Wpływ wariantów OCTN2 na stan karnityny i trójglicerydy w osoczu
11 września 2012 zaktualizowane przez: University of California, San Francisco
Obecne badanie jest częścią dużego grantu obejmującego wielu badaczy, mającego na celu zbadanie farmakogenetyki wielu transporterów błonowych.
Wcześniej badacze zrekrutowali kohortę zdrowych ochotników (Studies of Pharmacogenetics in Ethnically-Diverse Populations, lub SOPHIE) i ponownie zsekwencjonowali region kodujący wielu genów transporterów błonowych, aby zidentyfikować polimorfizmy genetyczne w tych genach.
Osoby z tej kohorty zgodziły się zostać wezwane do ponownej rekrutacji do dalszych badań w oparciu o ich własną sekwencję genetyczną, co umożliwiło badaczom prospektywne badanie wpływu polimorfizmów genetycznych na poszczególne fenotypy (tj. badania genotyp-fenotyp).
Badacze planują zastosować podejście od genotypu do fenotypu, aby zbadać wpływ określonych polimorfizmów w nowym genie transportera kationów organicznych 2 (OCTN2) na metabolizm karnityny i lipidów u zdrowych osób.
Przegląd badań
Status
Zakończony
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Chociaż OCTN2 jest dość dobrze zbadany w związku z SCD, niewiele wiadomo na temat częstotliwości przenoszenia chorobotwórczych alleli OCTN2 lub bardziej powszechnych funkcjonalnych polimorfizmów w tym genie.
Aby rozwiązać te problemy, przeprowadziliśmy badania przesiewowe pod kątem wariantów genetycznych w regionie kodującym OCTN2 poprzez bezpośrednie sekwencjonowanie egzonów i flankującego regionu intronowego OCTN2 w dużej próbce (n = 276) osobników zróżnicowanych etnicznie.
Ponadto ustaliliśmy linie komórek limfoblastoidalnych od osobników homozygotycznych pod względem któregokolwiek allelu wcześniej zidentyfikowanego wariantu regionu promotora, -207G> C.
Znaleźliśmy osiem wariantów sekwencji aminokwasowych OCTN2, z których trzy (Phe17Leu, Leu144Phe i Pro549Ser) były polimorficzne w co najmniej jednej grupie etnicznej.
Podczas testowania aktywności funkcjonalnej przez ekspresję w ludzkich zarodkowych komórkach nerki 293, przy użyciu jako sond zarówno endogennego substratu (l-karnityny), jak i organicznego kationu tetraetyloamoniowego, trzy warianty wykazały różnice funkcjonalne od referencyjnego OCTN2 (Phe17Leu, Tyr449Asp, Val481Phe; p < 0,05).
Dalsze badania polimorfizmu Phe17Leu wykazały zmniejszenie V(max) dla transportu l-karnityny do około 50% referencyjnego OCTN2.
Badania mikroskopii konfokalnej z użyciem białka fuzyjnego OCTN2-GFP wykazały, że Phe17Leu miał odrębną lokalizację subkomórkową od referencyjnego OCTN2, z rozlanym zatrzymywaniem cytoplazmatycznym Phe17Leu, w przeciwieństwie do referencyjnego OCTN2, który lokalizował się specyficznie w błonie plazmatycznej.
Limfoblasty od osób homozygotycznych pod względem allelu -207G wykazywały zwiększony transport l-karnityny w porównaniu z homozygotami -207C/C (p < 0,05).
Badanie to sugeruje, że chociaż mutacje powodujące utratę funkcji w OCTN2 prawdopodobnie będą rzadkie, powszechne warianty OCTN2 występujące w zdrowych populacjach mogą przyczyniać się do różnic w rozmieszczeniu karnityny i niektórych leków stosowanych klinicznie.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Rzeczywisty)
16
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
California
-
San Francisco, California, Stany Zjednoczone, 94143
- San Francisco General Hospital
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
18 lat do 40 lat (DOROSŁY)
Akceptuje zdrowych ochotników
Tak
Płeć kwalifikująca się do nauki
Wszystko
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Zdrowe osoby na wyniki badań laboratoryjnych i kwestionariusz zdrowotny
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Wcześniejszy udział w badaniu „SOPHIE”.
- W wieku od 18 do 40 lat
- Mieć wstępnie wybrany genotyp dla OCTN1 i OCTN2
- Zostali wybrani jako zdrowi na podstawie kwestionariusza historii medycznej i przesiewowych badań krwi (morfologia krwi [CBC], kompleksowy panel metaboliczny).
Kryteria wyłączenia:
- Ciąża w czasie badania
- Mają nową historię wskazującą, że nie są już zdrowi
- Przyjmowanie leku, który może zafałszować wyniki badania
- Osoby z niedokrwistością (hemoglobina < 12 g/dl), zwiększeniem aktywności enzymów wątrobowych ponad dwukrotnie w stosunku do odpowiedniej wartości normalnej lub podwyższonym stężeniem kreatyniny (mężczyźni ≥ 1,5 mg/dl, kobiety ≥ 1,4 mg/dl).
- Nie wyrażaj zgody na udział w badaniu.
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Post
Inne: Pobieranie krwi i moczu na czczo
|
Nie dotyczy brak wydanych leków
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów
1 stycznia 2005
Zakończenie podstawowe (RZECZYWISTY)
1 lutego 2008
Ukończenie studiów (RZECZYWISTY)
1 lutego 2008
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
14 września 2005
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
14 września 2005
Pierwszy wysłany (OSZACOWAĆ)
16 września 2005
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (OSZACOWAĆ)
13 września 2012
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
11 września 2012
Ostatnia weryfikacja
1 września 2012
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Inne numery identyfikacyjne badania
- 1005
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .