Identifizierung prädiktiver epigenetischer Biomarker für den Schweregrad einer Lungenerkrankung bei Mukoviszidose (MethylBiomark)
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Zystische Fibrose (CF) ist eine autosomal rezessive Erkrankung, die auf Mutationen im CFTR-Gen zurückzuführen ist. CFTR kodiert für einen Chloridkanal, der hauptsächlich an der apikalen Membran von Epithelzellen exprimiert wird. Eine CFTR-Dysfunktion führt zu einer Schleimverdickung und verursacht zahlreiche Störungen in den Atemwegen, im Verdauungstrakt und im Fortpflanzungstrakt. Bei CF-Patienten ist eine Lungenerkrankung die Hauptursache für Morbidität und Mortalität, und ihr Schweregrad ist bei CF-Patienten unterschiedlich, selbst bei Patienten mit demselben Genotyp. Diese klinische Variabilität hängt von zwei Faktoren ab: genetischen (komplexe Allele des CFTR-Gens und Modifikatorgenen) und Umweltfaktoren. Genetische Faktoren wurden weitgehend erforscht und mehrere Modifikatorgene identifiziert. Im Gegensatz dazu sind Umweltfaktoren noch wenig bekannt. Es ist allgemein bekannt, dass Umweltfaktoren den Phänotyp verändern, indem sie auf epigenetische Merkmale (d. h. DNA-Methylierung, Histonmodifikation), die im Genom vorhanden sind. Epigenetische Modifikationen regulieren und modulieren die Genexpression.
In einer früheren Studie haben wir die genomweite DNA-Methylierung in Nasenepithelzellproben von 32 CF-Patienten und 24 gesunden Kontrollpersonen untersucht. CF-Patienten, die homozygot für die p.Phe508del-Mutation waren und > 18 Jahre alt waren, wurden nach der Schwere der Lungenerkrankung stratifiziert. Durch diese Studie haben wir 187 Genomregionen (CpG-Dinukleotide) identifiziert, die bei CF-Patienten mit leichter Lungenerkrankung und CF-Patienten mit schwerer Lungenerkrankung unterschiedlich methyliert sind. Das vorliegende Projekt zielt darauf ab, in diesen 187 Regionen prädiktive epigenetische Biomarker für den Schweregrad von Lungenerkrankungen zu identifizieren. Während die vorherige Studie an genomischer DNA durchgeführt wurde, die aus Nasenepithelzellen extrahiert wurde, werden wir im vorliegenden Projekt ein nicht-invasives Modell verwenden: spontanes Sputum.
Hypothese: Einige unterschiedlich methylierte Genomregionen zwischen leichten und schweren CF-Patienten können als prädiktive epigenetische Biomarker für die Schwere der Lungenerkrankung bei Mukoviszidose verwendet werden.
Ziele: (i) Identifizierung prädiktiver epigenetischer Biomarker für den Schweregrad einer Lungenerkrankung in den unterschiedlich methylierten Genomregionen zwischen leichten und schweren CF-Patienten, (ii) Charakterisierung eines nicht-invasiven Zellmodells, spontanem Sputum, für die Analyse epigenetischer Biomarker der Lunge Schweregrad der Erkrankung bei CF, (iii) um die Variationen in der DNA-Methylierung für denselben Patienten im Zeitverlauf zu analysieren (zum Zeitpunkt der Aufnahme 6 Monate, 12 Monate und 18 Monate)
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Phase
- Unzutreffend
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Montpellier, Frankreich, 34295
- Uhmontpellier
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Freie und informierte Einwilligung eingeholt und Einwilligung unterzeichnet
- Gegenstand, der von einem staatlichen Versicherungssystem abgedeckt wird
- Frauen und Männer im Alter von 12 bis 30 Jahren
- Von Mukoviszidose betroffenes Subjekt, Träger von zwei schweren Mutationen in trans (im selben Allel) im CFTR-Gen
- Proband, der in der Lage ist, vor und während der Studie eine Spirometrie durchzuführen
Ausschlusskriterien:
- Fach in einer Ausschlussfrist eines früheren Studiums
- Person, die unter gerichtlichem Schutz, Vormundschaft oder Aufsicht steht
- Unmöglichkeit, fundierte Informationen zum Thema zu geben
- Proband, der nicht fließend Französisch liest
- Schwangerschaft
- Stillen
- transplantiertes Subjekt
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Hauptzweck: Verhütung
- Zuteilung: N / A
- Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
- Maskierung: Keine (Offenes Etikett)
Waffen und Interventionen
Teilnehmergruppe / Arm |
Intervention / Behandlung |
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Sonstiges: CF-Patienten
CF-Patienten tragen einen spontanen Auswurf, der im Rahmen von Bronchialdrainagen im Rahmen der üblichen Pflege gebildet wird.
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CF-Patienten tragen spontan Sputum, das im Rahmen von Bronchialdrainagen im Rahmen der üblichen Pflege (Einschluss, 6 Monate, 12 Monate, 18 Monate) hergestellt wird. Die Sammlung des spontanen Sputums erfolgt im Rahmen der Bronchialdrainagen, die routinemäßig bei jedem Besuch durchgeführt werden. Der spontane Auswurf wird in einem sterilen Behälter gesammelt. Um eine Kontamination des Sputums mit bukkalen Epithelzellen zu vermeiden, werden die Patienten gebeten, vor dem Auswurf den Mund auszuspülen. |
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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DNA-Methylierung
Zeitfenster: zum Zeitpunkt der Aufnahme
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Spontaner Auswurf zu Studienbeginn
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zum Zeitpunkt der Aufnahme
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DNA-Methylierung
Zeitfenster: 6 Monate
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Spontaner Auswurf nach 6 Monaten
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6 Monate
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DNA-Methylierung
Zeitfenster: 12 Monate
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Spontaner Auswurf nach 12 Monaten
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12 Monate
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DNA-Methylierung
Zeitfenster: 18 Monate
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Spontaner Auswurf im Alter von 18 Monaten
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18 Monate
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: Davide CAIMMI, University Hospital, Montpellier
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
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Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Geschätzt)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
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Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
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