- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT07224750
Ei-invasiivinen ja seulontaan soveltuva miRNA-merkki suolistokanavasyövälle (MiGIC)
Ei-invasiivinen ja seulontaan tarkoitettu miRNA-signatuuri ruoansulatuskanavan syövälle
Gastrointestinaliset (GI) syövät edelleen merkittävä maailmanlaajuinen terveyshaitta, pääasiassa tehokkaiden ja saatavilla olevien varhaisten seulontastrategioiden puutteen vuoksi. Nykyiset diagnostiset menetelmät – mukaan lukien endoskopia, tietokonetomografia (CT) ja magneettikuvaus (MRI) – ovat joko invasiivisia, resurssi-intensiivisiä tai riittämättömän herkkiä varhaisen vaiheen sairauden havaitsemiseen, eivätkä ne sovellu väestölaajuiseen seulontaan tai useiden GI-kasvaintyyppien samanaikaiseen tunnistamiseen. Tästä johtuen monet potilaat diagnosoidaan edelleen myöhäisissä vaiheissa, mikä johtaa rajoittuneisiin hoitovaihtoehtoihin ja huonoon ennusteeseen.
Kiertävät mikroRNA:t (miRNA:t) tarjoavat lupaavan ratkaisun, sillä ne ovat stabiileja veressä ja heijastavat kasvainliittyviä molekyylimuutoksia. Tässä tutkimuksessa pyrimme kehittämään ja validoimaan robustin ei-invasiivisen miRNA-allekirjoituksen, joka kykenee erottamaan GI-syövät ei-pahanlaatuisista kontrolliryhmistä. Integroimalla monikohorttitietoja ja soveltamalla koneoppimiseen perustuvaa piirteiden valintaa ja ennustavaa mallinnusta rakennamme seulontapaneelin, joka on optimoitu toistettavuuteen, skaalautuvuuteen ja varhaisen vaiheen havaitsemiseen. Tällä ei-invasiivisella miRNA-allekirjoituksella on potentiaalia mahdollistaa saavutettava, kustannustehokas ja kliinisesti käytännöllinen väestötason seulonta GI-syöville, mikä lopulta helpottaa aiempaa diagnosointia ja parantaa potilaiden hoitotuloksia.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tässä tutkimuksessa muodostamme kattavan, retrospektiivisen, kansainvälisen monikeskuksen kohortin, joka koostuu perifeerisistä verinäytteistä suolistotulehduksiin liittyvistä suurista syöpätyypeistä - mukaan lukien maksasyöpä (HCC), sappitiehyen syöpä (CCA), haimasyöpä (PDAC), ruokatorven levyepiteelisoluista alkava syöpä (ESCC), mahasyöpä (GC) ja paksu- ja peräsuolisyöpä (CRC) - sekä ei-pahanlaatuisista kontrolliryhmistä. Pienten RNA-sekvensoinnin avulla saadaan korkearesoluutioiset kiertävän miRNA:n ilmentymisprofiilit.
Löytövaiheessa sovellamme tiukkaa esikäsittelyä, normalisointia, erän vaikutusten korjaamista ja differentiaalista ilmentymisanalyysiä tunnistaaksemme kiertävät miRNA:t, jotka liittyvät pahanlaatuiseen muutokseen eri suolistosyöpätyypeissä. Koneoppimiseen perustuvaa piirteiden valintaa (esim. LASSO, mRMR ja ensemble-valinta) ja luokittelijan rakentamista (esim. SVM, Random Forest, XGBoost) hyödynnetään sitten johtamaan minimaalinen ja robusti miRNA-paneeli, joka erottelee optimaalisesti syövän ei-syövästä.
Mallinnus- ja arviointivaiheessa tunnistettu miRNA-allekirjoitus käy läpi kansainvälisen monikeskuksen koulutuksen ja validoinnin, varmistaen toistettavuuden eri maantieteellisillä alueilla, sekvensointialustoilla ja kliinisillä demografioilla. Binäärisen luokittelun lisäksi arvioimme paneelin kykyä erotella erilaisia suolistosyöpäalatyypejä, tukien differentiaalidiagnoosia ja kasvainalkuperän päätelyä. Mallin suorituskykyä arvioidaan käyttämällä AUROC:ia, herkkyyttä kliinisesti relevanttien spesifisyysrajojen kohdalla, vaihekohtaista tunnistuskykyä (korostaen varhaisvaiheen kasvaimia) ja kalibrointia riippumattomissa kohorteissa.
Tämän peräkkäisen löytö → mallinnus → monikeskuksen validointiputken kautta pyrimme rakentamaan ei-invasiivisen kiertävän miRNA-paneelin, joka pystyy (1) tarkasti erottelemaan syöpäpotilaat ei-syöpäpotilaista ja (2) erottelemaan useita suolistosyöpätyyppejä, tarjoten siten kliinisesti skaalautuvän työkalun varhaiseen havaitsemiseen ja väestötasoiseseen seulontaan.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Junyong Weng, PhD
- Puhelinnumero: 06263151444
- Sähköposti: juweng@coh.org
Opiskelupaikat
-
-
California
-
Duarte, California, Yhdysvallat, 91010
- Rekrytointi
- City of Hope Nat Medical Ctr
-
Ottaa yhteyttä:
- Ajay Goel, PhD
- Puhelinnumero: 6263598111
- Sähköposti: ajgoel@coh.org
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Osallistumiskriteerit:
- Aikuiset, jotka ovat täyttäneet 18 vuotta verinäytteen ottamisen aikana.
