COVID-19/DARTS 的诊断(SARS-CoV-2 爆发快速检测的开发和评估)
SARS-CoV-2 爆发快速检测 (DARTS) 的开发和评估
该项目将评估用于检测新型冠状病毒 (2019 nCoV) 的即时/即时 (POC/PON) 测试。 我们正在与 Mologic Ltd 合作,后者得到了 DFID/Wellcome Trust 的资助,开发一种快速、准确且成本低的侧流分析 (LFA),可在不到 5 分钟的时间内检测针对 SARS-CoV-2 的病毒循环抗原和 IgM/G 15分钟。
这些 POC/PON 测试旨在对发烧和/或咳嗽患者进行快速分类,并确定可能对先前感染免疫的患者。 除此之外,POC/PON 测试将被设计为自测试,提供在家庭和社区环境中实现广泛部署的额外好处。 此外,我们将评估同样由 Mologic 生产的 ELISA 检测方法,用于检测针对 SARS-CoV-2 的 IgG 和 IgM(可能还有 IgA)。 随着时间的推移,抗体和抗原动力学的比较将与 ELISA 和定量 RT-PCR 进行比较。
研究概览
地位
条件
详细说明
2020 年 1 月 12 日,一种新型冠状病毒被确定为导致中国湖北省武汉市爆发不明原因肺炎的原因。 这种冠状病毒后来被命名为 SARS-CoV-2,它引起的疾病是 COVID-19。
SARS-CoV-2 是一种不分节段的正义 RNA 病毒,是冠状病毒家族的一部分。 与系统性急性呼吸系统综合症 (SARS) 病毒类似,它与位于 II 型肺泡细胞和肠上皮细胞上的血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 受体结合。 SARS-CoV-2 可导致严重的急性呼吸窘迫综合征 (ARDS),其特征是弥漫性肺泡损伤和对肺细胞的直接病毒细胞病变效应。 一些患上 COVID19 的患者可能会出现暴发性“细胞因子风暴”反应。
截至 2020 年 3 月 23 日,168 个国家共报告了 374,921 例 COVID-19 病例,死亡总数超过 16,411 例(确诊病例中的病死率为 4.4%)(约翰霍普金斯冠状病毒资源中心)。 中国大陆以外的国家报告了超过 293,425 例病例和 13,258 例死亡病例。 世界卫生组织 (WHO) 于 3 月 12 日宣布 SARS-CoV-2 爆发为国际关注的突发公共卫生事件 (PHEIC) [4]。 欧洲已迅速成为大流行的中心,而在英国,病例每天都在增加。 截至 2020 年 3 月 23 日,英国已有 6,724 例确诊病例,其中包括圣乔治医院 NHS 信托基金的 190 例确诊住院患者(2020 年 3 月 23 日,Breathnach 博士,个人通讯)。
由于缺乏经过验证的血清学检测,无症状感染者的实际人数和比例仍然未知。 这意味着准确的病例死亡率估计仍然难以捉摸。 由于诊断样本数量的增加,测试花费的时间比预期的要长。 促进公共卫生干预的首要任务之一是可靠的实验室诊断。 及时确定病例对于确保快速有效地追踪接触者、根据世卫组织建议实施感染预防和控制措施以及收集相关流行病学和临床信息是必要的。
由于缺乏经过验证的血清学检测,无症状感染者的实际人数和比例仍然未知。 这意味着准确的病例死亡率估计仍然难以捉摸。 由于要诊断的样本数量增加,测试花费的时间比预期的要长。 促进公共卫生干预的首要任务之一是可靠的实验室诊断。 及时确认病例对于确保快速有效地追踪接触者、根据世卫组织建议实施感染防控措施以及收集相关流行病学和临床信息是必要的。
中国的经验是,约 15% 的确诊感染患者会发展为重症,约 5% 会转为危重症。 在英国,帝国理工学院 COVID-19 应对小组的模型分析表明,即使实施自我隔离措施(家庭隔离和社会隔离),普通病房和 ICU 病床的激增限制仍将超过 8 倍. 此外,在出现有效疫苗之前,放松这些缓解措施可能会导致病例反弹——预计在 12 至 18 个月内不会出现这种情况。 因此,我们可以清楚地预计,未来几个月英国将有大量感染 COVID-19 的住院患者。
SARS-CoV-2抗原和抗体横向流动分析(LFA)的开发由总部位于贝德福德的 Mologic 公司领导。 我们将使用准备好进行初步评估的原型 LFA 和 ELISA,随后在现场使用这些测试来评估 POC 的测试。 LFA 已开发用于检测咽喉/鼻拭子中的 SARS-CoV-2 抗原,检测血液/血清中的 IgG 和 IgM,以及检测唾液中的 SARS-CoV-2 抗原、IgG、IgM 和 IgA。 唾液是一种令人兴奋的样本,因为它比血液或咽喉/鼻拭子更容易用于潜在的自我检测。
此外,目前尚不清楚为什么有些患者会出现严重的 COVID-19,而其他受相同 SARS-CoV-2 感染影响的患者仅表现出轻微症状。 高血压、肾病和糖尿病等合并症与较差的预后和临床结果有关。 然而,一部分年龄较小且没有合并症的患者也会发展为严重疾病,因此需要更深入地了解严重 COVID-19 感染的免疫发病机制。
使用本研究中开发的诊断方法将改善 COVID-19 病例的管理。 LFA 快速、易于使用且设计为在全球范围内都能负担得起。 通过抗原检测快速诊断 SARS-CoV-2 将使患者能够在医院、全科医生诊所和移民区等其他地方快速分诊。 它们足够便宜,适合在低收入和中等收入国家使用。 抗体检测的使用将允许诊断对急性感染的免疫反应以及患者后来康复后的反应。 为了适当地利用这些测试,了解动态免疫病理学随时间的变化是必要的。
在具有不同疾病严重程度的大型队列中,免疫反应和易感性的特征及其与病毒清除和疾病进展的关联对于辅助临床风险预测结果和评估新型免疫治疗干预措施的潜力非常重要。 免疫反应特征可能具有预测和预后价值,早期适应性免疫反应可能与改善的临床结果相关。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习地点
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-
London、英国、SW17 0RE
- St. Georges Hospital Foundation Trust
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
患者人数将包括需要进行 SARS-CoV-2 检测的圣乔治医院信托基金 (SGHFT) 住院患者。
医疗保健专业人员人群将包括在 SARS-CoV-2 爆发期间在圣乔治医院基金会信托基金 (SGHFT) 工作的疑似或确诊 SARS-CoV-2 病例的工作人员。
描述
==纳入标准=========
阴性 SARS-CoV-2:
- 年满 18 岁或以上
- SGHFT SWLP 实验室收到的样本的 SARS-CoV-2 阴性结果
阳性 SARS-CoV-2:
- 年满 18 岁或以上
- SGHFT SWLP 实验室收到的样本的 SARS-CoV-2 阳性结果
- 需要在 SGHFT 住院
疑似或确诊 SARS-CoV-2 的 HCP:
- 年满 18 岁
- 在 SGHFT 的 SWLP 实验室收到的标本中 SARS-CoV-2 结果呈阳性或疑似诊断为 COVID-19 的工作人员
==排除标准=========
阴性 SARS-CoV-2:
- 未满 18 岁
- 门诊病人
- 已知免疫抑制史
阳性 SARS-CoV-2:
- 未满 18 岁
- 鉴于参加医疗团队,患者不太可能存活 >28 天
- 门诊病人
- 预计在 72 小时内转移到另一家医院
- 已知免疫抑制史
疑似或确诊 SARS-CoV-2 的 HCP:
- 未满 18 岁
- 已知免疫抑制史
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
|---|
