Nukleinsyreamplifikationstest (NAAT'er) til diagnosticering af pharyngeale og rektale klamydia- og gonoréinfektioner

I den sidste del af 1990'erne blev testning for Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae infektioner revolutioneret ved introduktionen af ​​nukleinsyreamplifikationstest (NAAT'er), som opnår større følsomhed end traditionelle dyrkningsmetoder ved eksponentielt at replikere nukleinsyren i disse organismer. De prøver, der indsamles til NAAT'er, er nemmere at transportere, og NAAT'er tillader indsamling af mindre invasive prøver til testning (dvs. tømt urin eller patientopsamlede vaginale podninger til kvinder i stedet for urethrale eller endocervikale podninger). På trods af deres noget højere omkostninger har disse test vist sig at være foretrukket af patienter (fordi prøver kan indsamles mindre invasivt), af klinikere (på grund af både deres lette indsamling og øgede følsomhed) og for at tillade udvidet screening både i traditionel klinisk indstillinger og på opsøgende steder, hvor der ikke typisk er blevet testet tidligere.

NAAT'er er blevet godkendt af FDA til test af genitale prøver (cervikale og mandlige urethrale podninger og urin), men ydeevnen af ​​NAAT'er er ikke blevet tilstrækkeligt evalueret til diagnosticering af C. trachomatis og N. gonorrhoeae-infektioner, der forekommer på rektale eller pharyngeale steder med seksuelle eksponering. Et stigende antal heteroseksuelle individer kan være involveret i orogenital eller rektal seksuel aktivitet, især teenagere og unge voksne, som kan betragte sådanne eksponeringer som mindre risikable med hensyn til graviditet og seksuelt overførte sygdomme (STD) end penis-vaginalt samleje. Svælg- og rektale eksponeringer, ofte uden brug af kondomer, er relativt almindelige blandt MSM. Nylig demonstration af genopblussende seksuelt overførte sygdomme og usikker seksuel praksis blandt mænd-der-har-sex-med-mænd (MSM), herunder dem, der er inficeret med den humane immundefektvirus (HIV), giver en særlig stærk folkesundhed, der er absolut nødvendig for behov for omhyggelig evaluering af NAAT'er med pharyngeale og rektale prøver.

Det primære formål med denne undersøgelse er at sammenligne ydeevnen af ​​de tre NAAT'er, der er kommercielt tilgængelige til at teste svælg- og rektaleprøver for C. trachomatis- og N. gonorrhoeae-infektioner med kultur, den aktuelle valgte metode og med hinanden. For at tilmelde et tilstrækkeligt antal personer med sådanne infektioner, vil undersøgelsen blive udført i en 3-årig periode på en STD-klinik og to HIV-klinikker i Birmingham, AL. Tilmelding vil være begrænset til personer, der har høj risiko for genital C. trachomatis eller N. gonorrhoeae-infektion, eller som har en historie med orogenitale eller rektale seksuelle eksponeringer. Der vil blive gjort en indsats for at balancere tilmelding af heteroseksuelle individer og MSM, men ressourcebegrænsninger kræver, at stikprøvestørrelser er baseret på at kombinere disse undergrupper.

Der eksisterer ingen passende kriteriestandard for pharyngeale eller rektale infektioner på grund af den sandsynlige, men dårligt definerede, lave følsomhed af den nuværende standardkultur. Heldigvis anvender de 3 NAAT'er forskellige C. trachomatis og N. gonorrhoeae molekylære mål og metoder til nukleinsyreamplifikation. Ved at inkludere alle 3 NAAT'er plus kultur i undersøgelsen kan kombinationer af resultaterne af kultur og en NAAT eller af to NAAT'er udnyttes til at drage fordel af den sandsynlige uafhængighed af testfejl blandt virkelig uinficerede forsøgspersoner til at konstruere mere tilfredsstillende kriteriestandarder for infektion for formålet med at estimere og sammenligne deres følsomheder og specificiteter. Et sekundært formål med undersøgelsen vil være at sammenligne denne metodiske tilgang, ved at anvende en traditionel statistisk og klinisk epidemiologisk tilgang, med alternative metoder, der er blevet mere udbredt, men stærkt kritiseret af statistikere og kliniske epidemiologer, og med nyere metoder designet til at imødekomme disse kritikpunkter og at være mere effektiv end de traditionelle statistiske tilgange.