Research on Precise Immune Prevention and Treatment of Glioma Based on Multi-omics Sequencing Data
2021年3月22日 更新者:Yu Yao, MD
This project intends to use multiple types of biological samples from glioma patients and mouse intracranial tumor models as research objects, and comprehensively apply a series of omics sequencing technologies and molecular biology technologies to jointly define the following research objectives :
調査の概要
詳細な説明
- Through high-throughput sequencing technologies such as, genome sequencing, transcriptome sequencing and single-cell sequencing, Proteomics,Metabonomics and Metagenomics, the similarities and differences of the glioma immune microenvironment within and between individuals were revealed from the multi-dimensional and big data level, and the immune molecular typing of glioma was established.
- Establish and verify that the neoantigen polypeptides predicted by AI algorithm after analyzing multi-omics data (genome, transcriptome, etc.) have good killing effect on individual tumor cells.
- To establish an intelligent evaluation model of glioma immunotyping by integrating imaging, pathology, high-throughput sequencing data and other omics information, and to provide a visual tool for monitoring changes in the intratumoral microenvironment of glioma patients, with the expectation of helping timely intervention of immunotherapy in patients with recurrence.
研究の種類
観察的
入学 (予想される)
120
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
-
-
-
Shanghai、中国、200040
- 募集
- Huashan Hospital, Fudan University
-
コンタクト:
- Yu Yao
- 電話番号:86-021-5288-9999
- メール:yu_yao03@126.com
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年~80年 (大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
受講資格のある性別
全て
サンプリング方法
確率サンプル
調査対象母集団
Patients undergoing glioma surgery at Huashan Hospital
説明
Inclusion Criteria:
The patients with glioma in the Department of Neurosurgery of Huashan Hospital Affiliated to Fudan University who meet the following three conditions can be enrolled
- They were 18-80 years old, male and female;
- The pathological diagnosis was glioma;
- On the basis of not affecting the clinical routine diagnosis, tissue (6 mm * 6 mm) or paraffin section (5 pieces) can be used for research;
Sign informed consent or ethics committee approval
Exclusion Criteria:
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
---|---|
glioma patients
glioma patients with routine surgery
|
手術
|
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
---|---|---|
Overall Survival(OS),month
時間枠:24 month
|
Survival time from surgery to death in 120 patients with glioma.
|
24 month
|
Progress Free Survival (PFS),month
時間枠:24 month
|
Survival time from surgery to first progression or death from any cause in patients with glioma.
|
24 month
|
Tumor Mutation Burden(TMB),mutations/mb, drived from Genomic sequencing
時間枠:24 month
|
the level of gene mutation,including TERT、GMEM、IDH.etc.
|
24 month
|
Reads Per Kilobase Million(RPKM),KB^(-1), drived from Transcriptome sequencing
時間枠:24 month
|
the expression level of RNA,including mRNA、 miRNA、circRNA.etc
|
24 month
|
expression level of protein , drived from Protein sequencing
時間枠:24 month
|
the expression level of protein, post-translational modification and protein-protein interaction,including PD1、PDL1、CD4、CD8.etc.
|
24 month
|
expression level of low molecular weight protein,drived from Metabonomics
時間枠:24 month
|
the expression level and interaction of different Metabolites,including D-2-Hydroxyglutarate. etc.
|
24 month
|
expression level of DNA,drived from Metagenomics
時間枠:24 month
|
Differences about DNA expression of all microorganisms in the environment
|
24 month
|
frequency of TCR/BCR clone,drived from Immunomics
時間枠:24month
|
different expression level and interaction of Immune molecules,including TCR、BCR、antibody.etc.
|
24month
|
expression level of protein,drived from paraffin-embedded specimens, retrospectively collected.
時間枠:24month
|
different expression level of proteins in Gliomas with different grades and molecular subgroups (1000 cases)
|
24month
|
協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
スポンサー
出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Stupp R, Hegi ME, Mason WP, van den Bent MJ, Taphoorn MJ, Janzer RC, Ludwin SK, Allgeier A, Fisher B, Belanger K, Hau P, Brandes AA, Gijtenbeek J, Marosi C, Vecht CJ, Mokhtari K, Wesseling P, Villa S, Eisenhauer E, Gorlia T, Weller M, Lacombe D, Cairncross JG, Mirimanoff RO; European Organisation for Research and Treatment of Cancer Brain Tumour and Radiation Oncology Groups; National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group. Effects of radiotherapy with concomitant and adjuvant temozolomide versus radiotherapy alone on survival in glioblastoma in a randomised phase III study: 5-year analysis of the EORTC-NCIC trial. Lancet Oncol. 2009 May;10(5):459-66. doi: 10.1016/S1470-2045(09)70025-7. Epub 2009 Mar 9.
- Ostrom QT, Gittleman H, Truitt G, Boscia A, Kruchko C, Barnholtz-Sloan JS. CBTRUS Statistical Report: Primary Brain and Other Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United States in 2011-2015. Neuro Oncol. 2018 Oct 1;20(suppl_4):iv1-iv86. doi: 10.1093/neuonc/noy131. No abstract available. Erratum In: Neuro Oncol. 2018 Nov 17;:null.
- Tan AC, Ashley DM, Lopez GY, Malinzak M, Friedman HS, Khasraw M. Management of glioblastoma: State of the art and future directions. CA Cancer J Clin. 2020 Jul;70(4):299-312. doi: 10.3322/caac.21613. Epub 2020 Jun 1.
