Интегративно-омика эпителия мелких дыхательных путей при ХОБЛ
Обзор исследования
Подробное описание
Гипотеза. Мы предполагаем, что неупорядоченная дифференцировка СНЯ, которая характеризует ХОБЛ, является результатом сложного взаимодействия компонентов сигаретного дыма с иерархией генетических, эпигенетических, экспрессионных и метаболомных сетевых взаимодействий по мере того, как РМЖ дифференцируется в мукоцилиарный эпителий.
Конкретная цель 1. Использование интегрированного сетевого системного подхода для анализа наших обширных существующих наборов омических данных SAE на генетическом, эпигенетическом (метилирование), уровне экспрессии генов, микроРНК и метаболомике для разработки исходной модели сетевых связей и ключевых точек давления в сети, имеющих отношение к биологии SAE в здоровье и болезнь.
Конкретная цель 2. Для уточнения модели комплексный набор данных omics будет собираться в различные моменты времени по мере того, как SAE BC у некурящих и курильщиков с ХОБЛ дифференцируется в нормальный и нарушенный мукоцилиарный эпителий (соответственно) на культуре поверхности раздела воздух-жидкость (ALI), in vitro модель дифференцировки SAE. Вычислительные стратегии из цели 1 будут использоваться для улучшения модели с этими данными.
Конкретная цель 3. Чтобы протестировать и доработать интегрированную сетевую модель, будет создан параллельный набор данных omics из BC от некурящих и курильщиков с ХОБЛ, поскольку они дифференцируются по ALI в условиях, когда ключевые центры будут регулироваться вверх или вниз, а дифференциация стрессовый процесс в условиях, имитирующих среду SAE in vivo. Конечным результатом будет интегрированная системная модель биологии SAE и того, как она нарушается при ХОБЛ.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
New York
-
New York, New York, Соединенные Штаты, 10065
- Weill Cornell Medical College
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Здоровые некурящие (n=50)
Критерии включения
- Должен быть зарегистрирован в одобренном IRB протоколе № 1204012331 (таким образом, все критерии включения из протокола № 1204012331 применяются к этому протоколу)
- Самооценка никогда не куривших, чей текущий статус курения подтверждается отсутствием метаболитов никотина в моче (никотин менее 2 нг/мл и котинин менее 5 нг/мл)
- Отрицательная серология ВИЧ
Курильщики с ХОБЛ (n=50)
Критерии включения
- Должен быть зарегистрирован в одобренном IRB протоколе № 1204012331 (таким образом, все критерии включения из протокола № 1204012331 применяются к этому протоколу)
- Текущие ежедневные курильщики, сообщающие о себе сами, с объемом курения более или равным 10 пачкам в год, подтвержденным любым из следующих признаков: содержание никотина в моче более 30 нг/мл или содержание котинина в моче более 50 нг/мл
- Соответствие критериям GOLD I-III стадий хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) на основании постбронхолитической спирометрии
- прием каких-либо лекарств, связанных с легочными заболеваниями, включая бета-агонисты, антихолинергические средства или ингаляционные кортикостероиды;
- Отрицательная серология ВИЧ
Здоровые некурящие (n=50)
Критерий исключения
- Невозможно выполнить критерии включения (к этому протоколу применяются все критерии исключения из протокола № 1204012331)
- Признаки злокачественного новообразования в течение последних 5 лет
Курильщики с ХОБЛ (n=50)
Критерий исключения
- Невозможно выполнить критерии включения (к этому протоколу применяются все критерии исключения из протокола № 1204012331)
- Лица, у которых участие в исследовании может поставить под угрозу нормальный уход и ожидаемое прогрессирование их заболевания.
- Признаки злокачественного новообразования в течение последних 5 лет
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
|---|
|
Здоровые некурящие
Физикальное обследование, ЭКГ, забор крови и мочи, рентген грудной клетки, исследование функции легких (PFT) и бронхоскопия
|
|
Курильщики с ХОБЛ
Физикальное обследование, ЭКГ, забор крови и мочи, рентген грудной клетки, исследование функции легких (PFT) и бронхоскопия
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Идентификация точек давления в сети, имеющих отношение к биологии SAE, подтверждается анализом наборов данных SAE.
Временное ограничение: Один год
|
Использование интегрированного сетевого системного подхода для анализа наших обширных существующих наборов омических данных SAE на генетическом, эпигенетическом (метилирование), уровне экспрессии генов, микроРНК и метаболомике для разработки исходной модели сетевых связей и ключевых точек давления в сети, имеющих отношение к биологии SAE в здоровье и болезнь.
|
Один год
|
Соавторы и исследователи
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Оценивать)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Другие идентификационные номера исследования
- 1301013416
- R01HL118541 (Грант/контракт NIH США)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .