Research on Precise Immune Prevention and Treatment of Glioma Based on Multi-omics Sequencing Data
22 de março de 2021 atualizado por: Yu Yao, MD
This project intends to use multiple types of biological samples from glioma patients and mouse intracranial tumor models as research objects, and comprehensively apply a series of omics sequencing technologies and molecular biology technologies to jointly define the following research objectives :
Visão geral do estudo
Status
Desconhecido
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
- Through high-throughput sequencing technologies such as， genome sequencing, transcriptome sequencing and single-cell sequencing, Proteomics，Metabonomics and Metagenomics， the similarities and differences of the glioma immune microenvironment within and between individuals were revealed from the multi-dimensional and big data level, and the immune molecular typing of glioma was established.
- Establish and verify that the neoantigen polypeptides predicted by AI algorithm after analyzing multi-omics data (genome, transcriptome, etc.) have good killing effect on individual tumor cells.
- To establish an intelligent evaluation model of glioma immunotyping by integrating imaging, pathology, high-throughput sequencing data and other omics information, and to provide a visual tool for monitoring changes in the intratumoral microenvironment of glioma patients, with the expectation of helping timely intervention of immunotherapy in patients with recurrence.
Tipo de estudo
Observacional
Inscrição (Antecipado)
120
Contactos e Locais
Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.
Locais de estudo
-
-
-
Shanghai, China, 200040
- Recrutamento
- Huashan Hospital, Fudan University
-
Contato:
- Yu Yao
- Número de telefone: 86-021-5288-9999
- E-mail: yu_yao03@126.com
-
-
Critérios de participação
Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
18 anos a 80 anos (Adulto, Adulto mais velho)
Aceita Voluntários Saudáveis
Não
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Tudo
Método de amostragem
Amostra de Probabilidade
População do estudo
Patients undergoing glioma surgery at Huashan Hospital
Descrição
Inclusion Criteria:
The patients with glioma in the Department of Neurosurgery of Huashan Hospital Affiliated to Fudan University who meet the following three conditions can be enrolled
- They were 18-80 years old, male and female;
- The pathological diagnosis was glioma;
- On the basis of not affecting the clinical routine diagnosis, tissue (6 mm * 6 mm) or paraffin section (5 pieces) can be used for research;
Sign informed consent or ethics committee approval
Exclusion Criteria:
Plano de estudo
Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
|
glioma patients
glioma patients with routine surgery
|
cirurgia
|
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Overall Survival（OS），month
Prazo: 24 month
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Survival time from surgery to death in 120 patients with glioma.
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24 month
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Progress Free Survival （PFS），month
Prazo: 24 month
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Survival time from surgery to first progression or death from any cause in patients with glioma.
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24 month
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Tumor Mutation Burden（TMB），mutations/mb, drived from Genomic sequencing
Prazo: 24 month
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the level of gene mutation，including TERT、GMEM、IDH.etc.
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24 month
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Reads Per Kilobase Million（RPKM），KB^(-1), drived from Transcriptome sequencing
Prazo: 24 month
|
the expression level of RNA,including mRNA、 miRNA、circRNA.etc
|
24 month
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|
expression level of protein , drived from Protein sequencing
Prazo: 24 month
|
the expression level of protein, post-translational modification and protein-protein interaction，including PD1、PDL1、CD4、CD8.etc.
|
24 month
|
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expression level of low molecular weight protein，drived from Metabonomics
Prazo: 24 month
|
the expression level and interaction of different Metabolites，including D-2-Hydroxyglutarate. etc.
|
24 month
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expression level of DNA，drived from Metagenomics
Prazo: 24 month
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Differences about DNA expression of all microorganisms in the environment
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24 month
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frequency of TCR/BCR clone，drived from Immunomics
Prazo: 24month
|
different expression level and interaction of Immune molecules，including TCR、BCR、antibody.etc.
|
24month
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expression level of protein，drived from paraffin-embedded specimens， retrospectively collected.
Prazo: 24month
|
different expression level of proteins in Gliomas with different grades and molecular subgroups (1000 cases)
|
24month
|
Colaboradores e Investigadores
É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.
Patrocinador
Publicações e links úteis
A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.
Publicações Gerais
- Stupp R, Hegi ME, Mason WP, van den Bent MJ, Taphoorn MJ, Janzer RC, Ludwin SK, Allgeier A, Fisher B, Belanger K, Hau P, Brandes AA, Gijtenbeek J, Marosi C, Vecht CJ, Mokhtari K, Wesseling P, Villa S, Eisenhauer E, Gorlia T, Weller M, Lacombe D, Cairncross JG, Mirimanoff RO; European Organisation for Research and Treatment of Cancer Brain Tumour and Radiation Oncology Groups; National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group. Effects of radiotherapy with concomitant and adjuvant temozolomide versus radiotherapy alone on survival in glioblastoma in a randomised phase III study: 5-year analysis of the EORTC-NCIC trial. Lancet Oncol. 2009 May;10(5):459-66. doi: 10.1016/S1470-2045(09)70025-7. Epub 2009 Mar 9.
