プロジェクト A4sc - 単一細胞レベルでの航空アトラス (A4sc)

慢性呼吸器疾患の発生率の増加は、子供を含む世界中の何十万人もの人々に影響を与える公衆衛生上の問題です。 大気汚染物質（汚染、アレルゲン）に直接さらされている気道は、周囲の結合組織だけでなく、豊富な免疫環境や微生物叢との複雑な相互作用を展開するさまざまな細胞が関与する複雑な生態系を表しています。 アレルギー疾患などの特定の疾患では、鼻気道と気管支気道の間に病態生理学的連続体が想定されていますが、我々は、鼻サンプルと気管支サンプルの間で遺伝子発現に幅広い勾配があることを確認しました。 これが、呼吸樹全体の細胞の多様性を詳細に研究する必要がある理由です。

特定の細胞に特異的に存在する RNA の配列を決定し、隣接する細胞と比較することで、細胞の寄与と細胞間の関係を正確に記録することができます。 私たちのプロジェクトでは、単一細胞レベルでの遺伝子発現プロファイルの分析（単一細胞RNAシーケンス）を可能にする条件下で、ブラッシングおよび/または生検によって気道スワブを安定化するプロトコルを確立します。

「単一細胞」の安定化および分析プロトコルの開発は、まず初代呼吸器上皮培養物に対して実行され、次に健康なボランティアから採取された呼吸器標本に拡張されます。 呼吸樹のいくつかのレベルでのサンプリングを通じて、気管気管支軸に沿った発現の変動が完全に記録されます。 最後に、上皮コンパートメントと免疫コンパートメントの間の相互作用は、さまざまな生理病理学的状況における単一細胞の遺伝子発現を分析することによって研究されます。