Nutzung der Darmmikrobiota und ihrer Metaboliten bei Beckenkrebs
Der Dickdarm ist der letzte Teil des Verdauungstraktes. Es absorbiert Wasser und Nahrungssubstanzen. Allerdings sind dort auch die meisten unserer Bakterien angesiedelt. Diese Bakterien sind wichtig für unsere Gesundheit und beeinflussen viele verschiedene Krankheiten, darunter Dickdarmkrebs, Colitis ulcerosa und Morbus Crohn. Die Darmbakterien können möglicherweise auch das Ansprechen auf Behandlungen bei anderen Krebsarten beeinflussen, indem sie dazu beitragen, das Ansprechen auf Strahlen- und Chemotherapie zu verändern. Die Wechselwirkungen zwischen diesen Bakterien und dem Rest unserer Zellen werden erst jetzt verstanden, und es gibt wenig Forschung zu den Wechselwirkungen zwischen diesen Bakterien und Strahlentherapiebehandlungen bei Beckenkrebs.
Wir werden dies daher genauer untersuchen. Vor der Behandlung von Beckenkrebs bitten wir um Kotproben des Patienten. Dazu gehören Patienten mit Blasen-, Prostata-, Gebärmutterhals-, Eierstock-, Gebärmutter- oder Darmkrebs. Auf diese Weise werden wir in der Lage sein, das Profil von Darmbakterien mit den Reaktionen auf Behandlungen zu vergleichen und so unser Verständnis der Dickdarmbakterien zu erweitern.
Dazu verarbeiten wir die Kotproben, um das bakterielle genetische Material (DNA) der Bakterien zu entfernen, und verarbeiten es auf einer Maschine, um den genetischen Code zu lesen und auch die Metaboliten zu untersuchen, die sie produzieren werden. Wir können dann einen direkten Vergleich zwischen verschiedenen Proben der relativen Anzahl verschiedener vorhandener Bakterien anstellen. In einigen Fällen werden wir dies mit Metaboliten und Entzündungs- und Immunmarkern vergleichen, die in einer Blutprobe identifiziert wurden. Diese Arbeit könnte zukünftigen Patienten helfen, indem sie bestimmt, welche Bakterien während der Krebsbehandlung am besten im Dickdarm vorhanden sind. Diese könnten möglicherweise Patienten vor ihrer Krebsbehandlung in Form von probiotischen Medikamenten verabreicht werden, falls sich in unserer Forschung eine Verbesserung zeigt. Alternativ könnten wir die Aufnahme bestimmter Ballaststoffe durch die Patienten ändern, um diese Bakterien gezielt zu fördern.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Die University of Aberdeen und Aberdeen Royal Infirmary (ARI) im NHS Grampian befinden sich in der einzigartigen Lage, einen einzigen Campus für mikrobiotabezogene Laborwissenschaften am weltberühmten Rowett Institute, Biorepository-Einrichtungen auf dem Campus für die schnelle Probenverarbeitung und NHS-Einrichtungen zu haben zur Behandlung mehrerer Arten von Beckentumoren, einschließlich kolorektaler, gynäkologischer und urologischer.
Die Patienten werden in ihren jeweiligen Kliniken für Beckenkrebs angesprochen, nachdem sie für eine potenzielle Aufnahme beim Treffen des jeweiligen multidisziplinären Teams (MDT) identifiziert wurden. Der Patient wird von einem für seine Pflege verantwortlichen Kliniker (kann eine klinische Krankenschwester umfassen) über seine Diagnose und seinen Behandlungsplan informiert. Patienten werden erst bei einem Folgetermin auf die Forschung angesprochen, z.B. Wenn die spezialisierten Pflegekräfte den Patienten kontaktieren, um weitere Fragen zum besprochenen Behandlungsplan zu klären, besuchen sie die Beratungsklinik, um der endgültigen Behandlung zuzustimmen usw. Dies gibt dem Patienten ausreichend Zeit, um seine Diagnose und seinen Behandlungsplan zu bearbeiten, bevor er die Forschung einleitet. Bei diesem Treffen wird den Patienten das PIS ausgehändigt (dieses wird dem Patienten per Post zugeschickt, wenn das Treffen per Videokonferenz stattfindet). Wenn sie bereit sind, eine Beteiligung in Betracht zu ziehen, werden sie von einer Forschungskrankenschwester oder einem anderen entsprechend qualifizierten Teammitglied kontaktiert, die die Studie weiter besprechen und alle Fragen beantworten werden. Wenn sie zur Teilnahme bereit sind, werden Vorkehrungen getroffen, dass ein Mitglied des klinischen Teams eine schriftliche Einverständniserklärung einholt, wenn der Patient für einen späteren klinischen Termin ins Krankenhaus kommt.
Sie werden gebeten, vor Beginn ihrer nächsten Krebstherapie eine Kotprobe (und bei einer Untergruppe von Darmpatienten eine Probe des rechtsseitigen Dickdarminhalts, die zum Zeitpunkt ihrer Operation entnommen wurde) zur Verarbeitung in der Abteilung für Humanernährung des Rowett Institute zu spenden (Chemotherapie, Strahlentherapie oder Operation). Auch zur Entnahme einer Blutprobe wird eine Einwilligung eingeholt. Dies wird normalerweise aus klinischen Gründen während einer routinemäßigen Aderlassentnahme gewonnen und ist ein Blutüberschuss für klinische Anforderungen, der vom Biorepository verarbeitet wird. Wenn Blut nicht im Rahmen der klinischen Standardversorgung entnommen wird, wird gegebenenfalls eine zusätzliche Venenpunktion von 5 ml angefordert. Das Blut wird für die Plasmaextraktion aufbereitet.
Die Patienten werden auch ermutigt, einen optionalen Fragebogen zur Häufigkeit der Ernährung (FFQ) auszufüllen, der angibt, was sie in den drei Monaten vor der Entnahme ihrer Stuhlproben gegessen und getrunken haben. Wenn sie sich jedoch nicht dazu in der Lage fühlen, wird ihre Entscheidung respektiert und sie können die Studie fortsetzen. Das Ausfüllen dieser Fragebögen dauert etwa 30 Minuten und wird den Patienten entweder während eines klinischen Termins vor ihrer ersten Krebstherapie ausgehändigt oder per Post zugeschickt. Eine Untergruppe von Patienten wird auch gefragt, ob sie bereit wären, an den vier Tagen vor der Abgabe der Stuhlprobe eine eingehendere Beurteilung ihrer Ernährung abzugeben, aber sie werden darauf hingewiesen, dass dies optional ist und sie ablehnen können .
Am Tag eines Kliniktermins oder der Erstbehandlung des Patienten werden Stuhlproben aus dem ARI entnommen und ins Krankenhaus gebracht. Alternativ kann der Teilnehmer die Probe bei einem bestimmten Abgabezentrum im Rowett Institute abgeben. Dies wird dem Ermessen des Teilnehmers überlassen, was für ihn am bequemsten ist. Ausgefüllte Ernährungstagebücher/Fragebögen werden ebenfalls zur gleichen Zeit und am selben Ort wie die Abgabe der Kotprobe eingesammelt.
Es sind keine weiteren zusätzlichen Proben vom Patienten erforderlich. Nach Erhalt der Proben wird am Rowett Institute ein Teil von Dispomix für die DNA-Extraktion unter Verwendung von Powersoil-DNA-Extraktionskits verarbeitet und vor der Analyse durch 16S-rRNA-Gensequenzierung in Gefrierschränken gelagert. Ein weiterer Teil wird verarbeitet und für die SCFA-Analyse durch Gaschromatographie gelagert, und ein Teil der verbleibenden Fäkalien wird für zukünftige Analysen gelagert.
Plasma wird aus den Blutproben aus den NHS-Hämatologielabors entnommen und von dem an der Studie beteiligten Forschungsteam an das Rowett Institute übertragen. In Situationen, in denen keine Blutprobe für klinische Zwecke entnommen wurde, wird die Blutprobe von einem Phlebotomisten oder anderem geschultem Personal der Abteilung für Humanernährung des Rowett Institute entnommen. Nach der Plasmagewinnung werden die Blutproben im Rowett Institute in Gefrierschränken gelagert.
Die 16S-rRNA-Gensequenzierung von Fäkal-DNA wird am Centre for Genome Enabled Biology and Medicine (CCEBM) der Universität Aberdeen durchgeführt, einschließlich bioinformatischer Analysen. Mithilfe der 16S-rRNA-Gensequenzierung wird ein kleiner Teil des bakteriellen genetischen Materials untersucht, das sich zwischen verschiedenen Bakterien unterscheidet, was es uns ermöglicht, die „relative Häufigkeit“ jedes einzelnen in jeder Probe abzuschätzen. Wir werden auch SCFAs in Fäzes durch GC und Plasma durch GC-MS (diese empfindlichere Technik ist für Plasma aufgrund der geringeren Konzentrationen der vorhandenen Metaboliten erforderlich) in der Analyseeinrichtung des Rowett Institute analysieren. Wenn am Ende dieser Studie genügend Probe in einem verwendbaren Zustand verbleibt, möchten wir diese für zukünftige Forschung aufbewahren. Nach Erhalt der erforderlichen Finanzierung und Genehmigungen können wir in Zukunft bakterielle DNA detaillierter (auf Spezies-/Stammebene) durch Metagenomik und andere Metaboliten untersuchen, z. Tryptophan, Gallensäuren und entzündliche (z. Calprotectin) und Immunmarker (z. Zytokine).