- Ostrom QT, Gittleman H, Truitt G, Boscia A, Kruchko C, Barnholtz-Sloan JS. CBTRUS Statistical Report: Primary Brain and Other Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United States in 2011-2015. Neuro Oncol. 2018 Oct 1;20(suppl_4):iv1-iv86. doi: 10.1093/neuonc/noy131. No abstract available. Erratum In: Neuro Oncol. 2018 Nov 17;:null.
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- Chheda ZS, Kohanbash G, Okada K, Jahan N, Sidney J, Pecoraro M, Yang X, Carrera DA, Downey KM, Shrivastav S, Liu S, Lin Y, Lagisetti C, Chuntova P, Watchmaker PB, Mueller S, Pollack IF, Rajalingam R, Carcaboso AM, Mann M, Sette A, Garcia KC, Hou Y, Okada H. Novel and shared neoantigen derived from histone 3 variant H3.3K27M mutation for glioma T cell therapy. J Exp Med. 2018 Jan 2;215(1):141-157. doi: 10.1084/jem.20171046. Epub 2017 Dec 4.
- Nejo T, Matsushita H, Karasaki T, Nomura M, Saito K, Tanaka S, Takayanagi S, Hana T, Takahashi S, Kitagawa Y, Koike T, Kobayashi Y, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Narita Y, Nagane M, Ueki K, Nishikawa R, Aburatani H, Mukasa A, Saito N, Kakimi K. Reduced Neoantigen Expression Revealed by Longitudinal Multiomics as a Possible Immune Evasion Mechanism in Glioma. Cancer Immunol Res. 2019 Jul;7(7):1148-1161. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-18-0599. Epub 2019 May 14.
- Keskin DB, Anandappa AJ, Sun J, Tirosh I, Mathewson ND, Li S, Oliveira G, Giobbie-Hurder A, Felt K, Gjini E, Shukla SA, Hu Z, Li L, Le PM, Allesoe RL, Richman AR, Kowalczyk MS, Abdelrahman S, Geduldig JE, Charbonneau S, Pelton K, Iorgulescu JB, Elagina L, Zhang W, Olive O, McCluskey C, Olsen LR, Stevens J, Lane WJ, Salazar AM, Daley H, Wen PY, Chiocca EA, Harden M, Lennon NJ, Gabriel S, Getz G, Lander ES, Regev A, Ritz J, Neuberg D, Rodig SJ, Ligon KL, Suva ML, Wucherpfennig KW, Hacohen N, Fritsch EF, Livak KJ, Ott PA, Wu CJ, Reardon DA. Neoantigen vaccine generates intratumoral T cell responses in phase Ib glioblastoma trial. Nature. 2019 Jan;565(7738):234-239. doi: 10.1038/s41586-018-0792-9. Epub 2018 Dec 19.
- Hilf N, Kuttruff-Coqui S, Frenzel K, Bukur V, Stevanovic S, Gouttefangeas C, Platten M, Tabatabai G, Dutoit V, van der Burg SH, Thor Straten P, Martinez-Ricarte F, Ponsati B, Okada H, Lassen U, Admon A, Ottensmeier CH, Ulges A, Kreiter S, von Deimling A, Skardelly M, Migliorini D, Kroep JR, Idorn M, Rodon J, Piro J, Poulsen HS, Shraibman B, McCann K, Mendrzyk R, Lower M, Stieglbauer M, Britten CM, Capper D, Welters MJP, Sahuquillo J, Kiesel K, Derhovanessian E, Rusch E, Bunse L, Song C, Heesch S, Wagner C, Kemmer-Bruck A, Ludwig J, Castle JC, Schoor O, Tadmor AD, Green E, Fritsche J, Meyer M, Pawlowski N, Dorner S, Hoffgaard F, Rossler B, Maurer D, Weinschenk T, Reinhardt C, Huber C, Rammensee HG, Singh-Jasuja H, Sahin U, Dietrich PY, Wick W. Actively personalized vaccination trial for newly diagnosed glioblastoma. Nature. 2019 Jan;565(7738):240-245. doi: 10.1038/s41586-018-0810-y. Epub 2018 Dec 19. Erratum In: Nature. 2019 Feb;566(7745):E13.
- Li Y, Liu X, Xu K, Qian Z, Wang K, Fan X, Li S, Wang Y, Jiang T. MRI features can predict EGFR expression in lower grade gliomas: A voxel-based radiomic analysis. Eur Radiol. 2018 Jan;28(1):356-362. doi: 10.1007/s00330-017-4964-z. Epub 2017 Jul 28.
- Grossmann P, Gutman DA, Dunn WD Jr, Holder CA, Aerts HJ. Imaging-genomics reveals driving pathways of MRI derived volumetric tumor phenotype features in Glioblastoma. BMC Cancer. 2016 Aug 8;16:611. doi: 10.1186/s12885-016-2659-5.
Datas de registro do estudo
Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
10 de março de 2021
Conclusão Primária (Antecipado)
30 de setembro de 2022
Conclusão do estudo (Antecipado)
30 de setembro de 2022
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
1 de março de 2021
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
7 de março de 2021
Primeira postagem (Real)
11 de março de 2021
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
24 de março de 2021
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
22 de março de 2021
Última verificação
1 de março de 2021
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- KY2021-059
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
NÃO
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
Não
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