基于剪接的预测学习在结直肠癌个体化化疗评估中的应用 (SPLICE)
2026年7月6日 更新者：City of Hope Medical Center
基于剪接的预测性学习在结直肠癌个体化疗评估中的应用(SPLICE)
结直肠癌（CRC）仍然是全球癌症相关死亡的主要原因之一。 尽管辅助化疗可提高根治性切除术后的生存率，但其疗效在患者之间存在显著差异。 缺乏可靠的预测性生物标志物常导致过度治疗或治疗不足。
本研究旨在利用肿瘤来源的可变剪接特征，开发一种基于机器学习的辅助化疗反应预测模型。
通过整合RNA测序数据、剪接异构体与临床结局，本研究致力于识别术后治疗反应和复发风险的分子预测因子。
研究概览
详细说明
结直肠癌（CRC）仍然是全球主要的健康负担，辅助化疗是根治性切除术后的标准治疗方案。 然而，患者对治疗的反应差异很大，目前尚无经过验证的分子模型指导辅助治疗的选择。
最新研究表明，异常的选择性剪接（而非单纯的基因水平表达）在决定化疗敏感性和肿瘤复发方面起着关键作用。 但这些复杂的转录组变异往往被标准差异表达分析所遗漏。
ASPAIRE框架（选择性剪接与预测性机器学习响应评估）应用先进的计算模型，从RNA测序数据中捕获多维剪接特征，并将其转化为具有临床指导意义的预测结果。
在本研究中，研究人员将利用机器学习预测CRC的辅助化疗反应。 研究计划将分三个阶段实施：
- 通过RNA测序和计算特征提取，识别与辅助化疗反应相关的选择性剪接模式。
- 研究人员将基于逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）开发检测方法，并训练机器学习模型预测化疗反应。
- 研究人员将对该检测方法进行独立验证。 该检测方法暂命名为"SPLICE"（基于剪接的结直肠癌个体化化疗评估预测学习系统），并将测试治疗后长达五年的无病生存率。
研究结束时，该检测方法将完成开发与验证，通过预测无病生存期为临床决策提供支持。
研究类型
观察性的
注册 (估计的)
200
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习联系方式
- 姓名：Ajay Goel, PhD
- 电话号码：626-218-3452
- 邮箱：ajgoel@coh.org
学习地点
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California
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Duarte、California、美国、91010
- 招聘中
- City of Hope Medical Center
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接触：
- Ajay Goel, PhD
- 电话号码：626-218-3452
- 邮箱：ajgoel@coh.org
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
不
取样方法
非概率样本
研究人群
两个独立的结直肠癌患者队列，在根治性手术后接受了辅助化疗。
描述
纳入标准：
- 经组织学确认的II-III期结直肠癌（TNM分期，第8版）
- 根治性切除术后接受标准辅助化疗
- 化疗前可获得肿瘤组织（FFPE或冷冻样本）
- 具备足够临床数据用于结局分析（复发、生存）
- 年龄18-80岁
排除标准：
- 炎症性肠病
- RNA质量不足或缺乏知情同意
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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结直肠癌无应答者（训练队列）
在第一队列中，原发性肿瘤治疗后60个月内发生复发性结直肠癌的结直肠癌无应答者
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一组RNA剪接异构体，其水平在源自原发肿瘤的组织样本中进行检测。
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结直肠癌应答者（训练队列）
在首个队列中，原发性肿瘤治疗后60个月内未发生结直肠癌复发的结直肠癌应答者
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一组RNA剪接异构体，其水平在源自原发肿瘤的组织样本中进行检测。
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结直肠癌无应答者，伴有复发疾病（验证队列）
在第二个独立验证队列中，原发肿瘤治疗后60个月内发生复发性结直肠癌的结直肠癌无应答者
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一组RNA剪接异构体，其水平在源自原发肿瘤的组织样本中进行检测。
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结直肠癌应答者（验证队列）
在第二个独立验证队列中，原发性肿瘤治疗后60个月内未发生复发性结直肠癌的结直肠癌应答者
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一组RNA剪接异构体，其水平在源自原发肿瘤的组织样本中进行检测。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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无复发生存期
大体时间：从疾病治疗开始之日起至死亡日期或最长60个月
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从疾病治疗到复发性结直肠癌发生的时间
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从疾病治疗开始之日起至死亡日期或最长60个月
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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总生存期
大体时间：从疾病治疗开始之日起至死亡日期或最长60个月
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从疾病治疗开始至任何原因导致死亡的时间
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从疾病治疗开始之日起至死亡日期或最长60个月
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员：Ajay Goel, PhD、City of Hope Medical Center
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
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- Andre T, Boni C, Navarro M, Tabernero J, Hickish T, Topham C, Bonetti A, Clingan P, Bridgewater J, Rivera F, de Gramont A. Improved overall survival with oxaliplatin, fluorouracil, and leucovorin as adjuvant treatment in stage II or III colon cancer in the MOSAIC trial. J Clin Oncol. 2009 Jul 1;27(19):3109-16. doi: 10.1200/JCO.2008.20.6771. Epub 2009 May 18.
- Andre T, Meyerhardt J, Iveson T, Sobrero A, Yoshino T, Souglakos I, Grothey A, Niedzwiecki D, Saunders M, Labianca R, Yamanaka T, Boukovinas I, Vernerey D, Meyers J, Harkin A, Torri V, Oki E, Georgoulias V, Taieb J, Shields A, Shi Q. Effect of duration of adjuvant chemotherapy for patients with stage III colon cancer (IDEA collaboration): final results from a prospective, pooled analysis of six randomised, phase 3 trials. Lancet Oncol. 2020 Dec;21(12):1620-1629. doi: 10.1016/S1470-2045(20)30527-1.
- Di Narzo AF, Tejpar S, Rossi S, Yan P, Popovici V, Wirapati P, Budinska E, Xie T, Estrella H, Pavlicek A, Mao M, Martin E, Scott W, Bosman FT, Roth A, Delorenzi M. Test of four colon cancer risk-scores in formalin fixed paraffin embedded microarray gene expression data. J Natl Cancer Inst. 2014 Sep 22;106(10):dju247. doi: 10.1093/jnci/dju247. Print 2014 Oct.
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- Okuno K, Kandimalla R, Mendiola M, Balaguer F, Bujanda L, Fernandez-Martos C, Aparicio J, Feliu J, Tokunaga M, Kinugasa Y, Maurel J, Goel A. A microRNA signature for risk-stratification and response prediction to FOLFOX-based adjuvant therapy in stage II and III colorectal cancer. Mol Cancer. 2023 Jan 20;22(1):13. doi: 10.1186/s12943-022-01699-2. No abstract available.
- Zhang JX, Song W, Chen ZH, Wei JH, Liao YJ, Lei J, Hu M, Chen GZ, Liao B, Lu J, Zhao HW, Chen W, He YL, Wang HY, Xie D, Luo JH. Prognostic and predictive value of a microRNA signature in stage II colon cancer: a microRNA expression analysis. Lancet Oncol. 2013 Dec;14(13):1295-306. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70491-1. Epub 2013 Nov 13.
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- Zhang M, Chen C, Lu Z, Cai Y, Li Y, Zhang F, Liu Y, Chen S, Zhang H, Yang S, Gen H, Jiang Y, Ning C, Huang J, Wang W, Fan L, Zhang Y, Jin M, Han J, Xiong Z, Cai M, Liu J, Huang C, Yang X, Xu B, Li H, Li B, Zhu X, Wei Y, Zhu Y, Tian J, Miao X. Genetic Control of Alternative Splicing and its Distinct Role in Colorectal Cancer Mechanisms. Gastroenterology. 2023 Nov;165(5):1151-1167. doi: 10.1053/j.gastro.2023.07.019. Epub 2023 Aug 3.
- Reichling C, Taieb J, Derangere V, Klopfenstein Q, Le Malicot K, Gornet JM, Becheur H, Fein F, Cojocarasu O, Kaminsky MC, Lagasse JP, Luet D, Nguyen S, Etienne PL, Gasmi M, Vanoli A, Perrier H, Puig PL, Emile JF, Lepage C, Ghiringhelli F. Artificial intelligence-guided tissue analysis combined with immune infiltrate assessment predicts stage III colon cancer outcomes in PETACC08 study. Gut. 2020 Apr;69(4):681-690. doi: 10.1136/gutjnl-2019-319292. Epub 2019 Nov 28.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2024年6月21日
初级完成 (估计的)
2028年6月18日
研究完成 (估计的)
2028年6月18日
研究注册日期
首次提交
2025年11月3日
首先提交符合 QC 标准的
2025年11月5日
首次发布 (实际的)
2025年11月10日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2026年7月7日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2026年7月6日
最后验证
2026年7月1日
更多信息
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