흡기 세균총의 놀라운 복잡성과 다소 예상치 못한 풍부한 혐기성 세균, 바이러스 및 박테리오파지를 밝혀냈습니다. 또한, 호흡기 감염 치료를 위해 임상에서 일반적으로 사용되는 일부 항생제가 이러한 박테리오파지를 유도할 수 있음이 밝혀졌으며, 이는 형질도입에 의한 측면 유전자 전달의 존재를 시사합니다. 인간 미생물 군집은 인체와 관련된 미생물 군집의 집합이며 신체의 모든 살아있는 미생물을 나타냅니다. 면역 발달에서의 역할은 최근 이 생태계의 변화가 여러 인간 질병의 진화에 중요한 역할을 한다는 것을 시사하는 것으로 입증되었습니다. 예를 들어, 비만의 경우 장내 인간 미생물총과 숙주의 영양 및 대사 상태 사이에 관계가 있으며 이러한 장내 미생물총의 특정 변경이 이 질병의 메타게노믹 시그니처를 나타낼 수 있음이 밝혀졌습니다. 영양 상태가 종종 손상되고(소화 흡수 장애로 인한 만성 영양실조) 정기적인 항생제 치료를 받는 낭포성 섬유증 환자에서 호흡기 미생물총의 진화는 현재까지 알려지지 않았습니다. 이 생태계와 그 역할의 특성화는 질병의 진화 과정을 이해하는 중요한 단계입니다.

이 중요한 연구의 주요 목적은 프랑스 남부의 5개 지역 치료 센터(CRCM)(Mucomed 네트워크)(센터당 2명의 환자)에서 선별된 제한된 수의 CF 환자로부터 얻은 객담 샘플에서 호흡기 미생물을 설명하고 특성화하는 것입니다. : 성인 6명, 소아 4명), 항생제 치료 전후 임상적, 미생물학적, 기능적 상태가 유사함. 미생물 군집을 분리하고 식별하기 위해 무균 배양 시스템, 아메바에서의 공동 배양을 포함한 다양한 미생물학적 도구가 사용될 것입니다. 박테리아의 식별은 MALDI-TOF 질량 분석법 및/또는 분자 기술을 사용하여 수행됩니다. 또한, 16S rRNA PCR 증폭 후 동일한 가래 샘플에서 PCR 산물을 클로닝 및 시퀀싱하여 분자 방법을 사용하여 식별된 박테리아 종을 식별하고 비교합니다. 두 번째 단계에서, 일단 호흡 미생물군이 특성화되면 프로젝트의 첫 번째 단계에서 식별된 모든 박테리아를 감지하고 CF 환자의 더 큰 코호트에 대한 관련성을 평가할 수 있는 전용 마이크로어레이를 개발하는 것이 흥미로울 것입니다. 처방된 항생제 치료에 따른 환자의 호흡기 미생물군과 임상 상태 간의 상관관계를 연구함으로써

이 연구는 새로운 임상적 관점을 열어줄 것이며 지역 의료 관행에 따라 치료 중 미생물군 진화에 대한 항생제의 잠재적 역할을 결정하는 데 도움이 될 것입니다. 이것은 이러한 만성 호흡기 감염의 진화에서 미생물군의 역할을 더 잘 이해하는 데 기여할 것입니다. 복잡한 미생물 군집의 균형을 고려하고 항생제 요법에 따라 진화할 수 있는 혁신적인 치료 전략을 위한 첫 번째 단계가 될 수 있습니다. 또한 CF에서 특정 병원체의 전파에 대한 더 큰 예방 전략의 일부를 형성할 수 있습니다.