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Fondazione 게놈 SARS-CoV-2 연구(COVID-19) (FOGS)

2025년 4월 29일 업데이트: Luca Valenti:, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico

Fondazione 게놈 SARS-CoV-2 연구

게놈 수준의 유전적 연관(게놈 전체 연관 연구 - GWAS), NGS(전체 엑솜 시퀀싱)에 의한 시퀀싱 및 유전자 발현 연구를 통해 SARS 발생 소인의 주요 유전적 유전적 결정인자(호흡기 부전 발생과 관련된 증상 병리학)를 식별합니다. SARSCoV-2의 영향을 받은 이탈리아 피험자의 경우 모든 수준의 질병).

연구 개요

상세 설명

이탈리아 북부 롬바르디아 지역은 현재 코로나바이러스감염증 2019(COVID-19)를 유발하는 바이러스인 중증급성호흡기증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2)가 발생하고 있습니다. 코로나19 전염병 상황은 소개가 거의 필요하지 않으며 유럽과 미국에서 사망률이 급격하게 증가하는 전 세계적 비상사태를 나타냅니다. SARS-CoV-2에 감염된 개인의 대다수는 무증상이고 바이러스 확산의 주요 원인이며, 이들 중 상당 부분이 활성 바이러스 복제를 하고 있다는 증거가 축적되고 있습니다 4,5. 더욱이, 질병 행동은 다양하며, 대부분의 환자는 경미한 증상만을 경험하거나 전혀 증상을 경험하지 않습니다. 일부 환자에서는 폐 실질의 공격적이고 광범위한 염증성 파괴, 관련 염증 반응 및 중복 감염과 함께 심각한 폐 질환이 발생하여 코로나19 관련 사망률의 상당 부분을 차지합니다. 이러한 심각한 폐질환 발병의 원인이 정확히 무엇인지는 아직 알려지지 않았지만, 노령, 비만, 당뇨병 및 기타 동반 질환으로 인해 위험이 증가하는 반면, 특정 약물의 역할은 여전히 ​​불확실합니다. 바이러스 유전학과 환자 면역학의 변이도 관련될 가능성이 높습니다. 후자의 경우, 우리는 숙주 유전학이 SARS-CoV-2 감염에서 심각한 폐질환 발생을 결정하는 데 역할을 할 수 있다는 가설을 세웠습니다. GWAS(게놈 연관 연구)는 2005년 연구 설계가 발명된 이후 수천 가지 질병 특성의 유전적 소인을 해독하기 위해 적용되었습니다. 검출된 유전 신호는 수백 명의 개인에게서 검출될 수 있는 매우 강력한 효과부터 검출을 위해 수만 명의 집단이 필요한 매우 약한 효과까지 다양합니다. 2020년까지 연구 설계는 이제 강력하고 기성품이며 수행하기 쉬운 유전적 소인에 대한 업계 표준 스크리닝 도구가 되며 "소비자 유전학" 온라인 기반 회사를 ​​통해서도 사용할 수 있습니다. 연구 설계는 간단합니다. SNP 마이크로어레이를 사용하여 게놈 전체의 유전적 변이(단일 염기 다형성, SNP)를 테스트하고 환자 대 대조군(또는 다른 변수 전체)의 빈도를 비교합니다. 특히 염증성 표현형의 경우 GWAS는 다양한 조건에서 수백 개의 감수성 유전자좌를 묘사하는 효율적인 도구로 입증되었으며, 그 중 일부는 새롭고 놀라운 질병 통찰력을 제공했습니다. GWAS는 두 가지 목적을 가지고 있습니다. 가장 중요한 것은 질병 발생과 관련된 생물학적 요인을 결정하여 잠재적으로 약물 개발 및 치료를 안내할 수 있다는 것입니다. 이는 수백 건의 임상시험이 시작되었고 강력한 병태생리학 데이터를 기반으로 잘 수행된 공동 연구의 우선순위를 긴급히 적용해야 하는 현재의 코로나19 비상 상황에서 특히 관련이 있을 것입니다. 둘째, 점점 인기를 얻고 있으며, 질병 발병을 예측하기 위해 "다유전성 위험 점수"를 계산할 수 있습니다. 두 가지 측면 모두 코로나19 폐질환을 명확히 하는 데 중요합니다. (a) 관련 치료 접근법을 제안할 수 있는 생물학적 메커니즘이 관련되어 있음을 암시하는 유전적 특징이 있습니까? (b) 위험에 처한 사람(또는 위험이 매우 낮은 사람)을 예측할 수 있습니까? )?

연구 유형

중재적

등록 (실제)

4000

단계

  • 해당 없음

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 장소

    • Milano
      • Milan, Milano, 이탈리아, 20122
        • Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico - Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico di natura pubblica

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

  • 어린이
  • 성인
  • 고령자

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

설명

포함 기준:

코호트 1 포함 기준:

  • 심각한 폐 기능 장애가 있는 SARS-CoV-2 양성 환자(연령 제한 없음), 모든 종류의 지원이 필요한 호흡 부전으로 입원
  • 사전 동의 서명

코호트 2 포함 기준:

  • 2020년 2월 24일부터 2021년 12월 31일 사이에 헌혈한 헌혈자(18~70세)
  • 바이러스혈증 양성 및 IgG/IgM 존재로 확인된 SARS-CoV-2 바이러스 노출
  • 사전 동의 서명

코호트 3 포함 기준:

이전 연구(n=5,000, 14~80세)에서 건강한 대조군을 얻을 수 있으며, 이 데이터는 이미 Kiel University 데이터베이스 내에서 유전적 연관 분석에 사용할 수 있습니다.

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

  • 주 목적: 다른
  • 할당: 해당 없음
  • 중재 모델: 단일 그룹 할당
  • 마스킹: 없음(오픈 라벨)

무기와 개입

참가자 그룹 / 팔
개입 / 치료
실험적: 주요 공통 유전적 결정인자를 확인합니다.
전체 프로젝트의 목적은 SARS-CoV-2에 감염된 사람의 호흡 부전 발병 경향에 대한 유전적 결정 요인을 식별하는 것입니다. 이러한 요인에 대한 지식은 SARS-CoV-2 감염 시 심각한 폐질환 발병에 대한 생물학적 이해를 교육할 수 있습니다. 이러한 이해는 이 환자 그룹의 보다 효과적인 관리를 위한 잠재적인 유용성을 치료 시험에 알릴 수 있습니다. 다유전적 위험 점수는 고위험/저위험 환자를 식별하는 데에도 유용할 수 있습니다. 의료 서비스 제공자와 심각한 동반 질환을 앓고 있는 취약한 개인 사이에 있습니다.
GWAS를 수행함으로써 심각한 CovID-19의 주요 공통 유전자 결정 인자를 확인하기 위해 : 첫 번째 단계에서는 적시에 해당 연구에 대한 연구에 정보를 제공하는 초기 데이터를 제공하기 위해 SARS-COV-2 양성 환자를 동일한 지리적 영역의 건강한 대조군과 비교할 것입니다. 이것은 University of Kiel Covid-19 Genomic Initiative와 긴밀한 협력을 통해 수행 될 것입니다. 나중에, 우리는 임상 적으로 유의 한 증상을 개발하지 않은 감염된 대조군을 포함하여 전체 코호트에서 목표 1과 2를 평가할 것입니다.
특정 프로젝트에서 작업하는 다른 그룹을 촉진하기 위해 Fondazione에서 관리 된 모든 환자의 광범위한 유전자 특성을 제공하기 위해 (예를 들어, 다가오는 프로젝트에서 나올 수있는 집중 치료 및 심장학 단위 및 기타 후보자에 의한 Serpina1 및 ACE2와 같은 후보 유전자에 대한), 대규모 인구 및 매우시기 적절한 방식으로, 추가적인 연구 네트워크 및 조정 된 연구를 위해 발생하지 않습니다.
해당 분야의 다른 연구 컨소시엄과의 협력을 관리하기위한 조정을 제공합니다. "익명화 된 GWA는 심한 CovID-19 (SARS-COV-2 감염) 폐 질환에 유전 적 소인을 시급히 쿼리하기위한 익명화 된 GWA 및 COVID-19 호스트 유전자 이니셔티브 (https://www.covid19hg.org). 실제로, 수천 건의 사례를 분석하는 대규모 네트워크 간의 협력은 궁극적으로 CovID-19 감수성의 유전 적 기초를 명확히하기 위해 필요하며, 대규모 협업 네트워크는 인간 유전자 연구를 수행하기위한 필수 도구입니다.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
GWAS에 의해 식별된 SNP
기간: 최대 36개월
우리는 동일한 지역의 중증 SARS-CoV-2 감염 환자와 건강한 대조군 사이의 유전적 배경 차이를 측정하고, 중증 SARSCoV 감염2 환자와 경증 또는 중등도 감염 환자 간의 유전적 차이를 식별할 것입니다.
최대 36개월

2차 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
WES(Whole Exome sequencing)로 확인된 희귀 유전 변이체
기간: 최대 36개월

동반 질환 및 위험 요인이 없음에도 불구하고 중증 호흡 부전이 발생한 개인의 중증 COVID-19 감수성을 결정하는 데 희귀 유전 변이의 가능한 역할을 조사합니다.

식별되지 않은 DNA 샘플의 서열을 분석하여 게놈 수준에서 유전적 위험 프로필을 평가합니다. 또한, 심각한 증상이 발생하지 않고 감염이 제거된 기증자와 호흡 부전으로 입원한 환자 간의 일반적인 유전 변이의 빈도 분포를 비교할 예정입니다.

최대 36개월

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2020년 3월 23일

기본 완료 (실제)

2021년 1월 31일

연구 완료 (실제)

2023년 5월 31일

연구 등록 날짜

최초 제출

2024년 3월 7일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2024년 8월 9일

처음 게시됨 (실제)

2024년 8월 12일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2025년 5월 2일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2025년 4월 29일

마지막으로 확인됨

2024년 8월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .

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