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SARS-CoV-2 阴性住院患者
SARS-CoV-2 检测呈阴性的住院成年患者。
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SARS-CoV-2 阳性住院患者
SARS-CoV-2 检测呈阳性的住院成年患者。
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SARS-CoV-2 疑似或确诊 NHS 工作人员
医疗保健专业人员和实验室工作人员中疑似或证实的 SARS-CoV-2 阳性病例。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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SARS-CoV-2 抗体滴度
大体时间:第 3 天后基线样本
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基线样本后第 3 天的抗体滴度。
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第 3 天后基线样本
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SARS-CoV-2 抗体滴度
大体时间:第 5 天后基线样本
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基线样本后第 5 天的抗体滴度。
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第 5 天后基线样本
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SARS-CoV-2 抗体滴度
大体时间:第 7 天后基线样本
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基线样品后第 7 天的抗体滴度。
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第 7 天后基线样本
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SARS-CoV-2 抗体滴度
大体时间:第 10 天后基线样本
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基线样品后第 10 天的抗体滴度。
|
第 10 天后基线样本
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SARS-CoV-2 抗体滴度
大体时间:基线样本后第 14 天
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基线样本后第 14 天的抗体滴度。
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基线样本后第 14 天
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SARS-CoV-2 抗体滴度
大体时间:第 28 天基线样本
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基线样品后第 28 天的抗体滴度。
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第 28 天基线样本
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SARS-CoV-2 抗体滴度
大体时间:第 56 天后基线样本
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基线样品后第 56 天的抗体滴度。
|
第 56 天后基线样本
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其他结果措施
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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抗原动力学
大体时间:第 3、5、7、10、14、28 和 56 天后基线样本
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病毒 (SARS-CoV-2) 抗原随时间的动态变化
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第 3、5、7、10、14、28 和 56 天后基线样本
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HLA-KIR相互作用
大体时间:第 3、5、7、10、14、28 和 56 天后基线样本
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检查与 CD8 抗病毒反应相关的 HLA-KIR 相互作用
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第 3、5、7、10、14、28 和 56 天后基线样本
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血浆细胞因子水平
大体时间:第 7 天、第 14 天和可选的第 28 天。
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血浆细胞因子水平(例如
IL-1、IL-6、TNF-α、TGF-β)通过 Luminex 多重和/或 ELISA 测定法测量并以 ug/ml 表示
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第 7 天、第 14 天和可选的第 28 天。
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转录组
大体时间:第 7 天、第 14 天和可选的第 28 天。
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将分离总 RNA,然后用于 cDNA 合成和扩增。
样品将进行 100-bp DNA 测序,测序读数将与参考基因组对齐,并使用开源软件分析差异表达的基因。
然后将进行通路富集分析,并应用异构体混合概率框架来评估替代转录事件。
差异基因表达分析将识别在 COVID-19 与对照受试者中上调的关键基因,以及在 COVID-19 疾病过程中的不同时间点。
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第 7 天、第 14 天和可选的第 28 天。
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合作者和调查者
出版物和有用的链接
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (预期的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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