Diagnostics de COVID-19/DARTS (Développement et évaluation de tests rapides pour l'épidémie de SRAS-CoV-2)

Le 12 janvier 2020, un nouveau coronavirus a été identifié comme la cause d'une épidémie de pneumonie inexpliquée dans la ville de Wuhan, province du Hubei, en Chine. Ce coronavirus a ensuite été nommé SARS-CoV-2, et la maladie qu'il provoque COVID-19.

Le SRAS-CoV-2 est un virus à ARN à sens positif non segmenté et fait partie de la famille des coronavirus. Semblable au virus du syndrome respiratoire aigu systémique (SRAS), il se lie au récepteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) situé sur les cellules alvéolaires de type II et l'épithélium intestinal. Le SRAS-CoV-2 peut entraîner un syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA) sévère qui se caractérise par des lésions alvéolaires diffuses et un effet cytopathique viral direct sur les pneumocytes. Certains patients qui développent le COVID19 peuvent répondre par une réaction fulminante de « tempête de cytokines ».

Au 23 mars 2020, un total de 374 921 cas de COVID-19 ont été signalés dans 168 pays avec un total de plus de 16 411 décès (létalité parmi les cas confirmés de 4,4 %) (Centre de ressources sur le coronavirus de John Hopkins). Plus de 293 425 cas et 13 258 décès ont été signalés dans des pays autres que la Chine continentale. L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré le 12 mars que l'épidémie de SRAS-CoV-2 était une pandémie dans le contexte d'une urgence de santé publique de portée internationale (USPPI) [4]. L'Europe est rapidement devenue l'épicentre de la pandémie et au Royaume-Uni, les cas augmentent chaque jour. Il y avait eu 6 724 cas confirmés au Royaume-Uni au 23 mars 2020, dont 190 patients hospitalisés confirmés au St George's Hospital NHS Trust (23 mars 2020, Dr Breathnach, communication personnelle).

En l'absence de test sérologique validé, le nombre réel, et donc la proportion, de personnes qui développent une infection asymptomatique reste inconnu. Cela signifie qu'une estimation précise de la létalité reste insaisissable. En raison de l'augmentation du nombre d'échantillons de diagnostic, les tests prennent plus de temps que prévu. Parmi les principales priorités pour faciliter les interventions de santé publique figure un diagnostic de laboratoire fiable. Une détermination rapide des cas est nécessaire pour assurer une recherche rapide et efficace des contacts, la mise en œuvre de mesures de prévention et de contrôle des infections conformément aux recommandations de l'OMS et la collecte d'informations épidémiologiques et cliniques pertinentes.

En l'absence de test sérologique validé, le nombre réel, et donc la proportion, de personnes qui développent des infections asymptomatiques reste inconnu. Cela signifie qu'une estimation précise de la létalité reste insaisissable. En raison de l'augmentation du nombre d'échantillons à diagnostiquer, les tests prennent plus de temps que prévu. Parmi les principales priorités pour faciliter les interventions de santé publique figure un diagnostic de laboratoire fiable. Une confirmation rapide des cas est nécessaire pour assurer une recherche rapide et efficace des contacts, la mise en œuvre de mesures de prévention et de contrôle des infections conformément aux recommandations de l'OMS et la collecte d'informations épidémiologiques et cliniques pertinentes.

L'expérience en Chine montre qu'environ 15 % des patients dont l'infection est confirmée développent une maladie grave et environ 5 % tombent gravement malades. Au Royaume-Uni, une analyse de modélisation par l'équipe d'intervention COVID-19 de l'Imperial College suggère que même avec la mise en œuvre de mesures d'auto-isolement (quarantaine domestique et distanciation sociale), les limites de surtension pour les services généraux et les lits de soins intensifs seront dépassées par 8. . De plus, un assouplissement de ces mesures d'atténuation est susceptible d'entraîner un rebond des cas jusqu'à ce qu'il y ait un vaccin efficace - ce qui n'est pas attendu avant 12 à 18 mois. Nous pouvons donc clairement nous attendre à un nombre important de patients hospitalisés infectés par le COVID-19 au Royaume-Uni dans les mois à venir.

Le développement du test de flux latéral (LFA) de l'antigène et des anticorps du SARS-CoV-2 a été dirigé par Mologic, une société basée à Bedford. Nous utiliserons des prototypes LFA et ELISA qui sont prêts pour une évaluation préliminaire, et utiliserons ensuite ces tests sur site pour évaluer le test au POC. Les LFA ont été développés pour la détection de l'antigène SARS-CoV-2 dans les prélèvements de gorge/nez et la détection des IgG et IgM dans le sang/sérum et la détection de l'antigène SARS-CoV-2, IgG, IgM et IgA dans la salive. La salive est un échantillon passionnant à utiliser car il est beaucoup plus facile à utiliser que les prélèvements de sang ou de gorge / nez pour un autotest potentiel.

De plus, on ignore actuellement pourquoi certains patients développent un COVID-19 sévère, tandis que d'autres touchés par la même infection par le SRAS-CoV-2 ne présentent que des symptômes bénins. Les comorbidités telles que l'hypertension, les maladies rénales et le diabète ont été associées à un pronostic et à des résultats cliniques plus faibles. Cependant, une proportion de patients plus jeunes et sans comorbidités développent également une maladie grave - et il est important de mieux comprendre l'immunopathogénie de l'infection grave au COVID-19.

L'utilisation des diagnostics développés dans le cadre de cette étude permettra d'améliorer la prise en charge des cas de COVID-19. Les LFA sont rapides, faciles à utiliser et conçus pour être abordables à l'échelle mondiale. Le diagnostic rapide du SRAS-CoV-2 avec détection d'antigène permettra aux patients d'être rapidement triés à l'hôpital, dans les cabinets médicaux et dans d'autres endroits tels que les zones d'immigration. Ils sont suffisamment bon marché pour convenir à une utilisation dans les pays à revenu faible ou intermédiaire. L'utilisation de la détection d'anticorps permettra à la fois de diagnostiquer la réponse immunologique aux infections aiguës et après la guérison ultérieure des patients. Pour utiliser ces tests de manière appropriée, une compréhension des changements immunopathologiques dynamiques au fil du temps est nécessaire.

La caractérisation de la réponse immunitaire et de la sensibilité et son association avec la clairance virale et la progression de la maladie dans de grandes cohortes avec une gravité variée de la maladie sont importantes pour aider les résultats de prédiction des risques cliniques et évaluer le potentiel de nouvelles interventions immunothérapeutiques. Les caractéristiques de la réponse immunitaire peuvent avoir une valeur prédictive et pronostique, les réponses immunitaires adaptatives précoces pouvant être corrélées à l'amélioration des résultats cliniques.