Integrative-omics dell'epitelio delle piccole vie aeree della BPCO disordinato
Panoramica dello studio
Descrizione dettagliata
Ipotesi: ipotizziamo che la differenziazione disordinata del SAE che caratterizza la BPCO derivi dalla complessa interazione dei componenti del fumo di sigaretta con una gerarchia di interazioni genetiche, epigenetiche, di espressione genica e di rete metabolomica mentre il BC si differenzia in un epitelio mucociliare.
Obiettivo specifico 1. Utilizzando un approccio di sistemi di rete integrati per analizzare i nostri vasti set di dati omici SAE esistenti a livello genetico, epigenetico (metilazione), espressione genica, microRNA e metabolomica, per sviluppare un modello iniziale di connettività di rete e punti chiave di pressione di rete rilevanti per la biologia SAE in salute e malattia.
Obiettivo specifico 2. Per perfezionare il modello, sarà raccolto un set di dati omici completo in più punti temporali mentre SAE BC di non fumatori e fumatori con BPCO si differenziano in epitelio mucociliare normale e disordinato (rispettivamente) sulla coltura dell'interfaccia aria-liquido (ALI), un modello in vitro di differenziazione SAE. Le strategie computazionali dell'obiettivo 1 saranno utilizzate per migliorare il modello con questi dati.
Obiettivo specifico 3. Per testare e finalizzare il modello di rete integrato, verrà generato un set di dati omici paralleli da BC di non fumatori e fumatori di BPCO mentre si differenziano su ALI in condizioni in cui gli hub chiave saranno regolati verso l'alto o verso il basso e la differenziazione processo stressato in condizioni che imitano l'ambiente SAE in vivo. Il risultato finale sarà un modello di sistemi integrati della biologia SAE e di come questo sia disordinato nella BPCO.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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New York
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New York, New York, Stati Uniti, 10065
- Weill Cornell Medical College
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Non fumatori sani (n=50)
Criterio di inclusione
- Deve essere iscritto al protocollo n. 1204012331 approvato dall'IRB (tutti i criteri di inclusione del protocollo n. 1204012331 si applicano quindi a questo protocollo)
- Autodichiarati non fumatori, con stato di fumatore attuale convalidato dall'assenza di metaboliti della nicotina nelle urine (nicotina inferiore a 2 ng/ml e cotinina inferiore a 5 ng/ml)
- Sierologia HIV negativa
Fumatori con BPCO (n=50)
Criterio di inclusione
- Deve essere iscritto al protocollo n. 1204012331 approvato dall'IRB (tutti i criteri di inclusione del protocollo n. 1204012331 si applicano quindi a questo protocollo)
- Fumatori giornalieri auto-dichiarati con quantità pari o superiore a 10 pacchetti-anno, convalidati da uno dei seguenti: nicotina urinaria superiore a 30 ng/ml o cotinina urinaria superiore a 50 ng/ml
- Soddisfazione dei criteri GOLD stadi I-III per la malattia polmonare cronica ostruttiva (BPCO) sulla base della spirometria postbroncodilatatore
- Assunzione di qualsiasi o nessun farmaco correlato ai polmoni, inclusi beta-agonisti, anticolinergici o corticosteroidi per via inalatoria
- Sierologia HIV negativa
Non fumatori sani (n=50)
Criteri di esclusione
- Impossibile soddisfare i criteri di inclusione (tutti i criteri di esclusione del protocollo n. 1204012331 si applicano a questo protocollo)
- Evidenza di malignità negli ultimi 5 anni
Fumatori con BPCO (n=50)
Criteri di esclusione
- Impossibile soddisfare i criteri di inclusione (tutti i criteri di esclusione del protocollo n. 1204012331 si applicano a questo protocollo)
- Soggetti nei quali la partecipazione allo studio comprometterebbe le normali cure e la progressione prevista della loro malattia
- Evidenza di malignità negli ultimi 5 anni
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
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Non fumatori sani
Valutazione fisica, elettrocardiogramma, prelievo di sangue e urine, radiografia del torace, test di funzionalità polmonare (PFT) e broncoscopia
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Fumatori con BPCO
Valutazione fisica, elettrocardiogramma, prelievo di sangue e urine, radiografia del torace, test di funzionalità polmonare (PFT) e broncoscopia
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Identificazione dei punti di pressione della rete rilevanti per la biologia SAE confermata dall'analisi dei set di dati SAE.
Lasso di tempo: Un anno
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Utilizzando un approccio di sistemi di rete integrati per analizzare i nostri vasti set di dati omici SAE esistenti a livello genetico, epigenetico (metilazione), espressione genica, microRNA e metabolomica, per sviluppare un modello iniziale di connettività di rete e punti chiave di pressione di rete rilevanti per la biologia SAE in salute e malattia.
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Un anno
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Collaboratori e investigatori
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Effettivo)
Completamento dello studio (Effettivo)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stima)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Altri numeri di identificazione dello studio
- 1301013416
- R01HL118541 (Sovvenzione/contratto NIH degli Stati Uniti)
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