潜在拡散モデルを使用した現実的な HEp-2 細胞画像の生成: 多中心視覚チューリング テスト
潜在拡散モデルを使用して合成された ANA HEp-2 細胞画像の現実性の評価: 多施設視覚チューリング テスト
この前向き観察研究の目的は、抗核抗体 (ANA) Hep-2 細胞免疫蛍光画像のデータ増強に潜在拡散モデルを利用する実現可能性と有効性を厳密に検討することです。 答えようとしている主な質問は次のとおりです。
このようなモデルを適用すると、ANA 関連画像と併用した場合に、データ品質の向上、サンプルの多様性の向上、または後続の分析プロセス (疾患の診断や分類など) の精度と効率の向上が可能になるでしょうか?
調査の概要
状態
介入・治療
詳細な説明
生物医学研究における根本的な問題は、入手可能な生体サンプルの不足、法外なコスト、または倫理的な理由が主な原因で、利用可能な観察数が少ないことです。 生成された in silico サンプルを使用して実際のいくつかの観察を強化すると、より堅牢な分析結果とより高い再現率が得られる可能性があります。 ここで、研究者らは、ANA-IIF 画像データを現実的に生成するために、潜在拡散モデルを使用した教師なし学習を使用することを提案しています。
研究者らは、ANA-IIF 画像 (偽) と本物 (真) を区別するのが難しい場合、生成された ANA-IIF 画像が現実的になるのではないかと仮説を立てています。 この仮説を検証するために、研究者らは、生成された (偽の) 画像の品質を評価するために、多施設視覚チューリング テスト (https://turing.rednoble.net/) を提示しました。
この実験設定により、研究者は生成された ANA-IIF 画像の全体的な品質を検証することができ、その後、(1) 教育目的で細胞病理医を訓練する、(2) ビッグデータを使用して深いネットワークを訓練するための現実的なサンプルを生成するために使用できます。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究場所
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Shanghai Municipality
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Shanghai、Shanghai Municipality、中国、200092
- Department of Clinical Laboratory, Xinhua Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 信頼できる医療機関からの発信
- 関連する資格や資格を保有していること
- 研究室環境における抗核抗体 (ANA) パターンの解釈に 1 年以上の経験がある
除外基準:
- 関連する専門的な認定資格や資格が不足している
- ANAパターン通訳の経験なし
- 視覚的チューリングテストのルールとインフォームドコンセントを受け入れたくない
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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専門家
ANA-IIFの読み取りにおいて20年以上の経験を持つ
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AIモデルの出力結果を参照して、または参照せずにANAパターンのタイプを決定します。
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若手細胞病理学者
5年未満の医学的学業経験
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AIモデルの出力結果を参照して、または参照せずにANAパターンのタイプを決定します。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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拡散モデルにより合成された画像のリアルさ
時間枠:ベースライン
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研究者らは、視覚チューリングテスト法を用いた調査を実施し、アンケート形式で測定し、測定結果を5段階リッカートスケールで評価した。 5 段階リッカート スケールは、5 つの回答オプションを通じて画像の品質に関する参加者の意見を評価します: 本物、かなり似ている、不確実、あまり似ていない、偽物。 これらのオプションに数値 (例: 5 から 1) を割り当ててスコアを計算し、各参加者のスコアを合計します。 結果は、平均スコアを含むスコアの分布を分析し、その信頼性と妥当性を評価することによって評価されます。 さらに、研究者は、精度、再現率、F1 スコア、平均平均精度 (mAP) など、内部モデルの評価に利用される一連のパラメーターを計算しました。 |
ベースライン
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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AI モデルの出力が参加者に与える影響
時間枠:ベースライン
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研究者は、AI モデルによる支援の前後で参加者の解釈の正解率の変化を評価し、比較分析を行います。
さらに、研究者は人間の解釈とモデルの間のカッパ一致係数を計算し、AI の支援を受けた場合にさまざまな経験レベルの細胞病理医の間で精度に差があるかどうかを評価します。
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ベースライン
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ANAパターン解釈にかかった時間
時間枠:ベースライン
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研究者は、AI モデルの介入前後で参加者が通訳を完了するのに要した時間を比較し、AI 支援前の X 分から AI 支援後の Y 分まで、症例あたりの平均通訳時間が短縮されたかどうかを評価しました。
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ベースライン
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協力者と研究者
捜査官
- スタディディレクター:Guangyu Chen, PhD、Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Zeng J, Gao X, Gao L, Yu Y, Shen L, Pan X. Recognition of rare antinuclear antibody patterns based on a novel attention-based enhancement framework. Brief Bioinform. 2024 Jan 22;25(2):bbad531. doi: 10.1093/bib/bbad531.
- Rahman S, Wang L, Sun C, Zhou L. Deep learning based HEp-2 image classification: A comprehensive review. Med Image Anal. 2020 Oct;65:101764. doi: 10.1016/j.media.2020.101764. Epub 2020 Jul 7.
- Hobson P, Lovell BC, Percannella G, Vento M, Wiliem A. Benchmarking human epithelial type 2 interphase cells classification methods on a very large dataset. Artif Intell Med. 2015 Nov;65(3):239-50. doi: 10.1016/j.artmed.2015.08.001. Epub 2015 Aug 13.
- Niehues JM, Muller-Franzes G, Schirris Y, Wagner SJ, Jendrusch M, Kloor M, Pearson AT, Muti HS, Hewitt KJ, Veldhuizen GP, Zigutyte L, Truhn D, Kather JN. Using histopathology latent diffusion models as privacy-preserving dataset augmenters improves downstream classification performance. Comput Biol Med. 2024 Jun;175:108410. doi: 10.1016/j.compbiomed.2024.108410. Epub 2024 Apr 4.
- Selim M, Zhang J, Brooks MA, Wang G, Chen J. DiffusionCT: Latent Diffusion Model for CT Image Standardization. AMIA Annu Symp Proc. 2024 Jan 11;2023:624-633. eCollection 2023.
- Marouf M, Machart P, Bansal V, Kilian C, Magruder DS, Krebs CF, Bonn S. Realistic in silico generation and augmentation of single-cell RNA-seq data using generative adversarial networks. Nat Commun. 2020 Jan 9;11(1):166. doi: 10.1038/s41467-019-14018-z.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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