手术代谢表型纵向评估研究 (SaMPLE)

系统的观点可以实时改善手术前后的手术决策。 具体来说，我们假设它可能提供比当前生化方法更准确的重要诊断和预后信息。 这是因为它解释了药物疗法和肠道微生物群等对手术结果的重要环境影响。

第二个假设是这种方法可以在手术过程中向操作者提供有关组织类型和病理学的实时分子反馈。

因此，这项工作将需要研究在一系列不同条件和状态下以及通过不同类型的手术干预进行手术的患者。 众所周知，例如癌症患者与非癌症患者的代谢需求截然不同。 这对于为接受手术的癌症患者制定个性化管理策略具有重要意义。 至关重要的是，这项研究最终证明该技术能够对具有显着不同疾病状态的患者进行描述，并且它可以将其与正在执行的外科手术的类型和程度以及手术时间区分开来。 因此，这项工作将涉及异质性患者群体。

学习规划：

这项研究将受到生物外科和外科技术部门内部提供的研究治理结构的约束，并结合生物分子医学部门，以安全使用样品和机器。 它还将拥有一个临床指导委员会，以评估工作的进展、临床结果、安全性和及时完成。

将为该试验招募两个独立的临床组。 第一个是接受择期手术的患者，第二个是接受紧急手术的患者。 这些组中的每一个都将包含临床条件的子类别，研究将重点关注这些子类别。

择期手术 (n=200)：

A. 癌症患者。 这将包括患有胃肠道和结直肠恶性肿瘤（包括通过显微手术切除的恶性肿瘤）、乳腺癌或肾脏实体瘤的患者。

B. 患有需要手术的肠道良性疾病的患者，例如 炎症性肠病 C. 良性手术条件，通常在日间手术环境中进行。 这些将特别是胆道树（胆结石）和前腹壁（例如胆结石）。 疝气手术）

如果患者在“两周”等待规则下被怀疑患有癌症，将被招募到圣玛丽医院门诊的普通外科、上消化道外科、乳腺和泌尿外科手术团队。

将在入院前门诊招募在伦敦圣玛丽医院的普通、上消化道或乳腺手术团队下接受择期住院手术的患者。

急性手术 (n=200)

在普通外科随叫随到团队的照料下到急症室就诊的患者将被招募到该研究组中。 该研究小组将有以下小组：

A. 急性腹痛，根据之前的伦理许可 B. 被认为是手术源的急性败血症患者。 C. 遭受严重创伤且损伤严重程度评分>15、多处受伤、需要手术或>1 个器官系统衰竭或被送入重症监护室的患者。

排除标准：

所有 18 岁以下的患者 所有怀孕的患者 在到达医院时通过心肺复苏术接受高级生命支持的患者。

晚期癌症患者在向临床团队介绍时仅适合姑息治疗。

首次出现其他已知恶性肿瘤并正在接受治疗的患者，例如 前列腺癌患者已经被招募到其他临床研究中。

这项研究将分为两个独立的阶段：

临床前工作：

选择性和急性手术入院的生物流体分析的临床前工作已经在动物和人体研究中进行，包括魔角旋转 (MAS)-1H NMR（也称为固态 NMR，因为组织不需要制备）、MS 和基质辅助激光解吸电离 (MALDI)-MS。 将使用这些技术分析在伦理许可下获得的先前研究的样本，以进行方法优化。 这将需要对结直肠癌样本（伦理参考：07/H0712/112 和 06/Q0403/16）以及取自急性胰腺炎和急腹症患者的样本（伦理参考：05/Q0403/201）进行代谢组学和宏基因组分析.