- Potilaat, joilla on vahvistettu diagnoosi yhdestä seuraavista ruoansulatuskanavan syövistä: Maksasyöpä (HCC), Sappitietysyöpä (CCA), Haiman kanavan adenokarsinooma (PDAC), Ruokatorven levyepiteelisolu-karsinooma (ESCC), Mahasyöpä (GC), Paksu- ja peräsuolen syöpä (CRC), Ei-syöpäkontrolliosallistujat, mukaan lukien terveet vapaaehtoiset tai potilaat, joilla on hyvänlaatuisia ruoansulatuskanavan sairauksia.
- Retrospektiivisten verinäytteiden saatavuus, jotka on kerätty laitoksen protokollien mukaisesti.
- Halukkuus sallia tunnistetietojen poistettujen kliinisten ja demografisten tietojen käyttö tutkimustarkoituksiin.
Poissulkemiskriteerit:
- muut aktiiviset maligniteetit; riittämätön näytteen laatu/tilavuus; äskettäinen kemoterapia/sädehoito/leikkaus; mikä tahansa tila, joka estää luotettavan osallistumisen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Hepatosellulaarisen karsinooman kohortti
Potilaat, joilla on hepatosellulaariseen karsinoomaan (HCC) diagnosoitu, mikä on vahvistettu kliinisillä, kuvantamis- ja/tai histopatologisilla kriteereillä.
Verinäytteet kerätty retrospektiivisesti useista kansainvälisistä keskuksista.
|
|
Sappitiehisyöpäkohortti
Potilaat, joilla on kliinisesti ja/tai histopatologisesti varmistettu sappitiehyen syöpä (CCA), mukaan lukien intrahepaattiset ja extrahepaattiset alatypit.
Verinäytteet kerätty retrospektiivisesti useista kansainvälisistä keskuksista.
|
|
Pancreaattitien adenokarsinooma kohortti
Potilaat, joilla on haimatiehyen adenokarsinooma (PDAC) -diagnoosi, vahvistettu vakiintuneilla diagnoosikriteereillä.
Näytteet kerätty useista kansainvälisistä keskuksista.
|
|
Ruokatorven levyepiteelikarsinooma kohortti
Potilaat, joilla on diagnosoitu ruokatorven levyepiteelikarsinooma (ESCC).
Verinäytteet kerättiin retrospektiivisesti kansainvälisiltä yhteistyökeskuksilta.
|
|
Mahasyöpäkohortti
Potilaat, joilla on diagnosoitu mahasyöpä (GC), vahvistettu kliinisesti ja/tai histopatologisesti.
Näytteet kerätty useista kansainvälisistä keskuksista.
|
|
Paksu- ja peräsuolen syöpäkohortti
Potilaat, joilla on diagnosoitu paksu- ja peräsuolen syöpä (CRC), vahvistettu standardidiagnostisilla menetelmillä.
Verenäytteet kerätty retrospektiivisesti useista kansainvälisistä keskuksista.
|
|
Ei-syöpä / Terve kontrolliryhmä
Ei-syöpäpotilaat, mukaan lukien terveet vapaaehtoiset ja potilaat, joilla on hyvänlaatuisia ruoansulatuskanavan sairauksia.
Verenäytteet kerätty kansainvälisiltä keskuksilta ja yritetty sovittaa ikään ja sukupuoleen, jos mahdollista.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
miRNA-paneelin diagnostinen tarkkuus
Aikaikkuna: Perustasona (hoitoa edeltävästä verinäytteestä).
|
Herkkyys, spesifisyys ja receiver operating characteristic -käyrän alle jäävä pinta-ala (AUROC) erotettaessa GI-syöpäpotilaita ei-syöpäkontrolliryhmästä.
|
Perustasona (hoitoa edeltävästä verinäytteestä).
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Bray F, Laversanne M, Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Soerjomataram I, Jemal A. Global cancer statistics 2022: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin. 2024 May-Jun;74(3):229-263. doi: 10.3322/caac.21834. Epub 2024 Apr 4.
- Goddard KAB, Feuer EJ, Mandelblatt JS, Meza R, Holford TR, Jeon J, Lansdorp-Vogelaar I, Gulati R, Stout NK, Howlader N, Knudsen AB, Miller D, Caswell-Jin JL, Schechter CB, Etzioni R, Trentham-Dietz A, Kurian AW, Plevritis SK, Hampton JM, Stein S, Sun LP, Umar A, Castle PE. Estimation of Cancer Deaths Averted From Prevention, Screening, and Treatment Efforts, 1975-2020. JAMA Oncol. 2025 Feb 1;11(2):162-167. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5381.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Neoplasmat sivustoittain
- Neoplasmat
- Neoplasmat histologisen tyypin mukaan
- Ruoansulatuskanavan kasvaimet
- Ruoansulatuskanavan sairaudet
- Ruoansulatuskanavan sairaudet
- Vatsataudit
- Pään ja kaulan kasvaimet
- Maksasairaudet
- Kasvaimet, rauhas- ja epiteelikasvaimet
- Adenokarsinooma
- Maksan kasvaimet
- Ruokatorven sairaudet
- Karsinooma
- Kasvaimet, okasolusolut
- Karsinooma, okasolusolu
- Ruokatorven kasvaimet
- Ruokatorven okasolusyöpä
- Vatsan kasvaimet
- Karsinooma, hepatosellulaarinen
- Ruoansulatuskanavan kasvaimet
- Kolangiokarsinooma
Muut tutkimustunnusnumerot
- 23228/MiGIC
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .