Uma Assinatura de miRNA Não Invasiva e de Rastreio para Cancro Gastrointestinal (MiGIC)

Neste estudo, iremos estabelecer uma coorte internacional multicêntrica retrospetiva abrangente, constituída por amostras de sangue periférico de doentes com principais cancros gastrointestinais - incluindo carcinoma hepatocelular (HCC), colangiocarcinoma (CCA), adenocarcinoma ductal pancreático (PDAC), carcinoma de células escamosas do esófago (ESCC), cancro gástrico (GC) e cancro colorretal (CRC) - bem como controlos não malignos. Será realizada sequenciação de pequenos ARN para obter perfis de expressão de miRNA circulante de alta resolução.

Durante a fase de descoberta, aplicaremos pré-processamento rigoroso, normalização, correção de efeitos de lote e análise de expressão diferencial para identificar miRNAs circulantes associados à transformação maligna em vários tipos de cancro gastrointestinal. A seleção de características baseada em aprendizagem automática (por exemplo, LASSO, mRMR e seleção por ensemble) e construção de classificadores (por exemplo, SVM, Random Forest, XGBoost) serão então empregues para derivar um painel de miRNA mínimo e robusto que discrimine optimalmente cancro de não-cancro.

Na fase de modelação e avaliação, a assinatura de miRNA identificada será submetida a treino e validação internacional multicêntrica, garantindo reprodutibilidade entre regiões geográficas, plataformas de sequenciação e dados demográficos clínicos. Para além da classificação binária, avaliaremos adicionalmente a capacidade do painel para distinguir entre diferentes subtipos de cancro gastrointestinal, apoiando o diagnóstico diferencial e a inferência da origem tumoral. O desempenho do modelo será avaliado usando AUROC, sensibilidade em limiares de especificidade clinicamente relevantes, capacidade de deteção específica por estadio (com ênfase em tumores em estadio inicial) e calibração em coortes independentes.

Através deste pipeline sequencial descoberta → modelação → validação multicêntrica, pretendemos construir um painel de miRNA circulante não invasivo capaz de (1) distinguir com precisão indivíduos com cancro de indivíduos sem cancro e (2) diferenciar múltiplos tipos de cancro gastrointestinal, fornecendo assim uma ferramenta clinicamente escalável para deteção precoce e rastreio a nível populacional.