Klinische Daten werden an der Quelle pseudo-anonymisiert und vom Forschungsteam gesammelt (einschließlich Biobank-Mitarbeitern für Basisdaten und Forschungskrankenschwestern, klinischen Mitarbeitern, Röntgenassistenten usw. für Folgedaten). Dies fließt in die nachfolgende Analyse ein. Das Ansprechen des Tumors und die Nebenwirkungen von Strahlentherapie/Radiochemotherapie oder Operation werden den Patientennotizen entnommen, um die Toxizität und die Ergebnisse zu untersuchen, und einige Patienten wurden gebeten, Fragebögen als Teil ihrer routinemäßigen klinischen Nachsorge, wie z. B. dem RTOG, auszufüllen und EPIC26 (Routine in der klinischen Praxis verwendete Fragebögen).
Die 16S-rRNA-Gensequenzierungsdaten werden von Bioinformatikern der University of Aberdeen analysiert, die auf den Umgang mit diesen großen Datensätzen spezialisiert sind, um den Reichtum und die relative Häufigkeit der vorhandenen Bakterien zu bestimmen. Die Daten werden von IT-Diensten auf dem Hochleistungsrechnercluster gespeichert und an ein öffentliches Repository übermittelt. Assoziationen zwischen 16S-rRNA-Gensequenzierungsdaten, SCFA-Analyse und verfügbaren klinischen Daten werden untersucht. Die statistische Analyse wird von Statistikern von Biomathematics and Statistics Scotland durchgeführt
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Scotland
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Aberdeen, Scotland, Vereinigtes Königreich, AB25 2ZN
- Aberdeen Royal Infirmary
-
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Zustimmungswillige Patienten
- Jeder Patient über 16 Jahren, der im NHS Grampian wegen Beckenkrebs (kolorektaler, urologischer oder gynäkologischer) behandelt wird
Ausschlusskriterien:
- Patienten, die einer Teilnahme nicht zustimmen möchten
- Malignome aus anderen Quellen oder anatomischen Lokalisationen
- Patienten, denen das Verständnis der Studie fehlt, um ein angemessenes Maß an Zustimmung zu erhalten
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Kohorte
- Zeitperspektiven: Interessent
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
|---|---|
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Kolorektal
Patienten mit Rektum- oder Dickdarmkrebs
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Es gibt keine Intervention in dieser Studie.
Wir werden Kot und Blut der rekrutierten Patienten gewinnen und die Mikrobiota und ihre Metaboliten darin beurteilen.
Dies ist eine Beobachtungsarbeit
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Gynäkologisch
Patienten mit Gebärmutter-, Eierstock- oder Gebärmutterhalskrebs
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Es gibt keine Intervention in dieser Studie.
Wir werden Kot und Blut der rekrutierten Patienten gewinnen und die Mikrobiota und ihre Metaboliten darin beurteilen.
Dies ist eine Beobachtungsarbeit
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Urologisch
Patienten mit Blasen- oder Prostatakrebs
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Es gibt keine Intervention in dieser Studie.
Wir werden Kot und Blut der rekrutierten Patienten gewinnen und die Mikrobiota und ihre Metaboliten darin beurteilen.
Dies ist eine Beobachtungsarbeit
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Korrelation zwischen mikrobieller Analyse und Ansprechen auf eine Krebstherapie
Zeitfenster: 18 Monate Rekrutierung
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Um zu beurteilen, ob Schlüsselmikroben (analysiert durch Pyrosequenzierung) oder ihre metabolischen Nebenprodukte (analysiert durch die Identifizierung von kurzkettigen Fettsäuren) eine positive oder negative Reaktion auf herkömmliche Therapien und Krebsergebnisse erkennen
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18 Monate Rekrutierung
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Gibt es Unterschiede in der Darmmikrobiota zwischen urologischen, kolorektalen und gynäkologischen Krebserkrankungen?
Zeitfenster: 18 Monate Rekrutierung
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16srRNA-Pyrosequenzierung und Analyse von kurzkettigen Fettsäuren werden für Patienten mit den drei Krebsgruppen durchgeführt.
Diese Daten werden miteinander verglichen, um Ähnlichkeiten oder Unterschiede in der fäkalen mikrobiellen Flora zwischen den Bedingungen zu beurteilen.
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18 Monate Rekrutierung
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: George Ramsay, FRCS, University of Aberdeen
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- 2-066-22
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
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Beschreibung des IPD-Plans
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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