Étude d'évaluation longitudinale du phénotypage métabolique chirurgical (SaMPLE)

Une perspective systémique peut améliorer la prise de décision chirurgicale avant et après la chirurgie en temps réel. Plus précisément, nous émettons l'hypothèse qu'il peut fournir des informations diagnostiques et pronostiques importantes qui sont plus précises que les approches biochimiques actuelles. En effet, il représente des influences environnementales importantes sur les résultats chirurgicaux, telles que la pharmacothérapie et le microbiote intestinal.

L'hypothèse secondaire est que cette approche peut fournir une rétroaction moléculaire en temps réel à l'opérateur pendant la chirurgie sur le type de tissu et la pathologie.

Ce travail devra donc étudier les patients opérés dans une gamme de conditions et d'états différents, et par différents types d'interventions chirurgicales. On sait que les patients atteints de cancer, par exemple, ont des besoins métaboliques assez différents de ceux qui n'en ont pas. Cela a des implications importantes pour le développement de stratégies de gestion personnalisées pour les patients atteints de cancer subissant une intervention chirurgicale. Il est essentiel que cette étude prouve définitivement que la technologie est capable de faire une description entre des patients présentant des états pathologiques très différents et également qu'elle peut différencier cela du type et de l'ampleur de l'intervention chirurgicale pratiquée et du moment de l'intervention chirurgicale. Par conséquent, ce travail impliquera une cohorte hétérogène de patients.

Étudier le design:

Cette étude sera soumise à des structures de gouvernance de la recherche fournies en interne au sein du département de biochirurgie et de technologie chirurgicale en collaboration avec la section de médecine biomoléculaire pour une utilisation sûre des échantillons et des machines. Il disposera également d'un comité directeur clinique pour évaluer les progrès, les résultats cliniques, la sécurité et l'achèvement en temps opportun des travaux.

Deux groupes cliniques distincts seront recrutés pour cet essai. Le premier sera les patients subissant des procédures électives, le second sera ceux subissant des procédures d'urgence. Chacun de ces groupes contiendra des sous-catégories de conditions cliniques, sur lesquelles l'étude se concentrera.

Chirurgie non urgente (n=200) :

A. Patients atteints de cancer. Cela comprendra les patients atteints d'une tumeur maligne du tractus gastro-intestinal et colorectal (y compris ceux excisés par microchirurgie), d'un cancer du sein ou de tumeurs solides du rein.

B. Patients atteints de maladies bénignes de l'intestin nécessitant une intervention chirurgicale, par ex. maladie intestinale inflammatoire C. Affections chirurgicales bénignes, habituellement opérées en chirurgie d'un jour. Ceux-ci seront spécifiquement de l'arbre biliaire (calculs biliaires) et de la paroi abdominale antérieure (par ex. Chirurgie des hernies)

Les patients seront recrutés s'ils sont vus sous la règle d'attente de «deux semaines» avec un cancer suspecté pour les équipes de chirurgie générale, de chirurgie gastro-intestinale supérieure, de chirurgie mammaire et d'urologie à l'hôpital St. Mary's en ambulatoire.

Les patients qui se présentent pour une chirurgie hospitalière élective dans le cadre des équipes de chirurgie générale, gastro-intestinale supérieure ou mammaire de l'hôpital St. Mary's de Londres seront recrutés à la clinique de préadmission.

Chirurgie aiguë (n=200)

Les patients se présentant aux accidents et urgences sous la garde de l'équipe de garde de chirurgie générale seront recrutés dans ce groupe d'étude. Ce groupe d'étude comprendra les sous-groupes suivants :

A. Douleurs abdominales aiguës, conformément à l'autorisation éthique précédente B. Patients atteints de septicémie aiguë supposée être d'origine chirurgicale. C. Patients souffrant d'un traumatisme majeur avec un score de gravité de blessure > 15, blessures multiples, qui nécessitent une intervention chirurgicale ou qui ont > 1 système d'organe qui est défaillant ou qui sont admis au service de soins intensifs.

Critère d'exclusion:

Toutes les patientes de moins de 18 ans Toutes les patientes enceintes Les patientes sous réanimation cardiorespiratoire à leur arrivée à l'hôpital.

Patients atteints d'un cancer avancé ne pouvant recevoir que des soins palliatifs lors de la présentation à l'équipe clinique.

Les patients se présentant pour la première fois avec d'autres tumeurs malignes connues pour lesquelles ils reçoivent un traitement, par ex. Cancer de la prostate Patients déjà recrutés dans d'autres études cliniques.

Cette étude se décomposera en deux phases distinctes :

Travail préclinique :

Des travaux précliniques pour l'analyse des biofluides dans les admissions chirurgicales électives et aiguës ont déjà été réalisés dans des études animales et humaines en Magic Angle Spinning (MAS)-1H RMN (également connue sous le nom de RMN à l'état solide car le tissu ne nécessite pas de préparation), MS et Ionisation par désorption laser assistée par matrice (MALDI)-MS. Des échantillons d'études antérieures obtenus dans le cadre d'une autorisation éthique seront analysés à l'aide de ces techniques d'optimisation méthodologique. Cela impliquera le profilage métabonomique et métagénomique d'échantillons de cancer colorectal (Ethics Ref : 07/H0712/112 et 06/Q0403/16) et d'échantillons prélevés sur des patients atteints de pancréatite aiguë et de l'abdomen aigu (Ethics Ref : 05/Q0403/201) .

Non essentiel (c'est-à-dire Les tissus bénins ou pathologiquement normaux) excisés et destinés à être incinérés prélevés sur des patients consentants au cours d'une intervention chirurgicale de routine seront collectés pour analyse par : Spectrométrie de masse des panaches de fumée collectés à partir d'une gamme d'appareils d'électrocoagulation. Cela permettra d'optimiser les protocoles MS et de définir les paramètres chimiques pour les tissus normaux et pour divers types de tissus.

b. Le tissu malin excisé des cancers du sein, du côlon et de l'appareil digestif supérieur sera testé pour sa capacité à détecter les maladies normales et malignes à l'aide du couteau intelligent ex vivo. Ceci sera effectué sous la direction d'histopathologistes et n'interférera pas avec la stadification pathologique ou le traitement des cancers.

Le développement d'un logiciel de traduction pour l'interprétation analytique de métadonnées biochimiques complexes par du personnel non scientifique sera développé à l'aide de ces données. Ce travail utilisera les bases de données cliniques actuelles en soins intensifs.

Travail clinique :

L'objectif est que la technologie soit facilement applicable aux patients subissant une intervention chirurgicale au sein du NHS. Par conséquent, les patients seront recrutés à partir de deux voies chirurgicales :

Soins aigus : Recrutement des patients

Les patients seront recrutés en cas d'accident et d'urgence. Seuls les patients admis par cette voie seront éligibles pour l'inclusion dans l'étude. Les patients recevront une fiche d'information et le patient disposera de 30 minutes pour examiner l'étude. Le consentement sera recueilli en privé, par une personne dûment qualifiée et formée. Une fois consentis, les patients seront invités à remplir un questionnaire pour fournir leurs antécédents médicaux et chirurgicaux, ainsi que des informations métaboliques susceptibles d'influencer les résultats.

Il ne sera pas possible d'obtenir le consentement dans certains cas car les patients peuvent être inconscients ou incapables de donner leur consentement en raison d'une blessure. Dans ces cas, des échantillons seront prélevés et, lorsque le patient reprendra conscience et sa capacité, un consentement formel sera recueilli. Si à ce stade, le patient déclare ne pas vouloir être inclus dans l'étude, ses échantillons seront retirés. En cas de décès d'un patient, les échantillons seront inclus dans l'étude. En effet, la capacité de ces tests à prédire la mortalité est un critère d'évaluation principal.

Soins électifs : Recrutement des patients

Les patients seront recrutés en ambulatoire dans la mesure du possible afin de s'assurer qu'ils disposent de suffisamment de temps pour assimiler les informations cliniques et donner leur consentement. Nous échantillonnerons les patients lors de leur admission à l'hôpital pour traitement après que la décision de chirurgie ait été prise.

