Research on Precise Immune Prevention and Treatment of Glioma Based on Multi-omics Sequencing Data
22 mars 2021 uppdaterad av: Yu Yao, MD
This project intends to use multiple types of biological samples from glioma patients and mouse intracranial tumor models as research objects, and comprehensively apply a series of omics sequencing technologies and molecular biology technologies to jointly define the following research objectives :
Studieöversikt
Detaljerad beskrivning
- Through high-throughput sequencing technologies such as， genome sequencing, transcriptome sequencing and single-cell sequencing, Proteomics，Metabonomics and Metagenomics， the similarities and differences of the glioma immune microenvironment within and between individuals were revealed from the multi-dimensional and big data level, and the immune molecular typing of glioma was established.
- Establish and verify that the neoantigen polypeptides predicted by AI algorithm after analyzing multi-omics data (genome, transcriptome, etc.) have good killing effect on individual tumor cells.
- To establish an intelligent evaluation model of glioma immunotyping by integrating imaging, pathology, high-throughput sequencing data and other omics information, and to provide a visual tool for monitoring changes in the intratumoral microenvironment of glioma patients, with the expectation of helping timely intervention of immunotherapy in patients with recurrence.
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Förväntat)
120
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studieorter
-
-
-
Shanghai, Kina, 200040
- Rekrytering
- Huashan Hospital, Fudan University
-
Kontakt:
- Yu Yao
- Telefonnummer: 86-021-5288-9999
- E-post: yu_yao03@126.com
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
18 år till 80 år (Vuxen, Äldre vuxen)
Tar emot friska volontärer
Nej
Kön som är behöriga för studier
Allt
Testmetod
Sannolikhetsprov
Studera befolkning
Patients undergoing glioma surgery at Huashan Hospital
Beskrivning
Inclusion Criteria:
The patients with glioma in the Department of Neurosurgery of Huashan Hospital Affiliated to Fudan University who meet the following three conditions can be enrolled
- They were 18-80 years old, male and female;
- The pathological diagnosis was glioma;
- On the basis of not affecting the clinical routine diagnosis, tissue (6 mm * 6 mm) or paraffin section (5 pieces) can be used for research;
Sign informed consent or ethics committee approval
Exclusion Criteria:
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
glioma patients
glioma patients with routine surgery
|
kirurgi
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Overall Survival（OS），month
Tidsram: 24 month
|
Survival time from surgery to death in 120 patients with glioma.
|
24 month
|
|
Progress Free Survival （PFS），month
Tidsram: 24 month
|
Survival time from surgery to first progression or death from any cause in patients with glioma.
|
24 month
|
|
Tumor Mutation Burden（TMB），mutations/mb, drived from Genomic sequencing
Tidsram: 24 month
|
the level of gene mutation，including TERT、GMEM、IDH.etc.
|
24 month
|
|
Reads Per Kilobase Million（RPKM），KB^(-1), drived from Transcriptome sequencing
Tidsram: 24 month
|
the expression level of RNA,including mRNA、 miRNA、circRNA.etc
|
24 month
|
|
expression level of protein , drived from Protein sequencing
Tidsram: 24 month
|
the expression level of protein, post-translational modification and protein-protein interaction，including PD1、PDL1、CD4、CD8.etc.
|
24 month
|
|
expression level of low molecular weight protein，drived from Metabonomics
Tidsram: 24 month
|
the expression level and interaction of different Metabolites，including D-2-Hydroxyglutarate. etc.
|
24 month
|
|
expression level of DNA，drived from Metagenomics
Tidsram: 24 month
|
Differences about DNA expression of all microorganisms in the environment
|
24 month
|
|
frequency of TCR/BCR clone，drived from Immunomics
Tidsram: 24month
|
different expression level and interaction of Immune molecules，including TCR、BCR、antibody.etc.
|
24month
|
|
expression level of protein，drived from paraffin-embedded specimens， retrospectively collected.
Tidsram: 24month
|
different expression level of proteins in Gliomas with different grades and molecular subgroups (1000 cases)
|
24month
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Sponsor
Publikationer och användbara länkar
Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.
Allmänna publikationer
- Stupp R, Hegi ME, Mason WP, van den Bent MJ, Taphoorn MJ, Janzer RC, Ludwin SK, Allgeier A, Fisher B, Belanger K, Hau P, Brandes AA, Gijtenbeek J, Marosi C, Vecht CJ, Mokhtari K, Wesseling P, Villa S, Eisenhauer E, Gorlia T, Weller M, Lacombe D, Cairncross JG, Mirimanoff RO; European Organisation for Research and Treatment of Cancer Brain Tumour and Radiation Oncology Groups; National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group. Effects of radiotherapy with concomitant and adjuvant temozolomide versus radiotherapy alone on survival in glioblastoma in a randomised phase III study: 5-year analysis of the EORTC-NCIC trial. Lancet Oncol. 2009 May;10(5):459-66. doi: 10.1016/S1470-2045(09)70025-7. Epub 2009 Mar 9.
- Ostrom QT, Gittleman H, Truitt G, Boscia A, Kruchko C, Barnholtz-Sloan JS. CBTRUS Statistical Report: Primary Brain and Other Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United States in 2011-2015. Neuro Oncol. 2018 Oct 1;20(suppl_4):iv1-iv86. doi: 10.1093/neuonc/noy131. No abstract available. Erratum In: Neuro Oncol. 2018 Nov 17;:null.
