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Salivary Microbiota and Antimicrobial Resistance in Relation to Chlorhexidine Use (SMARCH)

2026年4月30日 更新者：Masaryk University

Study Protocol for 16S rRNA Sequencing of Healthy Oral Microbiota

This study evaluated the ecological effects of 0.06% chlorhexidine toothpaste on the salivary microbiota of healthy individuals, focusing on taxonomic composition, functional shifts, and prevalence of predicted antimicrobial resistance genes. Saliva samples were collected from eleven healthy participants at three specific time points: baseline (following a 4-week run-in period using a control toothpaste), intervention (after 12 weeks of using 0.06% chlorhexidine digluconate toothpaste), and washout (after a subsequent 12-week period using the control toothpaste). Sequencing targeted the 16S rRNA V3-V4 region.

調査の概要

状態

完了

条件

介入・治療

研究の種類

介入

入学 (実際)

11

段階

  • 適用できない

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究場所

  • チェコ
      • Brno、チェコ、62500
        • Department of Public Health, Faculty of Medicine, Masaryk University
      • Brno、チェコ、62500
        • Skydent s.r.o.

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

  • 大人

健康ボランティアの受け入れ

はい

説明

Inclusion Criteria:

  • Age: Between 25-44 years.
  • General Health: Good systemic health (absence of chronic inflammatory diseases or conditions affecting oral tissues).
  • Oral Hygiene Routine: Participants must perform toothbrushing twice a day and use interdental cleaning aids once a day.
  • Plaque Index (PI): A score of 0.0-0.2 according to Silness and Löe.
  • Gingival Index (GI): A score of 0.0-0.143 according to Silness and Löe.

Exclusion Criteria:

Systemic and Lifestyle Factors:

  • Presence of any chronic systemic disease (e.g., diabetes mellitus, autoimmune disorders)
  • Regular use of medications that may affect gingival status or saliva production.
  • Use of antibiotics within the last 6 months prior to the study.
  • Current pregnancy or lactation.
  • Current smokers or users of other tobacco/nicotine products.

Oral and Dental Factors:

  • Active dental disease: Presence of untreated tooth decay, gingivitis (GI > 0.143), or any form of periodontitis.
  • Prosthetics and Implants: Presence of dental implants, dentures, or significant tooth loss (excluding extracted third molars).
  • Ongoing fixed or removable orthodontic treatment.

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか？

デザインの詳細

  • 主な目的：ヘルスサービス研究
  • 割り当て：なし
  • 介入モデル：単一グループの割り当て
  • マスキング：なし（オープンラベル）

武器と介入

参加者グループ / アーム
介入・治療
実験的：Experimental: Chlorhexidine group
A single group of 11 healthy volunteers. The study consists of three consecutive phases: baseline (4 weeks), intervention with 0.06% chlorhexidine toothpaste (12 weeks), and washout (12 weeks).
薬：0.06% Chlorhexidine Digluconate Toothpaste
Participants used the toothpaste twice daily for 12 weeks.

この研究は何を測定していますか？

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
Change in Salivary Microbial Alpha Diversity (Shannon and Simpson Indices)
時間枠：Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
Evaluation of microbial richness and evenness within individual saliva samples. Alpha diversity is quantified using the Shannon and Simpson indices based on 16S rRNA gene sequencing data. Differences between study phases (baseline, intervention, washout) are assessed using the Kruskal-Wallis test or Mann-Whitney U test, as appropriate, with a significance threshold of p < 0.05.
Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
Change in Salivary Microbial Beta Diversity (Community Structure)
時間枠：Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
Evaluation of differences in microbial community composition between study phases. Calculated using Bray-Curtis dissimilarity on Centered Log-Ratio (CLR) normalized data and assessed via PERMANOVA to detect significant shifts (p < 0.05).
Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
Differential Abundance of Salivary Bacterial Taxa
時間枠：Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
Evaluation of shifts in the relative abundance of bacterial taxa (at phylum, family, genus, and species levels) using 16S rRNA sequencing (V3-V4 region). Statistical analysis is performed using DESeq2 and edgeR to identify significant differences between study phases, with multiple testing corrections applied using the Benjamini-Hochberg (FDR) method (FDR < 0.05).
Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
Changes in Predicted Antimicrobial Resistance Genes (ARGs)
時間枠：Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
Functional prediction of the salivary microbiota conducted using PICRUSt2. Assessment of metabolic potential and antimicrobial resistance pathways with significance assessed using adjusted p-values (p-adj < 0.05).
Baseline (week 0), after intervention (week 12), and after washout (week 24).
Gingival Index (GI) for Clinical Stability Assessment
時間枠：Screening (Week -4) and after washout (Week 24).
Assessment of gingival health using the Silness and Löe Gingival Index (scale 0-3). This measure is used to verify that participants maintain optimal oral health throughout the study. Eligibility is strictly limited to participants with a maximum GI of 0.143 at screening to ensure a healthy baseline and to monitor that no gingival inflammation occurs during the study period.
Screening (Week -4) and after washout (Week 24).
Plaque Index (PI) for Clinical Stability Assessment
時間枠：Screening (Week -4) and after washout (Week 24).
Assessment of dental plaque accumulation using the Silness and Löe Plaque Index (scale 0-3). This measure is used to ensure consistent oral hygiene. Eligibility is strictly limited to participants with a maximum PI of 0.2 at screening. The index is monitored to confirm that participants adhere to the required oral hygiene protocol throughout the study.
Screening (Week -4) and after washout (Week 24).

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

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Masaryk University

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2022年4月11日

一次修了 (実際)

2022年11月29日

研究の完了 (実際)

2022年11月29日

試験登録日

最初に提出

2026年4月30日

QC基準を満たした最初の提出物

2026年4月30日

最初の投稿 (実際)

2026年5月6日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2026年5月6日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2026年4月30日

最終確認日

2026年4月1日

詳しくは

本研究に関する用語

キーワード

その他の研究ID番号

  • 68/2020
  • MUNI/A/1807/2025 (その他の助成金/資金番号：Masaryk University)

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

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