- Chheda ZS, Kohanbash G, Okada K, Jahan N, Sidney J, Pecoraro M, Yang X, Carrera DA, Downey KM, Shrivastav S, Liu S, Lin Y, Lagisetti C, Chuntova P, Watchmaker PB, Mueller S, Pollack IF, Rajalingam R, Carcaboso AM, Mann M, Sette A, Garcia KC, Hou Y, Okada H. Novel and shared neoantigen derived from histone 3 variant H3.3K27M mutation for glioma T cell therapy. J Exp Med. 2018 Jan 2;215(1):141-157. doi: 10.1084/jem.20171046. Epub 2017 Dec 4.
- Nejo T, Matsushita H, Karasaki T, Nomura M, Saito K, Tanaka S, Takayanagi S, Hana T, Takahashi S, Kitagawa Y, Koike T, Kobayashi Y, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Narita Y, Nagane M, Ueki K, Nishikawa R, Aburatani H, Mukasa A, Saito N, Kakimi K. Reduced Neoantigen Expression Revealed by Longitudinal Multiomics as a Possible Immune Evasion Mechanism in Glioma. Cancer Immunol Res. 2019 Jul;7(7):1148-1161. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-18-0599. Epub 2019 May 14.
- Keskin DB, Anandappa AJ, Sun J, Tirosh I, Mathewson ND, Li S, Oliveira G, Giobbie-Hurder A, Felt K, Gjini E, Shukla SA, Hu Z, Li L, Le PM, Allesoe RL, Richman AR, Kowalczyk MS, Abdelrahman S, Geduldig JE, Charbonneau S, Pelton K, Iorgulescu JB, Elagina L, Zhang W, Olive O, McCluskey C, Olsen LR, Stevens J, Lane WJ, Salazar AM, Daley H, Wen PY, Chiocca EA, Harden M, Lennon NJ, Gabriel S, Getz G, Lander ES, Regev A, Ritz J, Neuberg D, Rodig SJ, Ligon KL, Suva ML, Wucherpfennig KW, Hacohen N, Fritsch EF, Livak KJ, Ott PA, Wu CJ, Reardon DA. Neoantigen vaccine generates intratumoral T cell responses in phase Ib glioblastoma trial. Nature. 2019 Jan;565(7738):234-239. doi: 10.1038/s41586-018-0792-9. Epub 2018 Dec 19.
- Hilf N, Kuttruff-Coqui S, Frenzel K, Bukur V, Stevanovic S, Gouttefangeas C, Platten M, Tabatabai G, Dutoit V, van der Burg SH, Thor Straten P, Martinez-Ricarte F, Ponsati B, Okada H, Lassen U, Admon A, Ottensmeier CH, Ulges A, Kreiter S, von Deimling A, Skardelly M, Migliorini D, Kroep JR, Idorn M, Rodon J, Piro J, Poulsen HS, Shraibman B, McCann K, Mendrzyk R, Lower M, Stieglbauer M, Britten CM, Capper D, Welters MJP, Sahuquillo J, Kiesel K, Derhovanessian E, Rusch E, Bunse L, Song C, Heesch S, Wagner C, Kemmer-Bruck A, Ludwig J, Castle JC, Schoor O, Tadmor AD, Green E, Fritsche J, Meyer M, Pawlowski N, Dorner S, Hoffgaard F, Rossler B, Maurer D, Weinschenk T, Reinhardt C, Huber C, Rammensee HG, Singh-Jasuja H, Sahin U, Dietrich PY, Wick W. Actively personalized vaccination trial for newly diagnosed glioblastoma. Nature. 2019 Jan;565(7738):240-245. doi: 10.1038/s41586-018-0810-y. Epub 2018 Dec 19. Erratum In: Nature. 2019 Feb;566(7745):E13.
- Li Y, Liu X, Xu K, Qian Z, Wang K, Fan X, Li S, Wang Y, Jiang T. MRI features can predict EGFR expression in lower grade gliomas: A voxel-based radiomic analysis. Eur Radiol. 2018 Jan;28(1):356-362. doi: 10.1007/s00330-017-4964-z. Epub 2017 Jul 28.
- Grossmann P, Gutman DA, Dunn WD Jr, Holder CA, Aerts HJ. Imaging-genomics reveals driving pathways of MRI derived volumetric tumor phenotype features in Glioblastoma. BMC Cancer. 2016 Aug 8;16:611. doi: 10.1186/s12885-016-2659-5.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2021年3月10日
一次修了 (予想される)
2022年9月30日
研究の完了 (予想される)
2022年9月30日
試験登録日
最初に提出
2021年3月1日
QC基準を満たした最初の提出物
2021年3月7日
最初の投稿 (実際)
2021年3月11日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2021年3月24日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2021年3月22日
最終確認日
2021年3月1日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- KY2021-059
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
いいえ
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
いいえ
米国FDA規制機器製品の研究
いいえ
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
手術の臨床試験
-
Bournemouth UniversityStryker Orthopaedics; Nuffield Health Bournemouth; Orthopaedic Research Institute募集
-
Piazza della Vittoria 14 Studio Medico - Ginecologia...募集
-
Kocaeli Derince Education and Research HospitalKocaeli Universityわからない
-
University of Illinois at ChicagoEthicon Endo-Surgery引きこもった