- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT07226115
Splejsningsbaseret Prædiktiv Læring for Individuel Kemoterapivurdering ved Tyk- og Endetarmskræft (SPLICE)
Splejsningsbaseret Prædiktiv Læring for Individuel Kemoterapivurdering ved Tyk- og Endetarmskræft (SPLICE)
Kolorektal cancer (CRC) forbliver en af de førende årsager til kræftrelateret dødelighed worldwide. Selvom adjuvant kemoterapi forbedrer overlevelsen efter kurativ resektion, varierer dens effektivitet væsentligt mellem patienter. Fraværet af pålidelige prædiktive biomarkører fører ofte til overbehandling eller underbehandling.
Denne studie har til formål at udvikle en maskinlæringsbaseret prædiktiv model for adjuvant kemoterapirespons ved hjælp af tumorafledte alternative sammensætningssignaturer.
Ved at integrere RNA-seq-data, sammensætningsisoformer og kliniske resultater sigter denne studie mod at identificere molekylære prædiktorer for behandlingsrespons og recidivrisiko efter kirurgi.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Tyk- og endetarmskræft (CRC) forbliver en stor global sundhedsbyrde, hvor adjuvanskemoterapi repræsenterer standardbehandlingen efter kurativ resektion. Imidlertid varierer patienters respons på terapi væsentligt, og der findes i øjeblikket ingen valideret molekylær model, der vejleder valg af adjuvansbehandling.
Nylige undersøgelser antyder, at aberrant alternativ splejsning – snarere end genniveau-ekspression alene – spiller en afgørende rolle i udformningen af kemoterapifølsomhed og tumorrecidiv. Disse komplekse transkriptomiske variationer overses dog ofte af standard differentialekspressionsanalyser.
ASPAIRE-rammen (Alternative Splicing and Predictive mAchIne learnIng for Response Evaluation) anvender avanceret computermodellering til at fange multidimensionelle splejsningsfunktioner fra RNA-seq-data og omdanne dem til klinisk anvendelige forudsigelser.
I denne forskningsindsats vil forskerne udnytte maskinlæring til at forudsige adjuvanskemoterapirespons for CRC. Forskningsplanen vil anvende tre faser:
- Identifikation af alternative splejsningsmønstre associeret med adjuvanskemoterapirespons gennem RNA-sekventering og computermæssig funktionsudtrækning.
- Forskerne vil derefter udvikle en test baseret på reverse transkription-kvantitativ polymerasekædereaktion (RT-qPCR) og træne en maskinlæringsmodel til at forudsige kemoterapirespons.
- Forskerne vil uafhængigt validere testen. Denne test betegnes foreløbigt som "SPLICE" (Splicing-based Predictive Learning for Individual Chemotherapy Evaluation in Colorectal Cancer) og vil blive testet for sygdomsfri overlevelse op til fem år efter behandling.
Ved afslutningen af denne undersøgelse vil denne test være blevet udviklet og valideret for at hjælpe klinisk beslutningstagning ved at forudsige både sygdomsfri overlevelse.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-mail: ajgoel@coh.org
Studiesteder
-
-
California
-
Duarte, California, Forenede Stater, 91010
- Rekruttering
- City of Hope Medical Center
-
Kontakt:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-mail: ajgoel@coh.org
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Histologisk bekræftet kolorektal kræft i stadie II-III (TNM-klassifikation, 8. udgave)
- Har modtaget standard adjuvant kemoterapi efter kurativ resection
- Tilgængelighed af tumorvæv (FFPE eller frossent) før kemoterapi
- Tilstrækkelige kliniske data til udfaldanalyse (recidiv, overlevelse)
- Alder 18-80 år
Eksklusionskriterier:
- Inflammatorisk tarmsygdom
- Utilstrækkelig RNA-kvalitet eller manglende samtykke
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Non-respondere ved tyktarmskræft (Træningskohorte)
Non-respondere med tyktarmskræft, som udviklede tilbagevendende tyktarmskræft inden for 60 måneder fra primær tumorbehandling, i den første kohort
|
Et panel af RNA-splisning-isotyper, hvis niveau testes i vævsprøver fra den primære tumor.
|
|
Respondenter med tyktarmskræft (Træningskohorte)
Respondenter med tyktarmskræft, som ikke udviklede tilbagevendende tyktarmskræft inden for 60 måneder fra primær tumorbehandling, i den første kohort
|
Et panel af RNA-splisning-isotyper, hvis niveau testes i vævsprøver fra den primære tumor.
|
|
Non-respondere med kolorektal cancer, med tilbagevendende sygdom (Valideringskohorte)
Non-respondere med tyktarmskræft, som udviklede tilbagevendende CRC inden for 60 måneder efter primær tumorbehandling, i den anden, uafhængige, valideringskohorte
|
Et panel af RNA-splisning-isotyper, hvis niveau testes i vævsprøver fra den primære tumor.
|
|
Respondenter med tyktarmskræft (Valideringskohorte)
Respondenter med tyktarmskræft, som ikke udviklede tilbagevendende tyktarmskræft inden for 60 måneder fra primær tumørbehandling, i den anden, uafhængige valideringskohort
|
Et panel af RNA-splisning-isotyper, hvis niveau testes i vævsprøver fra den primære tumor.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Reccidivfri Overlevelse
Tidsramme: fra dato for sygdomsbehandling til dødsdato eller op til 60 måneder
|
Tid fra sygdomsbehandling til udvikling af tilbagevendende tyktarmskræft
|
fra dato for sygdomsbehandling til dødsdato eller op til 60 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Samlet overlevelse
Tidsramme: fra dato for sygdomsbehandling til dødsdato eller op til 60 måneder
|
Tid fra sygdomsbehandling til død af enhver årsag
|
fra dato for sygdomsbehandling til dødsdato eller op til 60 måneder
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Dienstmann R, Salazar R, Tabernero J. Personalizing colon cancer adjuvant therapy: selecting optimal treatments for individual patients. J Clin Oncol. 2015 Jun 1;33(16):1787-96. doi: 10.1200/JCO.2014.60.0213. Epub 2015 Apr 27.
- Andre T, Boni C, Navarro M, Tabernero J, Hickish T, Topham C, Bonetti A, Clingan P, Bridgewater J, Rivera F, de Gramont A. Improved overall survival with oxaliplatin, fluorouracil, and leucovorin as adjuvant treatment in stage II or III colon cancer in the MOSAIC trial. J Clin Oncol. 2009 Jul 1;27(19):3109-16. doi: 10.1200/JCO.2008.20.6771. Epub 2009 May 18.
- Andre T, Meyerhardt J, Iveson T, Sobrero A, Yoshino T, Souglakos I, Grothey A, Niedzwiecki D, Saunders M, Labianca R, Yamanaka T, Boukovinas I, Vernerey D, Meyers J, Harkin A, Torri V, Oki E, Georgoulias V, Taieb J, Shields A, Shi Q. Effect of duration of adjuvant chemotherapy for patients with stage III colon cancer (IDEA collaboration): final results from a prospective, pooled analysis of six randomised, phase 3 trials. Lancet Oncol. 2020 Dec;21(12):1620-1629. doi: 10.1016/S1470-2045(20)30527-1.
- Di Narzo AF, Tejpar S, Rossi S, Yan P, Popovici V, Wirapati P, Budinska E, Xie T, Estrella H, Pavlicek A, Mao M, Martin E, Scott W, Bosman FT, Roth A, Delorenzi M. Test of four colon cancer risk-scores in formalin fixed paraffin embedded microarray gene expression data. J Natl Cancer Inst. 2014 Sep 22;106(10):dju247. doi: 10.1093/jnci/dju247. Print 2014 Oct.
- Auclin E, Zaanan A, Vernerey D, Douard R, Gallois C, Laurent-Puig P, Bonnetain F, Taieb J. Subgroups and prognostication in stage III colon cancer: future perspectives for adjuvant therapy. Ann Oncol. 2017 May 1;28(5):958-968. doi: 10.1093/annonc/mdx030.
