En ikke-invasiv og screenings miRNA-signatur for gastrointestinal cancer (MiGIC)

I denne undersøgelse vil vi etablere en omfattende, retrospektiv, international multicenter-kohorte bestående af perifere blodprøver fra patienter med store gastrointestinale kræftformer - herunder hepatocellular karcinom (HCC), cholangiocarcinom (CCA), pancreatic ductal adenocarcinom (PDAC), øsofagus spinocelulært karcinom (ESCC), mavekræft (GC) og kolorektal kræft (CRC) - samt ikke-maligne kontrolgrupper. Small RNA-sekventering vil blive udført for at opnå højopløselige cirkulerende miRNA-udtryksprofiler.<\/p>

I opdagelsesfasen vil vi anvende streng præprocessering, normalisering, batch-effekt korrektion og differentiel ekspressionsanalyse for at identificere cirkulerende miRNA'er associeret med malign transformation på tværs af GI-kræfttyper. Machine learning-baseret funktionsselektion (f.eks. LASSO, mRMR og ensemble-selektion) og klassifikatorkonstruktion (f.eks. SVM, Random Forest, XGBoost) vil derefter blive anvendt til at udlede et minimalt og robust miRNA-panel, der optimalt skelner mellem kræft og ikke-kræft.<\/p>

I modellerings- og evalueringsfasen vil den identificerede miRNA-signatur gennemgå international multicenter-træning og validering, hvilket sikrer reproducerbarhed på tværs af geografiske regioner, sekventeringsplatforme og kliniske demografier. Ud over binær klassifikation vil vi yderligere evaluere panelets evne til at skelne mellem forskellige GI-kræftsubtyper, hvilket understøtter differentialdiagnose og tumoroprindelsesinferens. Modelydelse vil blive vurderet ved brug af AUROC, sensitivitet ved klinisk relevante specificitetstærskler, stadiespecifik detektionsevne (med vægt på tidlige stadietumorer) og kalibrering i uafhængige kohorter.<\/p>

Gennem denne sekventielle opdagelse → modellering → multicenter-valideringspipeline sigter vi mod at konstruere en ikke-invasiv cirkulerende miRNA-panel i stand til (1) præcist at skelne mellem kræft og ikke-kræft individer og (2) at differentiere mellem flere gastrointestinale kræfttyper, hvilket derved giver et klinisk skalerbart værktøj til tidlig opsporing og befolkningsniveau-screening.<\/p>