Collecte d'échantillons:

Des échantillons seront prélevés à des moments précis pendant le parcours du patient dans les deux cas. Les échantillons seront obtenus en même temps que les investigations cliniques standard afin de minimiser l'inconfort pour le patient, et ils ne seront pas prélevés au-delà des durées d'échantillonnage standard pour éviter une investigation inutile pour le patient. La collecte d'échantillons sera coordonnée avec l'équipe de biochimie clinique de l'hôpital St. Mary's dans la mesure du possible afin d'éviter un échantillonnage inutile et chronophage.

Pré opération :

Collecte de plasma et d'urine :

1. A leur arrivée en Accident et Urgence. Toutes les 24 heures pendant la durée de leur admission ou jusqu'à une intervention chirurgicale, une sortie ou un traitement défini comme une intervention thérapeutique chirurgicale, radiologique ou invasive.

Si le patient reste hospitalisé pour une rééducation prolongée ou une thérapie non chirurgicale, des échantillons seront prélevés chaque semaine jusqu'à sa sortie.

Échantillon de selles

Première selle après l'arrivée en A+E. Échantillon de préparation préopératoire et pré-intestinale avant la chirurgie. Celui-ci sera administré soit en clinique, soit dans le service.

Prélèvement d'échantillons de tissus

Biopsie préopératoire

Dans le cas où les patients sont envoyés pour une endoscopie ou une biopsie de routine, des échantillons de tissus seront prélevés pour une analyse métabonomique.

b. Peropératoire.

Une analyse des panaches de fumée par MS sera effectuée pour chaque cas. Cela n'interférera pas avec l'opération standard et le chirurgien opérateur ne sera pas invité à prendre une décision basée sur les données de l'expérience. En cas de résection de cancer, des échantillons de tissus seront prélevés conformément aux principes de la chirurgie oncologique. Dans les cas de chirurgie mammaire, les ganglions sentinelles seront également prélevés et analysés par RMN. Au cours de la chirurgie colorectale, des tissus du mésorectum seront prélevés pour analyse à partir de points de collecte standard et dans les résections de cancer gastro-intestinal supérieur, des principes similaires s'appliqueront pour l'échantillonnage. Dans les situations aiguës ou d'urgence, des tissus seront également prélevés dans des zones de tissus considérées comme à risque d'ischémie (par ex. sites anastomotiques où l'intestin doit être joint).

Les effluents des selles et de l'intestin grêle seront récoltés au moment de la chirurgie afin que l'effet de la chirurgie sur l'écosystème microbien de l'intestin puisse également être pris en compte.

c. Post opératoire.

L'urine et le plasma seront prélevés quotidiennement après l'opération conformément à la pratique clinique actuelle pendant la première semaine. Dans la mesure du possible, aucun échantillon supplémentaire ne sera prélevé au-delà de ceux prélevés par le personnel clinique.

Des échantillons de selles seront également prélevés. La première selle sera recueillie après la chirurgie, puis chaque mouvement jusqu'à la fin de la première semaine, puis chaque semaine par la suite.

Le premier mouvement depuis la stomie/iléostomie : si la stomie est implantée, des échantillons quotidiens seront prélevés pendant la première semaine.

Des échantillons hebdomadaires seront ensuite prélevés jusqu'à la sortie.

Dans le cas où un patient revient au bloc opératoire, la séquence de prélèvement d'échantillons recommencera.

Toutes les données cliniques seront enregistrées pendant toute la durée du séjour du patient. Cela fera référence aux informations préopératoires et à l'évaluation si possible, aux données physiologiques, aux résultats radiologiques, à la biochimie clinique, aux résultats chirurgicaux et cliniques et à la durée du séjour. Celle-ci sera anonyme et codée.

À leur sortie, les patients seront ramenés à la clinique à 8 semaines pour une évaluation clinique conformément à l'analyse de routine. Des échantillons d'urine, de sang et de selles seront prélevés à ce moment. Les patients oncologiques seront suivis pendant cinq ans conformément au protocole d'oncologie du St. Mary's Hospital Paddington.