Spleiß-basiertes prädiktives Lernen zur individuellen Chemotherapiebewertung bei Darmkrebs (SPLICE)
5. November 2025 aktualisiert von: City of Hope Medical Center
Splicing-basierte prädiktive Lernverfahren zur individuellen Chemotherapiebewertung bei kolorektalem Karzinom (SPLICE)
Darmkrebs (CRC) bleibt weltweit eine der häufigsten Ursachen für krebsbedingte Sterblichkeit. Obwohl adjuvante Chemotherapie das Überleben nach kurativer Resektion verbessert, variiert ihre Wirksamkeit stark zwischen den Patienten. Das Fehlen zuverlässiger prädiktiver Biomarker führt häufig zu Über- oder Unterbehandlung.
Diese Studie zielt darauf ab, ein auf maschinellem Lernen basierendes prädiktives Modell für das Ansprechen auf adjuvante Chemotherapie unter Verwendung tumorspezifischer Alternatives-Spleißen-Signaturen zu entwickeln.
Durch die Integration von RNA-Seq-Daten, Spleißisoformen und klinischen Ergebnissen strebt diese Studie an, molekulare Prädiktoren für das Therapieansprechen und das Rückfallrisiko nach der Operation zu identifizieren.
Studienübersicht
Status
Rekrutierung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Darmkrebs (CRC) bleibt eine große globale Gesundheitsbelastung, wobei die adjuvante Chemotherapie den Standard der Behandlung nach kurativer Resektion darstellt. Allerdings variieren die Patientenreaktionen auf die Therapie stark, und derzeit gibt es kein validiertes molekulares Modell, das die Auswahl der adjuvanten Behandlung leitet.
Jüngste Studien deuten darauf hin, dass aberrantes alternatives Spleißen – und nicht nur die Genexpression auf Ebene der Gene – eine entscheidende Rolle bei der Beeinflussung der Chemotherapieempfindlichkeit und des Tumorrückfalls spielt. Dennoch werden diese komplexen transkriptomischen Variationen oft von standardmäßigen Differentialexpressionsanalysen übersehen.
Der ASPAIRE-Rahmen (Alternative Splicing and Predictive mAchIne learnIng for Response Evaluation) wendet fortschrittliche computergestützte Modellierung an, um mehrdimensionale Spleißmerkmale aus RNA-Seq-Daten zu erfassen und sie in klinisch handlungsrelevante Vorhersagen umzuwandeln.
In dieser Forschungsarbeit werden die Untersuchenden maschinelles Lernen nutzen, um das Ansprechen auf die adjuvante Chemotherapie bei CRC vorherzusagen. Der Forschungsplan wird drei Phasen umfassen:
- Identifizierung von alternativen Spleißmustern, die mit dem Ansprechen auf die adjuvante Chemotherapie verbunden sind, durch RNA-Sequenzierung und computergestützte Merkmalsextraktion.
- Die Untersuchenden werden dann einen Assay auf Basis der reversen Transkription-quantitativen Polymerasekettenreaktion (RT-qPCR) entwickeln und ein maschinelles Lernmodell trainieren, um das Chemotherapieansprechen vorherzusagen.
- Die Untersuchenden werden den Assay unabhängig validieren. Dieser Assay wird vorläufig als "SPLICE" (Splicing-based Predictive Learning for Individual Chemotherapy Evaluation in Colorectal Cancer) bezeichnet und auf krankheitsfreies Überleben bis zu fünf Jahre nach der Behandlung getestet.
Am Ende dieser Studie wird dieser Assay entwickelt und validiert sein, um die klinische Entscheidungsfindung durch die Vorhersage des krankheitsfreien Überlebens zu unterstützen.
Studientyp
Beobachtungs
Einschreibung (Geschätzt)
200
Kontakte und Standorte
Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.
Studienkontakt
- Name: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-Mail: ajgoel@coh.org
Studienorte
-
-
California
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Duarte, California, Vereinigte Staaten, 91010
- Rekrutierung
- City of Hope Medical Center
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Kontakt:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-Mail: ajgoel@coh.org
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Teilnahmekriterien
Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Nein
Probenahmeverfahren
Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe
Studienpopulation
Zwei unabhängige Kohorten von Darmkrebspatienten, die nach kurativer Operation eine adjuvante Chemotherapie erhielten.
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Histologisch bestätigtes Stadium II-III Darmkrebs (TNM-Klassifikation, 8. Auflage)
- Standardadjuvante Chemotherapie nach kurativer Resektion erhalten
- Verfügbarkeit von Tumorgewebe (FFPE oder gefroren) vor der Chemotherapie
- Ausreichende klinische Daten für die Ergebnisanalyse (Rezidiv, Überleben)
- Alter 18-80 Jahre Stadium
Ausschlusskriterien:
- Entzündliche Darmerkrankung
- Unzureichende RNA-Qualität oder fehlende Einwilligung
Studienplan
Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Non-Responder bei kolorektalem Karzinom (Trainingskohorte)
Nichtansprecher von Darmkrebs, die innerhalb von 60 Monaten nach der Primärtumorbehandlung ein rezidivierendes CRC entwickelten, in der ersten Kohorte
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Ein Panel von RNA-Spleiß-Isoformen, deren Spiegel in Gewebeproben aus dem Primärtumor getestet wird.
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Responder von Darmkrebs (Trainingskohorte)
Responder mit kolorektalem Karzinom, die innerhalb von 60 Monaten nach der Behandlung des Primärtumors im ersten Kohorte kein rezidivierendes KRK entwickelten
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Ein Panel von RNA-Spleiß-Isoformen, deren Spiegel in Gewebeproben aus dem Primärtumor getestet wird.
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Non-Responder von kolorektalem Karzinom mit rezidivierender Erkrankung (Validierungskohorte)
Non-Responder mit kolorektalem Karzinom, die innerhalb von 60 Monaten nach der Primärtumorbehandlung ein rezidivierendes CRC im zweiten, unabhängigen Validierungskollektiv entwickelten
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Ein Panel von RNA-Spleiß-Isoformen, deren Spiegel in Gewebeproben aus dem Primärtumor getestet wird.
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Responder von Darmkrebs (Validierungskohorte)
Responder mit kolorektalem Karzinom, die innerhalb von 60 Monaten nach der Behandlung des Primärtumors kein rezidivierendes kolorektales Karzinom entwickelten, in der zweiten, unabhängigen Validierungskohorte
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Ein Panel von RNA-Spleiß-Isoformen, deren Spiegel in Gewebeproben aus dem Primärtumor getestet wird.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Rezidivfreies Überleben
Zeitfenster: vom Datum der Krankheitsbehandlung bis zum Datum des Todes oder bis zu 60 Monaten
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Zeit von der Krankheitsbehandlung bis zur Entwicklung eines rezidivierenden kolorektalen Karzinoms
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vom Datum der Krankheitsbehandlung bis zum Datum des Todes oder bis zu 60 Monaten
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Gesamtüberleben
Zeitfenster: vom Datum der Krankheitsbehandlung bis zum Tod oder bis zu 60 Monate
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Zeit von der Behandlung der Krankheit bis zum Tod aus jeglicher Ursache
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vom Datum der Krankheitsbehandlung bis zum Tod oder bis zu 60 Monate
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Mitarbeiter und Ermittler
Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikationen und hilfreiche Links
Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.
Allgemeine Veröffentlichungen
- Dienstmann R, Salazar R, Tabernero J. Personalizing colon cancer adjuvant therapy: selecting optimal treatments for individual patients. J Clin Oncol. 2015 Jun 1;33(16):1787-96. doi: 10.1200/JCO.2014.60.0213. Epub 2015 Apr 27.
- Andre T, Boni C, Navarro M, Tabernero J, Hickish T, Topham C, Bonetti A, Clingan P, Bridgewater J, Rivera F, de Gramont A. Improved overall survival with oxaliplatin, fluorouracil, and leucovorin as adjuvant treatment in stage II or III colon cancer in the MOSAIC trial. J Clin Oncol. 2009 Jul 1;27(19):3109-16. doi: 10.1200/JCO.2008.20.6771. Epub 2009 May 18.
- Andre T, Meyerhardt J, Iveson T, Sobrero A, Yoshino T, Souglakos I, Grothey A, Niedzwiecki D, Saunders M, Labianca R, Yamanaka T, Boukovinas I, Vernerey D, Meyers J, Harkin A, Torri V, Oki E, Georgoulias V, Taieb J, Shields A, Shi Q. Effect of duration of adjuvant chemotherapy for patients with stage III colon cancer (IDEA collaboration): final results from a prospective, pooled analysis of six randomised, phase 3 trials. Lancet Oncol. 2020 Dec;21(12):1620-1629. doi: 10.1016/S1470-2045(20)30527-1.
- Di Narzo AF, Tejpar S, Rossi S, Yan P, Popovici V, Wirapati P, Budinska E, Xie T, Estrella H, Pavlicek A, Mao M, Martin E, Scott W, Bosman FT, Roth A, Delorenzi M. Test of four colon cancer risk-scores in formalin fixed paraffin embedded microarray gene expression data. J Natl Cancer Inst. 2014 Sep 22;106(10):dju247. doi: 10.1093/jnci/dju247. Print 2014 Oct.
- Auclin E, Zaanan A, Vernerey D, Douard R, Gallois C, Laurent-Puig P, Bonnetain F, Taieb J. Subgroups and prognostication in stage III colon cancer: future perspectives for adjuvant therapy. Ann Oncol. 2017 May 1;28(5):958-968. doi: 10.1093/annonc/mdx030.
- Okuno K, Kandimalla R, Mendiola M, Balaguer F, Bujanda L, Fernandez-Martos C, Aparicio J, Feliu J, Tokunaga M, Kinugasa Y, Maurel J, Goel A. A microRNA signature for risk-stratification and response prediction to FOLFOX-based adjuvant therapy in stage II and III colorectal cancer. Mol Cancer. 2023 Jan 20;22(1):13. doi: 10.1186/s12943-022-01699-2. No abstract available.
- Zhang JX, Song W, Chen ZH, Wei JH, Liao YJ, Lei J, Hu M, Chen GZ, Liao B, Lu J, Zhao HW, Chen W, He YL, Wang HY, Xie D, Luo JH. Prognostic and predictive value of a microRNA signature in stage II colon cancer: a microRNA expression analysis. Lancet Oncol. 2013 Dec;14(13):1295-306. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70491-1. Epub 2013 Nov 13.
- Gray RG, Quirke P, Handley K, Lopatin M, Magill L, Baehner FL, Beaumont C, Clark-Langone KM, Yoshizawa CN, Lee M, Watson D, Shak S, Kerr DJ. Validation study of a quantitative multigene reverse transcriptase-polymerase chain reaction assay for assessment of recurrence risk in patients with stage II colon cancer. J Clin Oncol. 2011 Dec 10;29(35):4611-9. doi: 10.1200/JCO.2010.32.8732. Epub 2011 Nov 7.
- Zhang M, Chen C, Lu Z, Cai Y, Li Y, Zhang F, Liu Y, Chen S, Zhang H, Yang S, Gen H, Jiang Y, Ning C, Huang J, Wang W, Fan L, Zhang Y, Jin M, Han J, Xiong Z, Cai M, Liu J, Huang C, Yang X, Xu B, Li H, Li B, Zhu X, Wei Y, Zhu Y, Tian J, Miao X. Genetic Control of Alternative Splicing and its Distinct Role in Colorectal Cancer Mechanisms. Gastroenterology. 2023 Nov;165(5):1151-1167. doi: 10.1053/j.gastro.2023.07.019. Epub 2023 Aug 3.
- Reichling C, Taieb J, Derangere V, Klopfenstein Q, Le Malicot K, Gornet JM, Becheur H, Fein F, Cojocarasu O, Kaminsky MC, Lagasse JP, Luet D, Nguyen S, Etienne PL, Gasmi M, Vanoli A, Perrier H, Puig PL, Emile JF, Lepage C, Ghiringhelli F. Artificial intelligence-guided tissue analysis combined with immune infiltrate assessment predicts stage III colon cancer outcomes in PETACC08 study. Gut. 2020 Apr;69(4):681-690. doi: 10.1136/gutjnl-2019-319292. Epub 2019 Nov 28.
Studienaufzeichnungsdaten
Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
21. Juni 2024
Primärer Abschluss (Geschätzt)
18. Juni 2026
Studienabschluss (Geschätzt)
18. Juni 2026
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
3. November 2025
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
5. November 2025
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
10. November 2025
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
10. November 2025
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
5. November 2025
Zuletzt verifiziert
1. November 2025
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- 23228/SPLICE
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
NEIN
Beschreibung des IPD-Plans
Die für die Studie gesammelten Daten werden anderen zur Verfügung gestellt, einschließlich anonymisierter Teilnehmerdaten, bei Veröffentlichung über eine unterzeichnete Datenzugangsvereinbarung und nach Ermessen der Genehmigung der Ermittler für die vorgeschlagene Verwendung solcher Daten.
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Nein
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Nein
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