- Okuno K, Kandimalla R, Mendiola M, Balaguer F, Bujanda L, Fernandez-Martos C, Aparicio J, Feliu J, Tokunaga M, Kinugasa Y, Maurel J, Goel A. A microRNA signature for risk-stratification and response prediction to FOLFOX-based adjuvant therapy in stage II and III colorectal cancer. Mol Cancer. 2023 Jan 20;22(1):13. doi: 10.1186/s12943-022-01699-2. No abstract available.
- Zhang JX, Song W, Chen ZH, Wei JH, Liao YJ, Lei J, Hu M, Chen GZ, Liao B, Lu J, Zhao HW, Chen W, He YL, Wang HY, Xie D, Luo JH. Prognostic and predictive value of a microRNA signature in stage II colon cancer: a microRNA expression analysis. Lancet Oncol. 2013 Dec;14(13):1295-306. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70491-1. Epub 2013 Nov 13.
- Gray RG, Quirke P, Handley K, Lopatin M, Magill L, Baehner FL, Beaumont C, Clark-Langone KM, Yoshizawa CN, Lee M, Watson D, Shak S, Kerr DJ. Validation study of a quantitative multigene reverse transcriptase-polymerase chain reaction assay for assessment of recurrence risk in patients with stage II colon cancer. J Clin Oncol. 2011 Dec 10;29(35):4611-9. doi: 10.1200/JCO.2010.32.8732. Epub 2011 Nov 7.
- Zhang M, Chen C, Lu Z, Cai Y, Li Y, Zhang F, Liu Y, Chen S, Zhang H, Yang S, Gen H, Jiang Y, Ning C, Huang J, Wang W, Fan L, Zhang Y, Jin M, Han J, Xiong Z, Cai M, Liu J, Huang C, Yang X, Xu B, Li H, Li B, Zhu X, Wei Y, Zhu Y, Tian J, Miao X. Genetic Control of Alternative Splicing and its Distinct Role in Colorectal Cancer Mechanisms. Gastroenterology. 2023 Nov;165(5):1151-1167. doi: 10.1053/j.gastro.2023.07.019. Epub 2023 Aug 3.
- Reichling C, Taieb J, Derangere V, Klopfenstein Q, Le Malicot K, Gornet JM, Becheur H, Fein F, Cojocarasu O, Kaminsky MC, Lagasse JP, Luet D, Nguyen S, Etienne PL, Gasmi M, Vanoli A, Perrier H, Puig PL, Emile JF, Lepage C, Ghiringhelli F. Artificial intelligence-guided tissue analysis combined with immune infiltrate assessment predicts stage III colon cancer outcomes in PETACC08 study. Gut. 2020 Apr;69(4):681-690. doi: 10.1136/gutjnl-2019-319292. Epub 2019 Nov 28.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 23228/SPLICE
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Kolorektal cancer
-
University of ArkansasRekrutteringColorectal cancer og inflammatorisk tarmsygdomForenede Stater
-
University Health Network, TorontoAstraZenecaAktiv, ikke rekrutterendeAdenocarcinom i bugspytkirtlen | Leiomyosarkom | Mismatch Reparation Proficient Colorectal CancerCanada
-
Stingray TherapeuticsRekrutteringRefractory Metastatic Microsatellite Stabil Colorectal Cancer (MSS-CRC)Forenede Stater
-
IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di BolognaIkke rekrutterer endnuKolorektal kirurgi | Robotkirurgi | Colorectal cancer og inflammatorisk tarmsygdom
-
Tianjin Medical University Cancer Institute and...RekrutteringMSI-H Advanced Colorectal CancerKina
-
Bristol-Myers SquibbAfsluttetMikrosatellit stabil kolorektal cancer | Mismatch Reparation Proficient Colorectal Cancer | Mikrosatellit ustabil kolorektal cancer | Mismatch Reparation Manglende tyktarmskræftForenede Stater, Australien, Belgien, Canada, Irland, Italien, Spanien, Frankrig
-
Syndax PharmaceuticalsMerck Sharp & Dohme LLCAfsluttetMelanom | Ikke-småcellet lungekræft | Mismatch Reparation-Proficient Colorectal CancerForenede Stater