非必需品（即 良性或病理正常组织）在常规手术期间从同意的患者身上切除并应焚烧，将通过以下方式收集用于分析： 从一系列电灼装置收集的烟雾羽流的质谱分析。 这将允许优化 MS 协议，并将定义正常组织和各种组织类型的化学参数。

b.从乳腺癌、结肠癌和上消化道癌中切除的恶性组织将通过使用智能刀离体检测其检测正常和恶性疾病的能力。 这将在组织病理学家的指导下进行，并且不会干扰癌症的病理分期或治疗。

将使用这些数据开发用于非科学人员对复杂生化元数据进行分析解释的翻译软件。 这项工作将使用当前的重症监护临床数据库。

临床工作：

目的是使该技术能够很容易地应用于在 NHS 内接受手术的患者。 因此，将从两个手术途径招募患者：

急性护理：患者招募

患者将在事故和紧急情况下被招募。 只有通过此途径入院的患者才有资格参加研究。 将向患者提供信息表，患者将有 30 分钟时间考虑研究。 同意将由具有足够资格和训练有素的个人私下进行。 同意后，患者将被要求填写一份问卷，以提供可能影响结果的医疗和手术史以及代谢信息。

在某些情况下，可能无法获得同意，因为患者可能会失去知觉或因受伤而无法同意。 在这些情况下，将采集样本，当患者恢复意识和能力时，将获得正式同意。 如果在这个阶段，患者表示他们不想被纳入研究，他们的样本将被撤回。 如果患者死亡，样本将被纳入研究。 这是因为这些测试预测死亡率的能力是主要终点。

选择性护理：患者招募

将尽可能在门诊环境中招募患者，以确保他们有足够的时间接受临床信息并同意。 在做出手术决定后，我们将在患者入院接受治疗时对其进行抽样。

样品采集：

在这两种情况下，样本将在患者旅程中的设定时间点收集。 样本将与标准临床调查同时获取，以最大程度地减少患者的不适，并且不会在超过标准样本时间的情况下采集样本，以防止对患者进行不必要的调查。 样本采集将与圣玛丽医院的临床生化团队协调，尽可能避免不必要且耗时的采样。

术前：

血浆和尿液采集：

1. 在他们到达急症室时。 在他们入院期间或直到手术、出院或接受定义为手术、放射学或侵入性治疗干预的治疗之前，每 24 小时一次。

如果患者留在医院进行长期康复或非手术治疗，将每周采集样本直至出院。

粪便样本

到达 A+E 后的第一次排便。 术前和术前肠道准备样本。 这将在诊所或病房进行。

组织样本采集

术前活检

如果患者被送去进行常规内窥镜检查或活检，将采集组织样本进行代谢组学分析。

b.术中。

将对每个案例进行 MS 烟羽分析。 这不会干扰标准操作，也不会要求操作外科医生根据实验数据做出决定。 在癌症切除的情况下，将收集组织样本以保持肿瘤手术的原则。 在乳房手术的情况下，前哨淋巴结也将被采集并通过 NMR 进行分析。 在结直肠手术期间，将从标准收集点采集直肠系膜组织进行分析，而在上消化道癌症切除术中，将采用类似的原则进行取样。 在急性或紧急情况下，组织也将从被认为有缺血风险的组织区域（例如， 吻合部位是要连接的肠）。

粪便和小肠流出物将在手术时收集，以便也可以考虑手术对肠道微生物生态系统的影响。

C。术后。

在手术后的第一周，将根据当前的临床实践每天对尿液和血浆进行取样。 在可能的情况下，不会收集超出临床工作人员样本的额外样本。

还将收集粪便样本。 手术后将收集第一次排便，然后每次排便直到第一周完成，然后每周一次。

造口/回肠造口术的第一个动作：如果造口位于第一周，将每天采集样本。

然后每周收集样本直至出院。

如果患者返回手术室，样本采集程序将重新开始。

将在患者住院期间记录所有临床数据。 这将在可能的情况下参考术前信息和评估、生理数据、放射学发现、临床生物化学、手术和临床结果以及住院时间。 这将是匿名和编码的。

出院后，患者将在 8 周后被带回诊所，根据常规分析进行临床评估。 此时将采集尿液、血液和粪便样本。 根据帕丁顿圣玛丽医院的肿瘤学方案，肿瘤患者将接受为期五年的随访。