- Tan AC, Ashley DM, Lopez GY, Malinzak M, Friedman HS, Khasraw M. Management of glioblastoma: State of the art and future directions. CA Cancer J Clin. 2020 Jul;70(4):299-312. doi: 10.3322/caac.21613. Epub 2020 Jun 1.
- Chheda ZS, Kohanbash G, Okada K, Jahan N, Sidney J, Pecoraro M, Yang X, Carrera DA, Downey KM, Shrivastav S, Liu S, Lin Y, Lagisetti C, Chuntova P, Watchmaker PB, Mueller S, Pollack IF, Rajalingam R, Carcaboso AM, Mann M, Sette A, Garcia KC, Hou Y, Okada H. Novel and shared neoantigen derived from histone 3 variant H3.3K27M mutation for glioma T cell therapy. J Exp Med. 2018 Jan 2;215(1):141-157. doi: 10.1084/jem.20171046. Epub 2017 Dec 4.
- Nejo T, Matsushita H, Karasaki T, Nomura M, Saito K, Tanaka S, Takayanagi S, Hana T, Takahashi S, Kitagawa Y, Koike T, Kobayashi Y, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Narita Y, Nagane M, Ueki K, Nishikawa R, Aburatani H, Mukasa A, Saito N, Kakimi K. Reduced Neoantigen Expression Revealed by Longitudinal Multiomics as a Possible Immune Evasion Mechanism in Glioma. Cancer Immunol Res. 2019 Jul;7(7):1148-1161. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-18-0599. Epub 2019 May 14.
- Keskin DB, Anandappa AJ, Sun J, Tirosh I, Mathewson ND, Li S, Oliveira G, Giobbie-Hurder A, Felt K, Gjini E, Shukla SA, Hu Z, Li L, Le PM, Allesoe RL, Richman AR, Kowalczyk MS, Abdelrahman S, Geduldig JE, Charbonneau S, Pelton K, Iorgulescu JB, Elagina L, Zhang W, Olive O, McCluskey C, Olsen LR, Stevens J, Lane WJ, Salazar AM, Daley H, Wen PY, Chiocca EA, Harden M, Lennon NJ, Gabriel S, Getz G, Lander ES, Regev A, Ritz J, Neuberg D, Rodig SJ, Ligon KL, Suva ML, Wucherpfennig KW, Hacohen N, Fritsch EF, Livak KJ, Ott PA, Wu CJ, Reardon DA. Neoantigen vaccine generates intratumoral T cell responses in phase Ib glioblastoma trial. Nature. 2019 Jan;565(7738):234-239. doi: 10.1038/s41586-018-0792-9. Epub 2018 Dec 19.
- Hilf N, Kuttruff-Coqui S, Frenzel K, Bukur V, Stevanovic S, Gouttefangeas C, Platten M, Tabatabai G, Dutoit V, van der Burg SH, Thor Straten P, Martinez-Ricarte F, Ponsati B, Okada H, Lassen U, Admon A, Ottensmeier CH, Ulges A, Kreiter S, von Deimling A, Skardelly M, Migliorini D, Kroep JR, Idorn M, Rodon J, Piro J, Poulsen HS, Shraibman B, McCann K, Mendrzyk R, Lower M, Stieglbauer M, Britten CM, Capper D, Welters MJP, Sahuquillo J, Kiesel K, Derhovanessian E, Rusch E, Bunse L, Song C, Heesch S, Wagner C, Kemmer-Bruck A, Ludwig J, Castle JC, Schoor O, Tadmor AD, Green E, Fritsche J, Meyer M, Pawlowski N, Dorner S, Hoffgaard F, Rossler B, Maurer D, Weinschenk T, Reinhardt C, Huber C, Rammensee HG, Singh-Jasuja H, Sahin U, Dietrich PY, Wick W. Actively personalized vaccination trial for newly diagnosed glioblastoma. Nature. 2019 Jan;565(7738):240-245. doi: 10.1038/s41586-018-0810-y. Epub 2018 Dec 19. Erratum In: Nature. 2019 Feb;566(7745):E13.
- Li Y, Liu X, Xu K, Qian Z, Wang K, Fan X, Li S, Wang Y, Jiang T. MRI features can predict EGFR expression in lower grade gliomas: A voxel-based radiomic analysis. Eur Radiol. 2018 Jan;28(1):356-362. doi: 10.1007/s00330-017-4964-z. Epub 2017 Jul 28.
- Grossmann P, Gutman DA, Dunn WD Jr, Holder CA, Aerts HJ. Imaging-genomics reveals driving pathways of MRI derived volumetric tumor phenotype features in Glioblastoma. BMC Cancer. 2016 Aug 8;16:611. doi: 10.1186/s12885-016-2659-5.
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
10 mars 2021
Primärt slutförande (Förväntat)
30 september 2022
Avslutad studie (Förväntat)
30 september 2022
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
1 mars 2021
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
7 mars 2021
Första postat (Faktisk)
11 mars 2021
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
24 mars 2021
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
22 mars 2021
Senast verifierad
1 mars 2021
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- KY2021-059
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
NEJ
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .