Integrative Omics des gestörten COPD-Epithels der kleinen Atemwege
Studienübersicht
Detaillierte Beschreibung
Hypothese: Wir gehen davon aus, dass die gestörte Differenzierung der SAE, die COPD charakterisiert, aus der komplexen Interaktion von Zigarettenrauchkomponenten mit einer Hierarchie von genetischen, epigenetischen, Genexpressions- und Metabolomik-Netzwerkinteraktionen resultiert, während sich die BC in ein mukoziliäres Epithel differenzieren.
Konkretes Ziel 1. Mithilfe eines integrierten Netzwerksystemansatzes analysieren wir unsere umfangreichen vorhandenen SAE-Omic-Datensätze auf genetischer, epigenetischer (Methylierung), Genexpressions-, microRNA- und Metabolomics-Ebene, um ein erstes Modell der Netzwerkkonnektivitäten und wichtigen Netzwerkdruckpunkte zu entwickeln, die für die SAE-Biologie relevant sind Gesundheit und Krankheit.
Spezifisches Ziel 2. Um das Modell zu verfeinern, wird ein umfassender Omics-Datensatz zu mehreren Zeitpunkten gesammelt, da SAE BC von Nichtrauchern und COPD-Rauchern auf der Luft-Flüssigkeits-Schnittstellenkultur (ALI) zu normalem bzw. gestörtem mukoziliärem Epithel differenzieren In-vitro-Modell der SAE-Differenzierung. Die Berechnungsstrategien aus Ziel 1 werden verwendet, um das Modell mit diesen Daten zu verbessern.
Spezifisches Ziel 3. Um das integrierte Netzwerkmodell zu testen und zu finalisieren, wird ein paralleler Omics-Datensatz aus BC von Nichtrauchern und COPD-Rauchern generiert, während sie sich auf ALI unter Bedingungen differenzieren, bei denen wichtige Hubs hoch- oder herunterreguliert werden und die Differenzierung erfolgt Prozess unter Bedingungen, die der SAE-Umgebung in vivo nachahmen. Das Endergebnis wird ein integriertes Systemmodell der SAE-Biologie und ihrer Störungen bei COPD sein.
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
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New York
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New York, New York, Vereinigte Staaten, 10065
- Weill Cornell Medical College
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Gesunde Nichtraucher (n=50)
Einschlusskriterien
- Muss in das vom IRB genehmigte Protokoll Nr. 1204012331 eingeschrieben sein (alle Einschlusskriterien aus Protokoll Nr. 1204012331 gelten daher für dieses Protokoll)
- Selbstberichtete Nichtraucher, wobei der aktuelle Raucherstatus durch das Fehlen von Nikotinmetaboliten im Urin bestätigt wird (Nikotin weniger als 2 ng/ml und Cotinin weniger als 5 ng/ml)
- Negative HIV-Serologie
Raucher mit COPD (n=50)
Einschlusskriterien
- Muss in das vom IRB genehmigte Protokoll Nr. 1204012331 eingeschrieben sein (alle Einschlusskriterien aus Protokoll Nr. 1204012331 gelten daher für dieses Protokoll)
- Selbstberichtete aktuelle tägliche Raucher mit mehr als oder gleich 10 Packungen pro Jahr, bestätigt durch einen der folgenden Werte: Urin-Nikotin über 30 ng/ml oder Urin-Cotinin über 50 ng/ml
- Erfüllung der GOLD-Kriterien der Stadien I–III für chronisch obstruktive Lungenerkrankung (COPD) basierend auf der Postbronchodilatator-Spirometrie
- Einnahme jeglicher oder keiner pulmonalbezogenen Medikamente, einschließlich Beta-Agonisten, Anticholinergika oder inhalativer Kortikosteroide
- Negative HIV-Serologie
Gesunde Nichtraucher (n=50)
Ausschlusskriterien
- Die Einschlusskriterien können nicht erfüllt werden (alle Ausschlusskriterien aus Protokoll Nr. 1204012331 gelten für dieses Protokoll)
- Hinweise auf eine Malignität innerhalb der letzten 5 Jahre
Raucher mit COPD (n=50)
Ausschlusskriterien
- Die Einschlusskriterien können nicht erfüllt werden (alle Ausschlusskriterien aus Protokoll Nr. 1204012331 gelten für dieses Protokoll)
- Personen, bei denen die Teilnahme an der Studie die normale Pflege und das erwartete Fortschreiten ihrer Krankheit beeinträchtigen würde
- Hinweise auf eine Malignität innerhalb der letzten 5 Jahre
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
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Gesunde Nichtraucher
Körperliche Untersuchung, EKG, Blut- und Urinabnahme, Röntgenaufnahme des Brustkorbs, Lungenfunktionstest (PFT) und Bronchoskopie
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Raucher mit COPD
Körperliche Untersuchung, EKG, Blut- und Urinabnahme, Röntgenaufnahme des Brustkorbs, Lungenfunktionstest (PFT) und Bronchoskopie
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Identifizierung von Netzwerkdruckpunkten, die für die SAE-Biologie relevant sind, bestätigt durch Analyse von SAE-Datensätzen.
Zeitfenster: Ein Jahr
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Mithilfe eines integrierten Netzwerksystemansatzes analysieren wir unsere umfangreichen vorhandenen SAE-Omic-Datensätze auf genetischer, epigenetischer (Methylierung), Genexpressions-, microRNA- und Metabolomics-Ebene, um ein erstes Modell der Netzwerkkonnektivitäten und wichtigen Netzwerkdruckpunkte zu entwickeln, die für die SAE-Biologie relevant sind Gesundheit und Krankheit.
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Ein Jahr
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Mitarbeiter und Ermittler
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Schätzen)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Andere Studien-ID-Nummern
- 1301013416
- R01HL118541 (US NIH Stipendium/Vertrag)
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