Alternative Splicing Based Prediction of Chemotherapy Response in Gastric Cancer
A Multicenter Observational Study to Develop and Validate an Alternative Splicing-Based Machine Learning Model for Predicting Response to 5-FU-Based Adjuvant Chemotherapy in Gastric Cancer (VERSA-GC Study)
This study aims to develop a model to predict response to chemotherapy in gastric cancer using RNA splicing information from tumor tissue.
By analyzing genetic patterns and applying machine learning, the study seeks to identify patients who are less likely to benefit from treatment, helping guide clinical decision-making.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Yksityiskohtainen kuvaus
This multicenter observational study aims to develop and validate an alternative splicing (AS)-based model to predict response to 5-FU-based adjuvant chemotherapy in stage II/III gastric cancer.
AS events were identified using TCGA SpliceSeq and UCSC Xena data, and selected candidates were quantified by RT-qPCR.
A predictive model was constructed using Elastic Net-based feature selection and XGBoost, and evaluated in independent training and validation cohorts. An integrated model incorporating clinicopathological factors was also developed.
The primary endpoint is treatment response defined by 3-year recurrence-free survival. Patients with recurrence within 3 years are classified as non-responders, and those without recurrence as responders.
This study aims to establish a clinically applicable biomarker for risk stratification and treatment decision support.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Ajay Goel
- Puhelinnumero: 626-256-4673
- Sähköposti: ajgoel@coh.org
Opiskelupaikat
-
-
California
-
Duarte, California, Yhdysvallat, 91016
- Rekrytointi
- City of Hope Medical Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Inclusion Criteria:
- Pathologically confirmed stage II or III gastric cancer
- Underwent curative surgical resection
- Received 5-FU-based adjuvant chemotherapy
- Availability of tumor tissue samples for analysis
Exclusion Criteria:
- History of other malignancies
- Inadequate or poor-quality tissue samples (e.g., contamination)
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Responder
Patients with stage II/III gastric cancer who did not develop recurrence within 3 years after curative surgery following adjuvant chemotherapy.
|
This is an observational study without assigned interventions.
All patients received standard-of-care 5-FU-based adjuvant chemotherapy, and no experimental intervention was performed.
|
|
Non-responder
Patients with stage II/III gastric cancer who developed recurrence within 3 years after curative surgery following adjuvant chemotherapy.
|
This is an observational study without assigned interventions.
All patients received standard-of-care 5-FU-based adjuvant chemotherapy, and no experimental intervention was performed.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Treatment response based on 3-year recurrence-free survival
Aikaikkuna: 3 years after surgery
|
Treatment response was defined based on recurrence-free survival (RFS).
Patients who developed recurrence within 3 years after curative surgery were classified as non-responders, whereas those without recurrence were classified as responders.
|
3 years after surgery
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Diagnostic performance of the predictive model
Aikaikkuna: At model evaluation
|
Model performance was assessed using the area under the receiver operating characteristic curve, sensitivity, and specificity in the training and validation cohorts.
|
At model evaluation
|
|
Recurrence-free survival stratified by predefined model-derived risk score
Aikaikkuna: Up to 5 years after surgery
|
Recurrence-free survival will be evaluated according to the predefined model-derived risk score using Kaplan-Meier survival analysis and Cox proportional hazards models.
Recurrence status within 3 years after surgery will be used to define treatment response.
|
Up to 5 years after surgery
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 23228/VERSA
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .