Studie longitudinálního hodnocení chirurgického metabolického fenotypování (SaMPLE)

Systémová perspektiva může zlepšit chirurgické rozhodování před i po operaci v reálném čase. Konkrétně předpokládáme, že může poskytnout důležité diagnostické a prognostické informace, které jsou přesnější než současné biochemické přístupy. Je to proto, že představuje důležité vlivy prostředí na výsledek operace, jako je farmakoterapie a střevní mikroflóra.

Sekundární hypotéza je, že tento přístup může poskytnout operátorovi během operace molekulární zpětnou vazbu v reálném čase o typu tkáně a patologii.

Tato práce bude proto potřebovat studovat pacienty podstupující operaci za různých podmínek a stavů a ​​pomocí různých typů chirurgické intervence. Je známo, že pacienti s rakovinou mají například zcela odlišné metabolické požadavky než pacienti bez. To má významné důsledky pro vývoj personalizovaných strategií léčby pacientů s rakovinou podstupujících chirurgický zákrok. Je nezbytné, aby tato studie definitivně prokázala, že technologie je schopna provést popis mezi pacienty s výrazně odlišnými chorobnými stavy a také, že to dokáže odlišit od typu a velikosti prováděného chirurgického výkonu a načasování operace. Proto bude tato práce zahrnovat heterogenní kohortu pacientů.

Studovat design:

Tato studie bude předmětem výzkumných řídících struktur zajišťovaných interně v rámci oddělení biochirurgie a chirurgické technologie ve spojení se sekcí biomolekulární medicíny pro bezpečné používání vzorků a strojů. Bude mít také klinický řídící výbor, který bude posuzovat pokrok, klinické výsledky, bezpečnost a včasné dokončení práce.

Pro tuto studii budou vybrány dvě samostatné klinické skupiny. První budou pacienti podstupující elektivní výkony, druhou budou pacienti podstupující urgentní výkony. Každá z těchto skupin bude obsahovat podkategorie klinických stavů, na které se studie zaměří.

Volitelná chirurgie (n=200):

A. Pacienti s rakovinou. To bude zahrnovat pacienty s malignitou gastrointestinálního a kolorektálního traktu (včetně těch, které byly vyříznuty mikrochirurgicky), rakovinou prsu nebo solidními nádory ledvin.

B. Pacienti s benigními onemocněními střev vyžadujícími chirurgický zákrok, např. zánětlivé onemocnění střev C. Benigní chirurgické stavy, obvykle operované v prostředí jednodenní chirurgie. Konkrétně se bude jednat o žlučové kameny (žlučové kameny) a přední břišní stěnu (např. operace kýly)

Pacienti budou zařazováni do ambulantních týmů pro všeobecnou chirurgii, chirurgii horní části GI, prsu a urologii v nemocnici St. Mary, pokud budou spatřeni podle pravidla „dvou týdnů“ čekání s podezřením na rakovinu.

Na předpřijímací klinice budou přijati pacienti, kteří se účastní elektivního lůžkového chirurgického zákroku v rámci týmů pro obecný, horní GI nebo prsní chirurgii v nemocnici St. Mary's v Londýně.

Akutní operace (n=200)

Do této studijní skupiny budou zařazeni pacienti, kteří se dostaví k nehodě a pohotovosti v péči týmu všeobecné chirurgie. Tato studijní skupina bude mít tyto podskupiny:

A. Akutní bolest břicha podle předchozího etického atestu B. Pacienti s akutní sepsí, u nichž se předpokládá, že jsou chirurgického původu. C. Pacienti trpící velkým traumatem se skóre závažnosti poranění >15, vícečetnými poraněními, kteří vyžadují operaci nebo kteří mají >1 orgánový systém, který selhal, nebo kteří jsou přijati na oddělení intenzivní péče.

Kritéria vyloučení:

Všichni pacienti mladší 18 let Všechny pacientky, které jsou těhotné Pacienti, kteří dostávají pokročilou podporu života pomocí kardiopulmonální resuscitace při příjezdu do nemocnice.

Pacienti s pokročilým karcinomem vhodní pouze pro paliativní péči při prezentaci klinickému týmu.

Pacienti, u nichž se poprvé objeví jiné známé malignity, pro které jsou léčeni, např. Rakovina prostaty Pacienti již byli zařazeni do jiných klinických studií.

Tato studie bude rozdělena do dvou samostatných fází:

Preklinické práce:

Preklinické práce pro analýzu biofluidů u elektivních a akutních chirurgických přijetí již byly provedeny ve studiích na zvířatech i na lidech v Magic Angle Spinning (MAS)-1H NMR (také známé jako NMR v pevném stavu, protože tkáň nevyžaduje přípravu), MS a Ionizace laserové desorpce za pomoci matrice (MALDI)-MS. Vzorky z předchozích studií získané v rámci etického prověření budou analyzovány pomocí těchto technik pro metodickou optimalizaci. To bude zahrnovat metabonomické a metagenomické profilování vzorků kolorektálního karcinomu (Etické číslo: 07/H0712/112 a 06/Q0403/16) a vzorků odebraných pacientům s akutní pankreatitidou a akutním břichem (Etické číslo: 05/Q0403/201) .

Nepodstatné (tj. Benigní nebo patologicky normální tkáň) vyříznutá a určená ke spálení odebraná od souhlasných pacientů během rutinního chirurgického zákroku bude shromážděna k analýze pomocí: Hmotnostní spektrometrie oblaků kouře odebraných z řady elektrokauterizačních zařízení. To umožní optimalizaci MS protokolů a bude definovat chemické parametry pro normální tkáň a pro různé typy tkání.

b. Maligní tkáň vyříznutá z rakoviny prsu, tlustého střeva a horní části GI bude testována na schopnost detekovat normální a maligní onemocnění pomocí inteligentního nože ex vivo. To bude prováděno pod vedením histopatologů a nebude to narušovat patologický staging nebo léčbu rakoviny.

S využitím těchto dat bude vyvinut vývoj translačního softwaru pro analytickou interpretaci komplexních biochemických metadat nevědeckými pracovníky. Tato práce bude využívat současné klinické databáze intenzivní péče.

Klinická práce:

Cílem je, aby byla technologie snadno použitelná pro pacienty podstupující operaci v rámci NHS. Proto budou pacienti rekrutováni ze dvou chirurgických cest:

Akutní péče: Nábor pacientů

Pacienti budou náborováni v případě nehody a nouze. Pouze pacienti přijatí touto cestou budou způsobilí pro zařazení do studie. Pacientům bude poskytnut informační list a pacient bude ponechán 30 minut na zvážení studie. Souhlas bude udělen soukromě, přiměřeně kvalifikovanou a vyškolenou osobou. Po souhlasu budou pacienti požádáni o vyplnění dotazníku, který poskytne lékařskou a chirurgickou anamnézu a metabolické informace, které by mohly ovlivnit výsledky.

V některých případech nebude možné získat souhlas, protože pacienti mohou být v bezvědomí nebo nemohou souhlasit kvůli zranění. V těchto případech budou odebrány vzorky, a když pacient nabude vědomí a kapacity, bude odebrán formální souhlas. Pokud v této fázi pacient prohlásí, že nechce být zařazen do studie, jeho vzorky budou staženy. V případě úmrtí pacienta budou vzorky zařazeny do studie. Je tomu tak proto, že schopnost těchto testů předpovídat mortalitu je primárním koncovým bodem.

Volitelná péče: Nábor pacientů

Pacienti budou přijímáni v ambulantním prostředí, kdykoli to bude možné, aby bylo zajištěno, že budou mít dostatek času na přijetí klinických informací a na vyjádření souhlasu. Odebereme vzorky pacientů při jejich přijetí do nemocnice k ošetření po rozhodnutí o operaci.

Kolekce vzorků:

V obou případech budou vzorky odebírány ve stanovených časových bodech během cesty pacienta. Vzorky budou odebírány současně se standardními klinickými vyšetřeními, aby se minimalizovalo nepohodlí pro pacienta, a nebudou odebírány nad rámec standardních vzorkovacích časů, aby se zabránilo zbytečnému vyšetření pacienta. Odběr vzorků bude koordinován s týmem klinické biochemie v nemocnici St. Mary, kde to bude možné, aby se předešlo zbytečnému a časově náročnému odběru vzorků.

Před operací:

Sběr plazmy a moči:

1. Při jejich příjezdu do nehody a nouze. Každých 24 hodin po dobu jejich přijetí nebo do operace, propuštění nebo léčby definované jako chirurgický, radiologický nebo invazivní terapeutický zákrok.

Pokud pacient zůstává v nemocnici na prodlouženou rehabilitaci nebo nechirurgickou terapii, vzorky budou odebírány týdně až do propuštění.

Vzorek stolice

První pohyb střev po příjezdu do A+E. Vzorek předoperační a preparace střeva před operací. To bude podáváno buď na klinice nebo na oddělení.

Sbírka vzorků tkání

Předoperační biopsie

V případě, že jsou pacienti odesláni na rutinní endoskopii nebo biopsii, budou odebrány vzorky tkáně pro metabonomickou analýzu.

b. Intraoperační.

Pro každý případ bude provedena analýza oblaků kouře MS. To nebude narušovat standardní provoz a operující chirurg nebude požádán o rozhodnutí na základě dat z experimentu. V případě nádorových resekcí budou odebírány vzorky tkáně v rámci zásad onkologické chirurgie. V případě operace prsu budou také odebrány sentinelové lymfatické uzliny a analyzovány pomocí NMR. Při kolorektální operaci bude tkáň z mezorekta odebírána k analýze ze standardních odběrových míst au resekcí karcinomu horní části GI budou platit podobné principy pro odběry. V akutních nebo nouzových situacích bude tkáň odebrána také z oblastí tkáně, o nichž se předpokládá, že jsou ohroženy ischemií (např. místa anastomózy, kde se má spojit střevo).

Stolice a výkaly z tenkého střeva budou odebírány v době operace, aby bylo možné zohlednit i účinek operace na střevní mikrobiální ekosystém.

C. Po operaci.

Vzorky moči a plazmy budou odebírány denně po operaci v souladu se současnou klinickou praxí první týden. Kdykoli to bude možné, nebudou odebírány žádné další vzorky kromě těch, které odebírá klinický personál.

Dále budou odebrány vzorky stolice. První pohyb střev bude shromážděn po operaci a poté každý pohyb až do dokončení prvního týdne a poté každý týden.

První pohyb ze stomie / ileostomie: Pokud je stomie umístěna, budou se odebírat denní vzorky po dobu prvního týdne.

Týdenní vzorky pak budou odebírány až do propuštění.

V případě, že se pacient vrátí do sálu, bude sekvence odběru vzorků znovu zahájena.

Všechny klinické údaje budou zaznamenávány po dobu pobytu pacienta. To se bude týkat předoperačních informací a tam, kde je to možné, fyziologických údajů, radiologických nálezů, klinické biochemie, chirurgického a klinického výsledku a délky pobytu. Toto bude anonymní a zakódované.

Po propuštění budou pacienti po 8 týdnech odvezeni zpět na kliniku ke klinickému posouzení podle rutinní analýzy. V této době budou odebrány vzorky moči, krve a stolice. Onkologičtí pacienti budou sledováni po dobu pěti let podle onkologického protokolu v nemocnici St. Mary's Paddington.