Characterization of the Methylation Profile of Stored Human Samples (DNAmetCRB)
Characterization of the Methylation Profile of Samples Stored at the Biological Resource Center (CRB) of the Rizzoli Orthopedic Institute (IOR)
The project, funded by the PNRR under Mission 4 "Education and Research," aims to strengthen the network of Italian biobanks by improving data management in accordance with the FAIR principles (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable). The University of Trento has issued a call for proposals to support Italian biobanks in characterizing samples and expanding associated datasets using advanced technologies.
The Biological Resource Center at the Rizzoli Orthopedic Institute in Bologna participated in this call for proposals, requesting funding to analyze the DNA methylation profiles of three patient cohorts: those with inflammatory/degenerative diseases, sarcomas, and rare genetic musculoskeletal disorders. This study will contribute to understanding the biological significance of methylation and exploring its diagnostic and therapeutic potential.
The initiative aims to generate data useful for personalized medicine and improve the management of the diseases involved.
Przegląd badań
Status
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
BO
-
Bologna, BO, Włochy, 40136
- IRCCS Istituto Ortopedico Rizzzoli
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Inclusion Criteria:
- Be a patient with a sample stored in one of the biobanks belonging to the CRB IOR
- Have one of the following conditions: a rare skeletal disorder, sarcoma, or inflammatory arthritis.
Exclusion Criteria:
- Patients who have refused to consent to the use of their samples or the processing of their data for genetic studies
- Patients who have refused to consent to the transfer of their samples outside the IOR
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
inflammatory/degenerative diseases
inflammatory articular diseases (blood)
|
|
rare diseases
Rare bone diseases (Blood, tissue)
|
|
sarcomas
sarcomas of bones and cartilage (tissue)
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
methylation profiles
Ramy czasowe: 5 months
|
Detect the methylation profiles of a cohort of samples stored at the CRB (rare genetic diseases, sarcomas, inflammatory arthritis) to expand the dataset of samples held at the CRB-IOR.
|
5 months
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Fairyfication of methilation profiles
Ramy czasowe: 5 months
|
Fairyfication of data derived from methilation profiles to be linked to biological samples present on BBMRI catalogue.
Data comprises desease (orphacode, ICD10), age (years month), sample type (blood, tissue, DNA), sample collection date (dd/mm/yyyy), gender (F, M), Informed Consent (mandatory)
|
5 months
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Velasco G, Francastel C. Genetics meets DNA methylation in rare diseases. Clin Genet. 2019 Feb;95(2):210-220. doi: 10.1111/cge.13480. Epub 2018 Dec 18.
- Gu M, Ren B, Fang Y, Ren J, Liu X, Wang X, Zhou F, Xiao R, Luo X, You L, Zhao Y. Epigenetic regulation in cancer. MedComm (2020). 2024 Feb 19;5(2):e495. doi: 10.1002/mco2.495. eCollection 2024 Feb.
- Hammaker D, Firestein GS. Epigenetics of inflammatory arthritis. Curr Opin Rheumatol. 2018 Mar;30(2):188-196. doi: 10.1097/BOR.0000000000000471.
- Hageman I, Mol F, Atiqi S, Joustra V, Sengul H, Henneman P, Visman I, Hakvoort T, Nurmohamed M, Wolbink G, Levin E, Li Yim AYF, D'Haens G, de Jonge WJ. Novel DNA methylome biomarkers associated with adalimumab response in rheumatoid arthritis patients. Front Immunol. 2023 Dec 22;14:1303231. doi: 10.3389/fimmu.2023.1303231. eCollection 2023.
- de la Calle-Fabregat C, Niemantsverdriet E, Canete JD, Li T, van der Helm-van Mil AHM, Rodriguez-Ubreva J, Ballestar E. Prediction of the Progression of Undifferentiated Arthritis to Rheumatoid Arthritis Using DNA Methylation Profiling. Arthritis Rheumatol. 2021 Dec;73(12):2229-2239. doi: 10.1002/art.41885. Epub 2021 Nov 2.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 150/2025/TESS/IOR
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .