Integrative-omics af forstyrret KOL Small Airway Epithelium
Studieoversigt
Detaljeret beskrivelse
Hypotese: Vi antager, at den uordnede differentiering af SAE, der karakteriserer KOL, er resultatet af den komplekse interaktion mellem cigaretrøgskomponenter med et hierarki af genetiske, epigenetiske, genekspression og metabolomiske netværksinteraktioner, når BC differentieres til et mucociliært epitel.
Specifikt mål 1. Ved at bruge en integreret netværkssystemtilgang til at analysere vores omfattende eksisterende SAE-omiske datasæt på genetiske, epigenetiske (methylerings-), genekspressions-, mikroRNA- og metabolomiske niveauer, for at udvikle en indledende model af netværksforbindelser og vigtige netværkstrykpunkter, der er relevante for SAE-biologi i sundhed og sygdom.
Specifikt mål 2. For at forfine modellen vil et omfattende omics-datasæt blive indsamlet på flere tidspunkter, da SAE BC for ikke-rygere og KOL-rygere differentierer sig til normalt og uordnet mucociliært epitel (henholdsvis) på luft-væske-grænseflade (ALI) kultur, en in vitro-model af SAE-differentiering. Beregningsstrategierne fra mål 1 vil blive brugt til at forbedre modellen med disse data.
Specifikt mål 3. For at teste og færdiggøre den integrerede netværksmodel vil et parallelt omics-datasæt blive genereret fra BC fra ikke-rygere og KOL-rygere, efterhånden som de differentierer på ALI under forhold, hvor nøglehubs vil blive op- eller nedreguleret og differentieringen proces stresset under forhold, der efterligner in vivo SAE-miljøet. Slutresultatet vil være en integreret systemmodel af SAE-biologi og hvordan dette er forstyrret i KOL.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
New York
-
New York, New York, Forenede Stater, 10065
- Weill Cornell Medical College
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Sunde ikke-rygere (n=50)
Inklusionskriterier
- Skal være tilmeldt IRB godkendt protokol #1204012331 (alle inklusionskriterier fra protokol #1204012331 gælder således for denne protokol)
- Selvrapporterede aldrig-rygere, med nuværende rygestatus valideret ved fravær af nikotinmetabolitter i urinen (nikotin mindre end 2 ng/ml og cotinin mindre end 5 ng/ml)
- Negativ HIV-serologi
Rygere med KOL (n=50)
Inklusionskriterier
- Skal være tilmeldt IRB godkendt protokol #1204012331 (alle inklusionskriterier fra protokol #1204012331 gælder således for denne protokol)
- Selvrapporterede nuværende daglige rygere med mere end eller lig med 10 pakke-år, valideret af et af følgende: urin nikotin større end 30 ng/ml eller urin cotinin større end 50 ng/ml
- Opfylder GOLD stadier I-III kriterier for kronisk obstruktiv lungesygdom (KOL) baseret på postbronkodilatator spirometri
- Tager nogen eller ingen pulmonal-relateret medicin, inklusive beta-agonister, antikolinergika eller inhalerede kortikosteroider
- Negativ HIV-serologi
Sunde ikke-rygere (n=50)
Eksklusionskriterier
- Kan ikke opfylde inklusionskriterierne (alle eksklusionskriterier fra protokol #1204012331 gælder for denne protokol)
- Tegn på malignitet inden for de seneste 5 år
Rygere med KOL (n=50)
Eksklusionskriterier
- Kan ikke opfylde inklusionskriterierne (alle eksklusionskriterier fra protokol #1204012331 gælder for denne protokol)
- Personer, hvor deltagelse i undersøgelsen ville kompromittere den normale pleje og forventede progression af deres sygdom
- Tegn på malignitet inden for de seneste 5 år
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
|---|
|
Sunde ikke-rygere
Fysisk vurdering, EKG, blod- og urintapning, røntgen af thorax, lungefunktionstest (PFT) og bronkoskopi
|
|
Rygere med KOL
Fysisk vurdering, EKG, blod- og urintapning, røntgen af thorax, lungefunktionstest (PFT) og bronkoskopi
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Identifikation af netværkstrykpunkter, der er relevante for SAE-biologi, bekræftet ved analyse af SAE-datasæt.
Tidsramme: Et år
|
Ved at bruge en integreret netværkssystemtilgang til at analysere vores omfattende eksisterende SAE-omiske datasæt på genetiske, epigenetiske (methylerings-), genekspressions-, mikroRNA- og metabolomiske niveauer, for at udvikle en indledende model af netværksforbindelser og vigtige netværkstrykpunkter, der er relevante for SAE-biologi i sundhed og sygdom.
|
Et år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Andre undersøgelses-id-numre
- 1301013416
- R01HL118541 (U.S. NIH-bevilling/kontrakt)
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .